More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08250 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_08250  L-glutamine synthetase  100 
 
 
445 aa  927    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.235557  normal  0.967917 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2016  glutamine synthetase, type I  65.17 
 
 
447 aa  601  1.0000000000000001e-171  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  hitchhiker  0.0000000000000396297 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  57.4 
 
 
444 aa  521  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  56.16 
 
 
449 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  55.02 
 
 
447 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  54.75 
 
 
443 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  53.65 
 
 
447 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  53.76 
 
 
446 aa  485  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  50.68 
 
 
443 aa  472  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  50.91 
 
 
443 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  51.37 
 
 
448 aa  473  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  51.14 
 
 
443 aa  471  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  52.28 
 
 
444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  51.13 
 
 
446 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  51.89 
 
 
445 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  51.45 
 
 
445 aa  460  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  51.45 
 
 
445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  49.43 
 
 
443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  50.89 
 
 
444 aa  451  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  50.56 
 
 
455 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  50.45 
 
 
444 aa  450  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  49.22 
 
 
445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  50.45 
 
 
448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  50.22 
 
 
446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  49.44 
 
 
445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 
453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  49.67 
 
 
453 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  49 
 
 
447 aa  441  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  49.45 
 
 
453 aa  441  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  49.67 
 
 
453 aa  444  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  49.67 
 
 
446 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  49 
 
 
447 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  49.22 
 
 
446 aa  435  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  49.22 
 
 
445 aa  436  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  48.36 
 
 
453 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  48.58 
 
 
453 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  47.81 
 
 
452 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  47.81 
 
 
452 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  49.67 
 
 
446 aa  422  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  47.45 
 
 
447 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0428  glutamine synthetase catalytic region  46.95 
 
 
437 aa  420  1e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  47.61 
 
 
450 aa  419  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  48.22 
 
 
446 aa  418  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  48.66 
 
 
449 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3089  glutamine synthetase catalytic region  47.99 
 
 
450 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  48.12 
 
 
451 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  48.44 
 
 
446 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  48.44 
 
 
446 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  48.44 
 
 
446 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4822  glutamine synthetase catalytic region  48.46 
 
 
448 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  46.67 
 
 
446 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  47.89 
 
 
451 aa  408  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  46.89 
 
 
446 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3262  glutamine synthetase catalytic region  46.67 
 
 
446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216944  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12251  glutamine synthetase glnA2  46.67 
 
 
446 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  45.39 
 
 
447 aa  391  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  43.92 
 
 
443 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  45.37 
 
 
445 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  45.52 
 
 
445 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  44.04 
 
 
445 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  43.68 
 
 
456 aa  384  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  44.42 
 
 
449 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  43.89 
 
 
444 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  43.05 
 
 
441 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  43.44 
 
 
444 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  45.12 
 
 
450 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  43.5 
 
 
442 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  44.19 
 
 
443 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  46.12 
 
 
451 aa  377  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  44.87 
 
 
444 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  44.65 
 
 
443 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0242  glutamine synthetase catalytic region  44.47 
 
 
447 aa  372  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  44.37 
 
 
451 aa  373  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  43.15 
 
 
444 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  41.67 
 
 
445 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  43.21 
 
 
444 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  44.42 
 
 
442 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  44.57 
 
 
451 aa  370  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  41.81 
 
 
456 aa  367  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  42.25 
 
 
437 aa  367  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  45.21 
 
 
449 aa  366  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  45.12 
 
 
443 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  43.21 
 
 
433 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  41.44 
 
 
442 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  42.25 
 
 
444 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  43.52 
 
 
443 aa  365  1e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  41.22 
 
 
442 aa  365  1e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  44.57 
 
 
450 aa  365  1e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  42.02 
 
 
444 aa  363  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  42.02 
 
 
444 aa  363  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  42.02 
 
 
444 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  42.02 
 
 
444 aa  363  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  42.02 
 
 
444 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  42.02 
 
 
444 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  42.63 
 
 
442 aa  363  3e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  42.02 
 
 
444 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  43.47 
 
 
447 aa  363  5.0000000000000005e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  43.85 
 
 
444 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  40.95 
 
 
445 aa  361  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  43.54 
 
 
439 aa  361  1e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>