More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0628 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  100 
 
 		 443 aa  927    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  64.64 
 
 		 445 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  64.07 
 
 		 444 aa  589  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  63.04 
 
 		 444 aa  585  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  63.36 
 
 		 444 aa  581  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  62.81 
 
 		 443 aa  583  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  60.86 
 
 		 443 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  60.77 
 
 		 444 aa  578  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  60.5 
 
 		 449 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  60.63 
 
 		 446 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  60.63 
 
 		 446 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  61 
 
 		 444 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  60.63 
 
 		 443 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  60.18 
 
 		 444 aa  565  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  62.56 
 
 		 442 aa  566  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  60.41 
 
 		 444 aa  566  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  61.76 
 
 		 444 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  60.18 
 
 		 444 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  61.17 
 
 		 444 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  59.95 
 
 		 444 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  59.95 
 
 		 444 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  59.95 
 
 		 444 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  59.95 
 
 		 444 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  59.95 
 
 		 444 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  59.95 
 
 		 444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  59.73 
 
 		 444 aa  558  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  59.73 
 
 		 444 aa  558  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  58.73 
 
 		 445 aa  560  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  58.37 
 
 		 446 aa  552  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  58.35 
 
 		 441 aa  551  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  60.32 
 
 		 440 aa  550  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  56.98 
 
 		 445 aa  544  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  57.44 
 
 		 442 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  58.41 
 
 		 443 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  55.78 
 
 		 447 aa  532  1e-150  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  55.63 
 
 		 448 aa  520  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  56.82 
 
 		 446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  54.82 
 
 		 442 aa  514  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  54.73 
 
 		 447 aa  510  1e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  55.76 
 
 		 448 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  53.95 
 
 		 442 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  55.32 
 
 		 441 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  56.33 
 
 		 447 aa  504  1e-141  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  52.03 
 
 		 445 aa  499  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  54.97 
 
 		 442 aa  500  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  53.62 
 
 		 447 aa  495  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  54.17 
 
 		 442 aa  496  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  56.14 
 
 		 446 aa  491  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  53.97 
 
 		 452 aa  487  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  52.75 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  52.27 
 
 		 442 aa  487  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  52.64 
 
 		 456 aa  483  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  52.61 
 
 		 443 aa  478  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  52.31 
 
 		 461 aa  480  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  51.25 
 
 		 448 aa  476  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  52.7 
 
 		 443 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  51.84 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  51.94 
 
 		 446 aa  472  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  51.71 
 
 		 441 aa  472  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  53.3 
 
 		 439 aa  474  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  52.06 
 
 		 448 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  51.49 
 
 		 439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  52.28 
 
 		 437 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  52.75 
 
 		 456 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  53.94 
 
 		 452 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  52.64 
 
 		 433 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  51.97 
 
 		 451 aa  466  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  50.34 
 
 		 453 aa  463  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  53.53 
 
 		 451 aa  460  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  53.64 
 
 		 451 aa  460  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  53.08 
 
 		 450 aa  461  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  51.38 
 
 		 447 aa  455  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  51.74 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  50.34 
 
 		 444 aa  457  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  50.91 
 
 		 457 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  51.02 
 
 		 444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  50.46 
 
 		 447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  51.71 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  50.69 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  48.28 
 
 		 443 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  49.54 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  50.92 
 
 		 449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  49.2 
 
 		 446 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  47.82 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  49.77 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  47.82 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  48.75 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  48.53 
 
 		 443 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  47.75 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  48.63 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  47.51 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  46.83 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  46.47 
 
 		 446 aa  420  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  47.61 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  50.34 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  47.63 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  46.67 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  47.95 
 
 		 445 aa  418  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0202  L-glutamine synthetase  47.03 
 
 		 440 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  47.37 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>