More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1022 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3315  glutamine synthetase, type I  67.32 
 
 		 469 aa  664    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651786  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0970  glutamine synthetase, type I  65.01 
 
 		 469 aa  657    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.545228  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  65.01 
 
 		 469 aa  657    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1839  glutamine synthetase  88.46 
 
 		 468 aa  879    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.724651  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1482  glutamine synthetase, type I  65.87 
 
 		 486 aa  657    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.140298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3244  glutamine synthetase, type I  67.24 
 
 		 468 aa  679    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  66.67 
 
 		 469 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  68.18 
 
 		 469 aa  671    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  67.1 
 
 		 469 aa  663    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0147  L-glutamine synthetase  83.8 
 
 		 469 aa  831    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0281822  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1216  glutamine synthetase, type I  66.45 
 
 		 469 aa  635    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2087  glutamine synthetase, type I  66.09 
 
 		 469 aa  664    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  66.95 
 
 		 470 aa  659    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  67.39 
 
 		 469 aa  666    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  67.32 
 
 		 469 aa  663    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2375  glutamine synthetase  66.52 
 
 		 469 aa  667    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  66.67 
 
 		 469 aa  658    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1108  L-glutamine synthetase  64.94 
 
 		 469 aa  636    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0181625  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3585  glutamine synthetase, type I  67.82 
 
 		 471 aa  667    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  66.31 
 
 		 470 aa  653    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1515  L-glutamine synthetase  86.97 
 
 		 468 aa  860    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  66.67 
 
 		 469 aa  655    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  66.23 
 
 		 469 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  67.32 
 
 		 469 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  67.97 
 
 		 469 aa  664    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1022  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 468 aa  975    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0149  glutamine synthetase, type I  65.15 
 
 		 470 aa  650    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1544  L-glutamine synthetase  65.66 
 
 		 469 aa  662    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  66.95 
 
 		 469 aa  673    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1330  L-glutamine synthetase  67.31 
 
 		 467 aa  673    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.523028  normal  0.654119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1736  glutamine synthetase, type I  66.52 
 
 		 469 aa  666    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.654979  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1344  glutamine synthetase, type I  83.58 
 
 		 469 aa  828    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1780  glutamine synthetase, type I  83.8 
 
 		 469 aa  831    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3057  glutamine synthetase, type I  66.52 
 
 		 477 aa  658    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4462  glutamine synthetase, type I  80.34 
 
 		 468 aa  806    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0756731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  66.67 
 
 		 469 aa  655    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1920  glutamine synthetase, type I  66.31 
 
 		 469 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  64.36 
 
 		 469 aa  631  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  62.58 
 
 		 473 aa  632  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0733  glutamine synthetase, type I  61.97 
 
 		 469 aa  628  1e-179  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.02678  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4831  L-glutamine synthetase  64.29 
 
 		 470 aa  630  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01591  glutamine synthetase  62.39 
 
 		 469 aa  622  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1025  glutamine synthetase  60.98 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0427  glutamine synthetase, type I  65.37 
 
 		 469 aa  622  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0626  glutamine synthetase, type I  61.85 
 
 		 471 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0466  glutamine synthetase, type I  61.85 
 
 		 471 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3454  glutamine synthetase  62.05 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00170098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3959  glutamine synthetase  60.98 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  60.13 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  59.91 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  59.91 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4346  glutamine synthetase  59.91 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4410  glutamine synthetase  62.05 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  60.13 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4189  glutamine synthetase  60.13 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  59.91 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4220  glutamine synthetase  60.55 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4335  glutamine synthetase  60.13 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4156  glutamine synthetase  60.13 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35339  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  59.91 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  59.91 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  59.91 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0027  glutamine synthetase  60.13 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0412  glutamine synthetase  62.05 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  60.13 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  60.13 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  60.13 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03704  hypothetical protein  59.91 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0305  glutamine synthetase  61.83 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3719  glutamine synthetase  61.83 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.606524  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5316  glutamine synthetase  59.91 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.961991  normal  0.126376 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0325  glutamine synthetase  62.47 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000686666  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00588  glutamine synthetase  59.91 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0300  glutamine synthetase  61.62 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.114886  hitchhiker  0.00271616 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  60.13 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1645  glutamine synthetase, type I  60.81 
 
 		 469 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.356376  normal  0.294461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0400  glutamine synthetase  61.51 
 
 		 468 aa  611  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0641467  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0311  glutamine synthetase  61.83 
 
 		 469 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4503  glutamine synthetase  60.34 
 
 		 469 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0307  glutamine synthetase  61.83 
 
 		 469 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2652  glutamine synthetase type I  60.68 
 
 		 469 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127344  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  60.13 
 
 		 469 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4881  glutamine synthetase  59.91 
 
 		 469 aa  612  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567284  hitchhiker  0.000124189 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0311  glutamine synthetase  61.83 
 
 		 469 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0306  glutamine synthetase  61.83 
 
 		 469 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001905  glutamine synthetase type I  59.7 
 
 		 469 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.168817  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3416  glutamine synthetase  61.83 
 
 		 469 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1632  glutamine synthetase, type I  62.85 
 
 		 471 aa  608  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0769  glutamine synthetase, type I  60.55 
 
 		 467 aa  609  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2940  glutamine synthetase  59.28 
 
 		 469 aa  609  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0975  L-glutamine synthetase  60.81 
 
 		 469 aa  605  9.999999999999999e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.85428  hitchhiker  0.000890816 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0502  L-glutamine synthetase  60.13 
 
 		 468 aa  606  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45850  glutamine synthetase, type I; GlnA  60.34 
 
 		 467 aa  603  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3154  glutamine synthetase, type I  60.99 
 
 		 471 aa  601  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2076  L-glutamine synthetase  61.34 
 
 		 472 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943231  normal  0.983586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4643  glutamine synthetase  61.54 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3554  glutamine synthetase  60.77 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0243  L-glutamine synthetase  59.53 
 
 		 469 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1440  glutamine synthetase, type I  60.17 
 
 		 469 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00931108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5853  glutamine synthetase  60.91 
 
 		 469 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>