More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1112 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  68.21 
 
 		 453 aa  642    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  68.31 
 
 		 445 aa  667    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  72.36 
 
 		 444 aa  689    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  68.65 
 
 		 453 aa  656    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  68.87 
 
 		 453 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  100 
 
 		 445 aa  927    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  68.65 
 
 		 453 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  68.87 
 
 		 453 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  69.57 
 
 		 447 aa  670    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  73.59 
 
 		 445 aa  706    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  73.76 
 
 		 445 aa  705    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  68.85 
 
 		 446 aa  659    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  69.07 
 
 		 446 aa  660    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  67.64 
 
 		 445 aa  641    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  89.44 
 
 		 445 aa  845    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  71.97 
 
 		 444 aa  689    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  66.44 
 
 		 453 aa  634  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  65.25 
 
 		 446 aa  627  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  64.72 
 
 		 455 aa  625  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  63.45 
 
 		 446 aa  605  9.999999999999999e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  64.81 
 
 		 451 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  64.37 
 
 		 451 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  62.64 
 
 		 447 aa  588  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  61.97 
 
 		 447 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  63.39 
 
 		 445 aa  586  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  61.06 
 
 		 452 aa  579  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  61.5 
 
 		 452 aa  578  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3089  glutamine synthetase catalytic region  62.47 
 
 		 450 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  61.26 
 
 		 446 aa  573  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  62.16 
 
 		 446 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  62.61 
 
 		 446 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12251  glutamine synthetase glnA2  61.71 
 
 		 446 aa  571  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  62.61 
 
 		 446 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3262  glutamine synthetase catalytic region  60.81 
 
 		 446 aa  568  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216944  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  62.61 
 
 		 446 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  62.16 
 
 		 446 aa  570  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  61.66 
 
 		 449 aa  567  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4822  glutamine synthetase catalytic region  61.16 
 
 		 448 aa  556  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  52.8 
 
 		 446 aa  495  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  53.86 
 
 		 443 aa  492  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  54.32 
 
 		 443 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  53.64 
 
 		 443 aa  491  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  53.65 
 
 		 448 aa  488  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  54.46 
 
 		 443 aa  490  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  52.4 
 
 		 448 aa  482  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  52.53 
 
 		 444 aa  477  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  53.39 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  53.99 
 
 		 446 aa  473  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  49.09 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  50.46 
 
 		 447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  48.63 
 
 		 450 aa  449  1e-125  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  50.23 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2016  glutamine synthetase, type I  49.78 
 
 		 447 aa  440  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  hitchhiker  0.0000000000000396297 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  47.75 
 
 		 444 aa  428  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08250  L-glutamine synthetase  49.22 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.235557  normal  0.967917 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  48.07 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  47.51 
 
 		 456 aa  420  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  48.4 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  47.29 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  49.09 
 
 		 456 aa  412  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  47.14 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  46.49 
 
 		 444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  46.21 
 
 		 449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  47.84 
 
 		 449 aa  402  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  47.33 
 
 		 451 aa  399  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  46.15 
 
 		 445 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  46.14 
 
 		 439 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  47.15 
 
 		 445 aa  398  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  46.76 
 
 		 444 aa  398  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  49.32 
 
 		 451 aa  398  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  46.74 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  49.32 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  43.84 
 
 		 442 aa  392  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  44.11 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  45.24 
 
 		 446 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  46.53 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  45.01 
 
 		 446 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  45.01 
 
 		 446 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  45.41 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  45.1 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  45.62 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  44.34 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  47.95 
 
 		 450 aa  388  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  44.7 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  44.04 
 
 		 442 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  46.58 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  45.75 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  43.08 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  45.06 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  45.31 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  43.72 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  45.16 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  43.88 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  44.93 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  42.99 
 
 		 442 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  44.7 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  43.27 
 
 		 444 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  43.96 
 
 		 444 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  45.71 
 
 		 444 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  43.78 
 
 		 442 aa  375  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>