More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3089 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  72.71 
 
 		 449 aa  679    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  68.94 
 
 		 453 aa  645    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  69.32 
 
 		 453 aa  649    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  68.83 
 
 		 445 aa  644    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  74.22 
 
 		 447 aa  708    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  82.96 
 
 		 446 aa  787    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12251  glutamine synthetase glnA2  82.06 
 
 		 446 aa  773    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  83.86 
 
 		 446 aa  788    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  76.01 
 
 		 447 aa  726    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  68.16 
 
 		 455 aa  637    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3262  glutamine synthetase catalytic region  74.22 
 
 		 446 aa  702    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216944  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  82.96 
 
 		 446 aa  787    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  83.86 
 
 		 446 aa  794    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  82.96 
 
 		 446 aa  787    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3089  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 450 aa  932    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  79.82 
 
 		 446 aa  754    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  69.6 
 
 		 453 aa  634  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  69.03 
 
 		 453 aa  630  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  68.65 
 
 		 453 aa  630  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  67.7 
 
 		 453 aa  630  1e-179  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  68.01 
 
 		 445 aa  627  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  67.48 
 
 		 451 aa  622  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  67.04 
 
 		 447 aa  618  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  67.48 
 
 		 451 aa  619  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  67.55 
 
 		 452 aa  617  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  67.64 
 
 		 446 aa  617  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  66.22 
 
 		 444 aa  611  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  66.52 
 
 		 452 aa  609  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  65.99 
 
 		 445 aa  608  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  66.82 
 
 		 446 aa  608  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  66.14 
 
 		 446 aa  604  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  66.74 
 
 		 444 aa  606  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  65.32 
 
 		 445 aa  600  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  62.92 
 
 		 446 aa  587  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4822  glutamine synthetase catalytic region  65.27 
 
 		 448 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  62.47 
 
 		 445 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  61.35 
 
 		 445 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  55.86 
 
 		 445 aa  501  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  55.13 
 
 		 448 aa  494  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  52.44 
 
 		 446 aa  482  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  52.51 
 
 		 443 aa  483  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  53.42 
 
 		 448 aa  481  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  52.49 
 
 		 444 aa  474  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  53.29 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  53.74 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  53.51 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  52.73 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  51.03 
 
 		 449 aa  458  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  51.69 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  50.34 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  50.34 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  46.59 
 
 		 450 aa  415  9.999999999999999e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  47.07 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  49.66 
 
 		 444 aa  410  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2016  glutamine synthetase, type I  49.21 
 
 		 447 aa  410  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  hitchhiker  0.0000000000000396297 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  45.98 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  46.64 
 
 		 439 aa  403  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08250  L-glutamine synthetase  47.99 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.235557  normal  0.967917 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  45.68 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  45.58 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  45.23 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0242  glutamine synthetase catalytic region  45.86 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  45.7 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  46.95 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  43.24 
 
 		 441 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  45.19 
 
 		 437 aa  385  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  45.12 
 
 		 442 aa  387  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  44.75 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  43.95 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  46.14 
 
 		 439 aa  385  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  44.62 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  44.67 
 
 		 452 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  45.66 
 
 		 442 aa  381  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  44.32 
 
 		 443 aa  378  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  45.37 
 
 		 443 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  44.37 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  44.16 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  48.06 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  44.47 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  42.99 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  44.02 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  46.24 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  44.85 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  45.92 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  43.34 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  46.3 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  44.87 
 
 		 442 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  44.94 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  44.55 
 
 		 444 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  43.21 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  44.65 
 
 		 442 aa  371  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  43.38 
 
 		 449 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  42.86 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  43.08 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  45.37 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  42.79 
 
 		 450 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  43.18 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  43.08 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  45.21 
 
 		 449 aa  368  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  47.29 
 
 		 451 aa  364  2e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>