275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1521 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  46.21 
 
 		 729 aa  646    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  84.31 
 
 		 713 aa  1279    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  51 
 
 		 730 aa  701    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  50.56 
 
 		 727 aa  717    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  49.29 
 
 		 722 aa  697    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  47.87 
 
 		 703 aa  684    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  49.71 
 
 		 721 aa  687    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  50.28 
 
 		 697 aa  710    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  47.73 
 
 		 730 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  49.02 
 
 		 723 aa  672    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  50 
 
 		 716 aa  698    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  77.04 
 
 		 727 aa  1166    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  77.75 
 
 		 722 aa  1167    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  74.51 
 
 		 714 aa  1130    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  50.64 
 
 		 726 aa  702    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  49.09 
 
 		 696 aa  669    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  50.29 
 
 		 723 aa  698    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  50.42 
 
 		 702 aa  705    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  48.13 
 
 		 733 aa  684    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  47.38 
 
 		 697 aa  664    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  46.95 
 
 		 697 aa  656    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  49.72 
 
 		 725 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  47.65 
 
 		 729 aa  666    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  77.75 
 
 		 712 aa  1165    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  50.35 
 
 		 718 aa  707    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  50.36 
 
 		 711 aa  683    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  54.07 
 
 		 734 aa  750    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  46.07 
 
 		 724 aa  640    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  47.67 
 
 		 724 aa  659    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  52.48 
 
 		 723 aa  706    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  50 
 
 		 721 aa  702    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  48.94 
 
 		 695 aa  692    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  48.4 
 
 		 727 aa  658    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  46.31 
 
 		 729 aa  646    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  51.93 
 
 		 695 aa  725    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 714 aa  1470    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  50.93 
 
 		 695 aa  715    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  79.15 
 
 		 714 aa  1186    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  52.07 
 
 		 695 aa  726    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  48.15 
 
 		 695 aa  686    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  50.64 
 
 		 723 aa  711    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  51.13 
 
 		 725 aa  713    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  47.88 
 
 		 699 aa  684    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  50.28 
 
 		 726 aa  716    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  48.52 
 
 		 728 aa  682    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  47.26 
 
 		 728 aa  655    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  47.08 
 
 		 732 aa  679    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  50.85 
 
 		 726 aa  706    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  50.42 
 
 		 697 aa  701    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  48.86 
 
 		 723 aa  679    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  50.42 
 
 		 705 aa  704    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  51.41 
 
 		 701 aa  716    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  49.79 
 
 		 717 aa  688    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  46.57 
 
 		 706 aa  635  1e-180  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  46.18 
 
 		 697 aa  634  1e-180  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  45.17 
 
 		 724 aa  627  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  43.86 
 
 		 702 aa  598  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  44.68 
 
 		 699 aa  588  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  40.17 
 
 		 676 aa  531  1e-149  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  38.12 
 
 		 688 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  36.57 
 
 		 688 aa  442  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  36.61 
 
 		 716 aa  441  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  27.68 
 
 		 431 aa  66.6  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2715  glutamine synthetase, catalytic region  38.38 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.846118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2657  glutamine synthetase catalytic region  35.14 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  28.8 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  36.45 
 
 		 476 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  27.53 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  26.17 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  30 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  29.89 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1141  glutamine synthetase catalytic region  33.33 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  25.85 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  30.59 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  29.89 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  34.26 
 
 		 442 aa  57  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  32.69 
 
 		 445 aa  57.4  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3142  L-glutamine synthetase  35.58 
 
 		 475 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  26.69 
 
 		 469 aa  55.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  26.6 
 
 		 439 aa  55.5  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  27.87 
 
 		 469 aa  55.1  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  34.34 
 
 		 444 aa  54.7  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2467  glutamine synthetase catalytic region  27.84 
 
 		 422 aa  53.9  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  25.24 
 
 		 439 aa  53.5  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  29.66 
 
 		 447 aa  53.9  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  36.36 
 
 		 444 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  29.73 
 
 		 473 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  27.72 
 
 		 441 aa  53.5  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09391  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  29.73 
 
 		 473 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  30 
 
 		 455 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0141  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  30.27 
 
 		 473 aa  53.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1205  L-glutamine synthetase  30.27 
 
 		 473 aa  52.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.488763  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  30.77 
 
 		 446 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3319  glutamine synthetase, catalytic region  30.07 
 
 		 453 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537812  normal  0.0587304 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  31.25 
 
 		 446 aa  52.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4462  glutamine synthetase, type I  27.71 
 
 		 468 aa  52.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0756731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09401  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  29.73 
 
 		 473 aa  53.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256855  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10031  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  28.96 
 
 		 473 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.913163  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07731  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  30.27 
 
 		 473 aa  53.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0667695 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  31.36 
 
 		 443 aa  52  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>