More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2086 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0427  glutamine synthetase, type I  66.24 
 
 		 469 aa  639    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1736  glutamine synthetase, type I  67.74 
 
 		 469 aa  675    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.654979  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  65.24 
 
 		 469 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  66.52 
 
 		 469 aa  653    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  66.74 
 
 		 469 aa  670    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3315  glutamine synthetase, type I  67.74 
 
 		 469 aa  669    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651786  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  67.16 
 
 		 469 aa  655    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2375  glutamine synthetase  66.74 
 
 		 469 aa  677    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1216  glutamine synthetase, type I  68.59 
 
 		 469 aa  659    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0626  glutamine synthetase, type I  65.95 
 
 		 471 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1344  glutamine synthetase, type I  63.97 
 
 		 469 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  68.66 
 
 		 469 aa  673    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3585  glutamine synthetase, type I  66.67 
 
 		 471 aa  655    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2652  glutamine synthetase type I  64.67 
 
 		 469 aa  638    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127344  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0466  glutamine synthetase, type I  65.95 
 
 		 471 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0147  L-glutamine synthetase  64.18 
 
 		 469 aa  638    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0281822  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4831  L-glutamine synthetase  66.67 
 
 		 470 aa  663    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  68.25 
 
 		 470 aa  662    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2087  glutamine synthetase, type I  67.38 
 
 		 469 aa  671    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 469 aa  973    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  66.88 
 
 		 469 aa  664    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1108  L-glutamine synthetase  65.03 
 
 		 469 aa  653    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0181625  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  67.17 
 
 		 470 aa  653    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1515  L-glutamine synthetase  67.38 
 
 		 468 aa  669    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0502  L-glutamine synthetase  66.09 
 
 		 468 aa  648    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  67.31 
 
 		 469 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1482  glutamine synthetase, type I  71.46 
 
 		 486 aa  722    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.140298 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  67.74 
 
 		 469 aa  670    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0243  L-glutamine synthetase  65.95 
 
 		 469 aa  639    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  67.95 
 
 		 469 aa  666    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1022  L-glutamine synthetase  67.39 
 
 		 468 aa  666    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0149  glutamine synthetase, type I  69.83 
 
 		 470 aa  693    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  67.16 
 
 		 469 aa  675    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1544  L-glutamine synthetase  66.95 
 
 		 469 aa  668    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1920  glutamine synthetase, type I  67.52 
 
 		 469 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  66.52 
 
 		 469 aa  655    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3244  glutamine synthetase, type I  68.87 
 
 		 468 aa  678    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1330  L-glutamine synthetase  67.38 
 
 		 467 aa  667    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.523028  normal  0.654119 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3057  glutamine synthetase, type I  72.53 
 
 		 477 aa  731    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  66.81 
 
 		 473 aa  657    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0970  glutamine synthetase, type I  66.74 
 
 		 469 aa  670    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.545228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  66.88 
 
 		 469 aa  661    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4462  glutamine synthetase, type I  66.09 
 
 		 468 aa  652    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0756731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  66.31 
 
 		 469 aa  651    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  67.16 
 
 		 469 aa  655    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1839  glutamine synthetase  67.03 
 
 		 468 aa  668    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.724651  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1780  glutamine synthetase, type I  64.18 
 
 		 469 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01591  glutamine synthetase  64.67 
 
 		 469 aa  633  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5458  L-glutamine synthetase  63.17 
 
 		 471 aa  631  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0733  glutamine synthetase, type I  63.11 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.02678  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5928  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2167  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2149  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1258  glutamine synthetase protein  63.17 
 
 		 471 aa  630  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1122  glutamine synthetase, type I  62.53 
 
 		 471 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744153  normal  0.286491 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2057  L-glutamine synthetase  63.17 
 
 		 471 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.648979  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1086  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3259  glutamine synthetase, type I  64.87 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1807  L-glutamine synthetase  64.24 
 
 		 471 aa  628  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000345989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2062  L-glutamine synthetase  63.38 
 
 		 471 aa  628  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00147579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2615  glutamine synthetase, type I  62.31 
 
 		 471 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0119922  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2577  glutamine synthetase, type I  64.01 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2186  glutamine synthetase, type I  62.53 
 
 		 471 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179605  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1179  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2059  glutamine synthetase, type I  62.53 
 
 		 471 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3581  glutamine synthetase, type I  63.38 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1743  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0103435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2770  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2253  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2634  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675717  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1844  glutamine synthetase, type I  62.53 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.43293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2690  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  62.1 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1522  L-glutamine synthetase  62.31 
 
 		 471 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000686427  normal  0.138561 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1481  glutamine synthetase, type I  62.1 
 
 		 471 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.494323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1524  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3067  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1255  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  622  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.027099  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4156  glutamine synthetase  62.96 
 
 		 469 aa  621  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35339  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0209  glutamine synthetase, type I  63.81 
 
 		 469 aa  624  1e-177  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1025  glutamine synthetase  63.6 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0697  glutamine synthetase, type I  63.17 
 
 		 471 aa  622  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.817374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2780  glutamine synthetase, type I  63.81 
 
 		 471 aa  624  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481689  hitchhiker  0.00799964 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2076  L-glutamine synthetase  62.74 
 
 		 472 aa  620  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943231  normal  0.983586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0736  glutamine synthetase, type I  63.85 
 
 		 468 aa  619  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00218328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3648  glutamine synthetase, type I  63.25 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.663211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0013  L-glutamine synthetase  62.72 
 
 		 471 aa  619  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778405 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1582  glutamine synthetase, type I  62.66 
 
 		 471 aa  614  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1632  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2503  L-glutamine synthetase  63.38 
 
 		 469 aa  614  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00588  glutamine synthetase  62.53 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  62.93 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001905  glutamine synthetase type I  62.53 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.168817  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0027  glutamine synthetase  62.93 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4189  glutamine synthetase  62.93 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0769  glutamine synthetase, type I  63.52 
 
 		 467 aa  617  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1442  L-glutamine synthetase  63.17 
 
 		 471 aa  614  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  62.93 
 
 		 469 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3154  glutamine synthetase, type I  62.74 
 
 		 471 aa  613  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2979  glutamine synthetase, type I  62.53 
 
 		 471 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>