More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0141 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1839  glutamine synthetase, type I  67.73 
 
 		 471 aa  672    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10031  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  86.89 
 
 		 473 aa  877    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.913163  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09391  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  87.32 
 
 		 473 aa  882    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10271  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  89.01 
 
 		 473 aa  888    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.18298 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0141  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 473 aa  984    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  64.06 
 
 		 474 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1265  glutamine synthetase type I  86.47 
 
 		 473 aa  874    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1205  L-glutamine synthetase  86.05 
 
 		 473 aa  875    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.488763  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16421  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  87.95 
 
 		 473 aa  883    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  87.32 
 
 		 473 aa  880    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  67.3 
 
 		 473 aa  687    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07731  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  99.58 
 
 		 473 aa  981    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0667695 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09401  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  87.53 
 
 		 473 aa  883    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256855  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  67.51 
 
 		 473 aa  686    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3834  L-glutamine synthetase  65.4 
 
 		 473 aa  668    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0808  glutamine synthetase, type I  66.67 
 
 		 473 aa  683    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3715  glutamine synthetase, type I  64.5 
 
 		 477 aa  649    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0837  glutamine synthetase, type I  66.67 
 
 		 473 aa  683    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  58.14 
 
 		 473 aa  587  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1770  glutamine synthetase, type I  57.29 
 
 		 474 aa  587  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3142  L-glutamine synthetase  57.29 
 
 		 474 aa  584  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3102  glutamine synthetase, type I  58.23 
 
 		 474 aa  585  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0143892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  58.65 
 
 		 474 aa  587  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13400  L-glutamine synthetase  57.2 
 
 		 474 aa  580  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0496712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2299  L-glutamine synthetase  56.93 
 
 		 475 aa  580  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00444261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4318  glutamine synthetase, type I  56.75 
 
 		 476 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0243  glutamine synthetase, type I  58.05 
 
 		 475 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.823516  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  56.54 
 
 		 474 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1262  glutamine synthetase, type I  56.96 
 
 		 474 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0975496  normal  0.0997444 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0923  L-glutamine synthetase  57.17 
 
 		 474 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1594  glutamine synthetase, type I  56.57 
 
 		 474 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000352701 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07500  L-glutamine synthetase  57.38 
 
 		 474 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2038  glutamine synthetase, type I  56.24 
 
 		 474 aa  571  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512125  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15370  L-glutamine synthetase  56.66 
 
 		 474 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1600  L-glutamine synthetase  56.36 
 
 		 474 aa  571  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1891  glutamine synthetase, type I  57.42 
 
 		 472 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198707  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1443  glutamine synthetase, type I  55.67 
 
 		 483 aa  568  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0199962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  57.11 
 
 		 470 aa  569  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0932  glutamine synthetase, type I  56.45 
 
 		 474 aa  568  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.017954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  57.17 
 
 		 470 aa  567  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  56.17 
 
 		 474 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  57.78 
 
 		 469 aa  565  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1855  glutamine synthetase, type I  56.87 
 
 		 474 aa  567  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.636307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3315  glutamine synthetase, type I  57.91 
 
 		 469 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651786  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2983  glutamine synthetase, type I  56.54 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  57.78 
 
 		 469 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  57.36 
 
 		 469 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  56.48 
 
 		 470 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  55.96 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  55.96 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3585  glutamine synthetase, type I  57.36 
 
 		 471 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1901  glutamine synthetase, type I  56.12 
 
 		 474 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.624126  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3291  glutamine synthetase, type I  55.81 
 
 		 474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0215954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  55.96 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2295  L-glutamine synthetase  54.33 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7410  glutamine synthetase, type I  56.66 
 
 		 474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3383  glutamine synthetase, type I  55.3 
 
 		 475 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129415  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  57.48 
 
 		 469 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  57.69 
 
 		 469 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2112  glutamine synthetase, type I  55.91 
 
 		 474 aa  558  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0742231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  56.84 
 
 		 469 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0427  glutamine synthetase, type I  57.78 
 
 		 469 aa  555  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  57.26 
 
 		 469 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  57.48 
 
 		 469 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16500  L-glutamine synthetase  56.21 
 
 		 476 aa  557  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.399242  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  57.26 
 
 		 469 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  56.84 
 
 		 469 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1216  glutamine synthetase, type I  57.57 
 
 		 469 aa  556  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12249  glutamine synthetase glnA1  56 
 
 		 478 aa  549  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.465808  normal  0.443746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1484  glutamine synthetase, type I  54.55 
 
 		 474 aa  550  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.836953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1255  glutamine synthetase, type I  56.69 
 
 		 471 aa  548  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.027099  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  55.79 
 
 		 469 aa  549  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0828  glutamine synthetase  56.36 
 
 		 478 aa  545  1e-154  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2375  glutamine synthetase  55.56 
 
 		 469 aa  547  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2059  glutamine synthetase, type I  55.41 
 
 		 471 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1481  glutamine synthetase, type I  56.05 
 
 		 471 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.494323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0925  glutamine synthetase, type I  54.22 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1736  glutamine synthetase, type I  55.32 
 
 		 469 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.654979  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1122  glutamine synthetase, type I  55.84 
 
 		 471 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744153  normal  0.286491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1920  glutamine synthetase, type I  55.32 
 
 		 469 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1482  glutamine synthetase, type I  56.9 
 
 		 486 aa  545  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.140298 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1628  glutamine synthetase, type I  53.8 
 
 		 473 aa  544  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0886  glutamine synthetase protein  53.83 
 
 		 491 aa  541  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0716545  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1743  glutamine synthetase, type I  55.63 
 
 		 471 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0103435  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2167  glutamine synthetase, type I  55.41 
 
 		 471 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2634  glutamine synthetase, type I  55.63 
 
 		 471 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675717  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2253  glutamine synthetase, type I  55.63 
 
 		 471 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2770  glutamine synthetase, type I  55.63 
 
 		 471 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1524  glutamine synthetase, type I  55.63 
 
 		 471 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2615  glutamine synthetase, type I  55.41 
 
 		 471 aa  541  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0119922  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3067  glutamine synthetase, type I  55.63 
 
 		 471 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2979  glutamine synthetase, type I  54.78 
 
 		 471 aa  544  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1807  L-glutamine synthetase  54.56 
 
 		 471 aa  542  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000345989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4896  glutamine synthetase type I  55.3 
 
 		 479 aa  542  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5928  glutamine synthetase, type I  55.41 
 
 		 471 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  54.7 
 
 		 469 aa  542  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2186  glutamine synthetase, type I  55.2 
 
 		 471 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179605  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2149  glutamine synthetase, type I  55.41 
 
 		 471 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0683  glutamine synthetase, type I  55.32 
 
 		 473 aa  544  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2690  glutamine synthetase, type I  55.63 
 
 		 471 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>