More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1123 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  100 
 
 		 443 aa  919    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  94.36 
 
 		 443 aa  882    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  96.61 
 
 		 443 aa  895    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  64.52 
 
 		 444 aa  600  1e-170  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  61.98 
 
 		 448 aa  586  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  62.47 
 
 		 446 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  60.32 
 
 		 443 aa  571  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  58.76 
 
 		 448 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  58.99 
 
 		 447 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  58.53 
 
 		 447 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  57.83 
 
 		 449 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  57.27 
 
 		 450 aa  549  1e-155  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  57.47 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  57.21 
 
 		 443 aa  534  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2016  glutamine synthetase, type I  56.15 
 
 		 447 aa  508  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  hitchhiker  0.0000000000000396297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  55.58 
 
 		 453 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  54.09 
 
 		 445 aa  504  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  55 
 
 		 445 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  53.02 
 
 		 452 aa  498  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  54.3 
 
 		 447 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  54.88 
 
 		 446 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  54.42 
 
 		 446 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  53.18 
 
 		 445 aa  488  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  53.64 
 
 		 445 aa  491  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  52.95 
 
 		 455 aa  488  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  53.12 
 
 		 453 aa  490  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  54.69 
 
 		 453 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  52.13 
 
 		 452 aa  487  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  55.13 
 
 		 453 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  53.51 
 
 		 449 aa  488  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  52.55 
 
 		 453 aa  481  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  52.81 
 
 		 450 aa  482  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  52.49 
 
 		 447 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  53.35 
 
 		 453 aa  480  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  52.02 
 
 		 443 aa  481  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  53.64 
 
 		 445 aa  480  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  54.65 
 
 		 446 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  52.27 
 
 		 445 aa  478  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  52.39 
 
 		 445 aa  478  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12251  glutamine synthetase glnA2  53.29 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  54.3 
 
 		 446 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  52.38 
 
 		 446 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  52.49 
 
 		 444 aa  472  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  53.74 
 
 		 446 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  53.74 
 
 		 446 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  53.74 
 
 		 446 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  51.36 
 
 		 444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  51.49 
 
 		 444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  52.62 
 
 		 444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  52.85 
 
 		 444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3262  glutamine synthetase catalytic region  52.15 
 
 		 446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216944  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3089  glutamine synthetase catalytic region  53.29 
 
 		 450 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  52.94 
 
 		 447 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  51.14 
 
 		 444 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  51.6 
 
 		 446 aa  468  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  50.23 
 
 		 444 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  50.34 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  50.11 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  49.66 
 
 		 447 aa  463  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  50.11 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  51.35 
 
 		 451 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  50.68 
 
 		 444 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  51.12 
 
 		 451 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  50.34 
 
 		 443 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  50.11 
 
 		 443 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  51.36 
 
 		 442 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  50.11 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  49.09 
 
 		 442 aa  455  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  50.57 
 
 		 456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  49.44 
 
 		 445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  51.51 
 
 		 451 aa  451  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  52.15 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  50.68 
 
 		 456 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  48.3 
 
 		 461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  50.11 
 
 		 442 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 		 443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  51.61 
 
 		 444 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08250  L-glutamine synthetase  50.68 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.235557  normal  0.967917 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  49.09 
 
 		 444 aa  449  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  50 
 
 		 446 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  49.09 
 
 		 444 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  49.09 
 
 		 444 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  49.09 
 
 		 444 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  49.55 
 
 		 441 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  49.09 
 
 		 444 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  50.23 
 
 		 443 aa  451  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  49.09 
 
 		 444 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  48.74 
 
 		 440 aa  450  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  50.23 
 
 		 439 aa  450  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  51.76 
 
 		 442 aa  448  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  48.86 
 
 		 444 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  52.05 
 
 		 451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  48.64 
 
 		 444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  48.64 
 
 		 444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  50.58 
 
 		 439 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  48.64 
 
 		 444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  48.86 
 
 		 444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  49.08 
 
 		 449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  50.23 
 
 		 444 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  47.82 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>