More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0924 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  72.91 
 
 		 446 aa  689    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  72.73 
 
 		 451 aa  668    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12251  glutamine synthetase glnA2  69.91 
 
 		 446 aa  649    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  67.77 
 
 		 445 aa  658    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  75.72 
 
 		 445 aa  718    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  71.87 
 
 		 446 aa  687    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  88.52 
 
 		 453 aa  818    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  72.06 
 
 		 451 aa  662    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  81.9 
 
 		 453 aa  794    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  71.65 
 
 		 447 aa  671    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  100 
 
 		 453 aa  942    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  71.24 
 
 		 446 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  68.43 
 
 		 446 aa  635    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  72.31 
 
 		 447 aa  680    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  71.15 
 
 		 452 aa  677    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  82.56 
 
 		 453 aa  779    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  69.91 
 
 		 446 aa  644    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  74.61 
 
 		 444 aa  706    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  73.95 
 
 		 444 aa  707    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  71.24 
 
 		 446 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4822  glutamine synthetase catalytic region  70.67 
 
 		 448 aa  636    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  81.68 
 
 		 453 aa  766    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3089  glutamine synthetase catalytic region  69.32 
 
 		 450 aa  649    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  72.47 
 
 		 446 aa  692    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  68.65 
 
 		 445 aa  667    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  78.37 
 
 		 453 aa  755    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  71.15 
 
 		 452 aa  672    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  75.5 
 
 		 455 aa  728    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  71.24 
 
 		 446 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  69.91 
 
 		 446 aa  646    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3262  glutamine synthetase catalytic region  69.16 
 
 		 446 aa  655    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216944  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  71.59 
 
 		 445 aa  687    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  75.28 
 
 		 445 aa  714    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  78.37 
 
 		 445 aa  741    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  73.19 
 
 		 447 aa  696    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  70.7 
 
 		 449 aa  654    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  66.52 
 
 		 446 aa  629  1e-179  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  62.78 
 
 		 445 aa  588  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  53.63 
 
 		 446 aa  507  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  55.38 
 
 		 448 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  54.04 
 
 		 444 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  54.02 
 
 		 443 aa  498  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  54.48 
 
 		 448 aa  495  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  53.35 
 
 		 443 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  54.14 
 
 		 446 aa  493  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  53.12 
 
 		 443 aa  490  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  52.35 
 
 		 443 aa  484  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  52 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  51.35 
 
 		 447 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  50.67 
 
 		 447 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  51.79 
 
 		 449 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2016  glutamine synthetase, type I  52.86 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  hitchhiker  0.0000000000000396297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  45.81 
 
 		 450 aa  428  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  48.9 
 
 		 444 aa  420  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  47.23 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  47.36 
 
 		 443 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  46.12 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  48.34 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08250  L-glutamine synthetase  48.36 
 
 		 445 aa  411  1e-113  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.235557  normal  0.967917 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  46.98 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  45.21 
 
 		 447 aa  403  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  47.2 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  45.35 
 
 		 441 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0242  glutamine synthetase catalytic region  47.66 
 
 		 447 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  46.21 
 
 		 439 aa  395  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  47.57 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  46.28 
 
 		 444 aa  396  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  43.43 
 
 		 442 aa  397  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  46.12 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  43.95 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  45.85 
 
 		 456 aa  395  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  43.97 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  45.17 
 
 		 442 aa  392  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  45.07 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  43.69 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  46.09 
 
 		 446 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  45.29 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  45.49 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  45.39 
 
 		 442 aa  391  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  45.68 
 
 		 446 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  45.29 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  46.59 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  44.52 
 
 		 444 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  45.05 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  44.97 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  46.71 
 
 		 451 aa  385  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  43.47 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  46.47 
 
 		 451 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  43.42 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  44.42 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  45.39 
 
 		 449 aa  383  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  43.62 
 
 		 444 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  44.42 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  42.95 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  42.95 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  42.95 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  42.95 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  45.64 
 
 		 452 aa  381  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  45.29 
 
 		 444 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  43.18 
 
 		 444 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>