270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1767 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  47.12 
 
 		 728 aa  658    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  49.08 
 
 		 703 aa  678    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 722 aa  1492    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  50.42 
 
 		 716 aa  702    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  50.78 
 
 		 711 aa  684    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  77.75 
 
 		 714 aa  1167    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  49.79 
 
 		 726 aa  681    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  47.27 
 
 		 729 aa  662    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  50.28 
 
 		 699 aa  698    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  49.43 
 
 		 695 aa  706    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  46.27 
 
 		 697 aa  650    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  49.57 
 
 		 695 aa  711    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  48.93 
 
 		 697 aa  691    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  49.72 
 
 		 723 aa  688    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  87.06 
 
 		 712 aa  1306    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  84.84 
 
 		 727 aa  1289    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  48.8 
 
 		 723 aa  668    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  85.43 
 
 		 714 aa  1295    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  49.72 
 
 		 726 aa  684    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  49.44 
 
 		 722 aa  691    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  51.04 
 
 		 721 aa  722    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  48.95 
 
 		 717 aa  679    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  49.93 
 
 		 723 aa  698    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  48.61 
 
 		 728 aa  690    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  48.52 
 
 		 695 aa  691    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  48.72 
 
 		 696 aa  665    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  46.81 
 
 		 729 aa  657    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  46.74 
 
 		 729 aa  645    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  50.43 
 
 		 718 aa  706    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  47.14 
 
 		 721 aa  650    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  49.86 
 
 		 727 aa  688    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  47.31 
 
 		 724 aa  652    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  47.3 
 
 		 706 aa  639    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  47.81 
 
 		 732 aa  687    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  50.56 
 
 		 730 aa  685    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  77.45 
 
 		 713 aa  1159    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  45.97 
 
 		 723 aa  645    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  48.79 
 
 		 702 aa  689    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  48.23 
 
 		 695 aa  691    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  88.52 
 
 		 714 aa  1332    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  52.04 
 
 		 734 aa  735    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  49.5 
 
 		 725 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  48.54 
 
 		 733 aa  665    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  49.01 
 
 		 726 aa  697    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  49.44 
 
 		 695 aa  698    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  47.81 
 
 		 697 aa  664    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  49.09 
 
 		 727 aa  668    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  50.14 
 
 		 723 aa  685    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  51.34 
 
 		 697 aa  706    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  50.48 
 
 		 705 aa  705    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  51.41 
 
 		 701 aa  710    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  48.43 
 
 		 725 aa  671    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  46.18 
 
 		 724 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  45.82 
 
 		 730 aa  631  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  46 
 
 		 697 aa  627  1e-178  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  45.58 
 
 		 724 aa  628  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  42.86 
 
 		 702 aa  592  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  43.18 
 
 		 699 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  40.93 
 
 		 676 aa  543  1e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  39.32 
 
 		 688 aa  511  1e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  37.72 
 
 		 688 aa  450  1e-125  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  37.59 
 
 		 716 aa  443  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  39.58 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2657  glutamine synthetase catalytic region  33.93 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2715  glutamine synthetase, catalytic region  39.58 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.846118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  29.25 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  26.97 
 
 		 431 aa  63.2  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  25.52 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  34.23 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  25.11 
 
 		 461 aa  60.1  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  32.41 
 
 		 450 aa  60.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  30 
 
 		 433 aa  60.5  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  28.32 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1141  glutamine synthetase catalytic region  35.42 
 
 		 473 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  27.93 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  30.52 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3142  L-glutamine synthetase  37.38 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  28.98 
 
 		 454 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  28.39 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  27.06 
 
 		 439 aa  55.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  27.57 
 
 		 443 aa  55.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  26.29 
 
 		 469 aa  55.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  32.99 
 
 		 444 aa  55.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3319  glutamine synthetase, catalytic region  31.52 
 
 		 453 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537812  normal  0.0587304 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  30.77 
 
 		 444 aa  54.7  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  30.97 
 
 		 455 aa  54.3  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  29.82 
 
 		 442 aa  54.3  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  29.66 
 
 		 461 aa  54.3  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  31.61 
 
 		 444 aa  53.9  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  27.84 
 
 		 454 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  27.84 
 
 		 454 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  34.12 
 
 		 443 aa  53.9  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  27.84 
 
 		 454 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  30.19 
 
 		 454 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  27.84 
 
 		 459 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  34.29 
 
 		 447 aa  53.9  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  32.11 
 
 		 444 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  36.78 
 
 		 445 aa  53.5  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09391  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  27.32 
 
 		 473 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  27.81 
 
 		 458 aa  53.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>