More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3142 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  65.4 
 
 
476 aa  680    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1141  glutamine synthetase catalytic region  66.31 
 
 
473 aa  676    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3142  L-glutamine synthetase  100 
 
 
475 aa  992    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2657  glutamine synthetase catalytic region  65.89 
 
 
474 aa  689    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2715  glutamine synthetase, catalytic region  65.4 
 
 
476 aa  680    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.846118  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  37.06 
 
 
444 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  38.21 
 
 
447 aa  228  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  37.08 
 
 
444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  37.08 
 
 
444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  37.08 
 
 
444 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  37.08 
 
 
444 aa  226  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  37.08 
 
 
444 aa  226  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  37.08 
 
 
444 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  37.08 
 
 
444 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  34.37 
 
 
441 aa  226  8e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  37.08 
 
 
444 aa  226  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  36.83 
 
 
444 aa  226  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  36.83 
 
 
444 aa  226  9e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  35.59 
 
 
444 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  34.19 
 
 
446 aa  224  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  34.18 
 
 
446 aa  223  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  34.18 
 
 
446 aa  223  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  34.34 
 
 
447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  35.09 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  35.11 
 
 
445 aa  217  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  34.35 
 
 
443 aa  217  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  37.29 
 
 
445 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  36.2 
 
 
444 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  36.67 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  33.8 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  35.33 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  33.84 
 
 
461 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  34.33 
 
 
447 aa  213  5.999999999999999e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  37.23 
 
 
444 aa  213  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  35.97 
 
 
444 aa  212  9e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  35.28 
 
 
443 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  34.78 
 
 
446 aa  211  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  32.21 
 
 
446 aa  210  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  32.5 
 
 
442 aa  210  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  32.95 
 
 
444 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  33.25 
 
 
452 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  31.95 
 
 
442 aa  206  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  34.47 
 
 
439 aa  205  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  33.16 
 
 
442 aa  204  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  32.05 
 
 
456 aa  204  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  30.38 
 
 
439 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  33.25 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  32.73 
 
 
449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  31.92 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  32.82 
 
 
448 aa  201  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  32.48 
 
 
443 aa  201  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  31.22 
 
 
437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  31.1 
 
 
439 aa  200  6e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  34.13 
 
 
441 aa  199  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  31.31 
 
 
448 aa  199  9e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  30.58 
 
 
442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  32.37 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  34.02 
 
 
433 aa  197  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  34.69 
 
 
439 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 
447 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  33.51 
 
 
449 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  32.98 
 
 
447 aa  196  6e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  33.76 
 
 
443 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  32.63 
 
 
447 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  31.26 
 
 
442 aa  195  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  31.78 
 
 
445 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  33.07 
 
 
443 aa  193  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  31.07 
 
 
443 aa  193  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  30.88 
 
 
450 aa  193  7e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  32.51 
 
 
443 aa  192  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  34.5 
 
 
452 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  33.72 
 
 
444 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  34.56 
 
 
443 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  30.55 
 
 
441 aa  190  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  33.7 
 
 
444 aa  189  7e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  31.21 
 
 
448 aa  189  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  34.29 
 
 
443 aa  187  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  31.56 
 
 
453 aa  187  5e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  32.52 
 
 
443 aa  186  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  32.43 
 
 
444 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  32.96 
 
 
448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  31.74 
 
 
443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  29.95 
 
 
448 aa  182  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  28.64 
 
 
446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  33.24 
 
 
453 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  29.77 
 
 
445 aa  179  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1612  L-glutamine synthetase  34.53 
 
 
470 aa  177  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  30.75 
 
 
456 aa  177  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  33.73 
 
 
451 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  30.42 
 
 
451 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  32.26 
 
 
445 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  31.36 
 
 
450 aa  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  32.93 
 
 
451 aa  176  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7410  glutamine synthetase, type I  33.82 
 
 
474 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1341  glutamine synthetase, type I  34.04 
 
 
471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0145067  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  29.22 
 
 
445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  29.43 
 
 
445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0923  L-glutamine synthetase  33.25 
 
 
474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  32.23 
 
 
455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2295  L-glutamine synthetase  34.35 
 
 
474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>