More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3479 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  93.47 
 
 		 444 aa  856    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  100 
 
 		 444 aa  909    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  61.12 
 
 		 444 aa  586  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  64.77 
 
 		 444 aa  578  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  57.47 
 
 		 450 aa  523  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  50.22 
 
 		 456 aa  465  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  49.78 
 
 		 444 aa  460  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  52.36 
 
 		 444 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  51.9 
 
 		 443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  50.9 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  49.78 
 
 		 442 aa  445  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  48.76 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  48.65 
 
 		 449 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  47.99 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  49.32 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  48.65 
 
 		 445 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  48.76 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  47.97 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  49.44 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  48.43 
 
 		 444 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  46.77 
 
 		 456 aa  429  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  48.43 
 
 		 444 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  47.3 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  48.89 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  48.28 
 
 		 451 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  46.65 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  46.65 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  49.22 
 
 		 451 aa  429  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  47.86 
 
 		 440 aa  428  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  48.55 
 
 		 450 aa  426  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  50.22 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  48.25 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  46.8 
 
 		 448 aa  422  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  46.86 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  46.86 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  46.86 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  46.86 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  46.86 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  47.42 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  49.77 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  48.33 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  46.64 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  46.41 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  48.84 
 
 		 439 aa  420  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  48.31 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  46.64 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  46.77 
 
 		 449 aa  418  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  47.64 
 
 		 439 aa  419  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  46.83 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  46.86 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  47.43 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  46.41 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  48.31 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  47.17 
 
 		 443 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  47.86 
 
 		 443 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  45.98 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  48.31 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  46.5 
 
 		 446 aa  415  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  46.19 
 
 		 444 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  44.34 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  50.23 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  46.1 
 
 		 448 aa  411  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  47.74 
 
 		 439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  43.08 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  45.56 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  45.7 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  46.83 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  47.22 
 
 		 442 aa  402  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  45.6 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  45.09 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  46.38 
 
 		 442 aa  403  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  43.5 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  47.01 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  45.1 
 
 		 439 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  45.93 
 
 		 449 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  44.22 
 
 		 443 aa  396  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  46.09 
 
 		 445 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  45.82 
 
 		 461 aa  396  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  45.12 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  44.67 
 
 		 442 aa  397  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  42.89 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  44.92 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  46.53 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  44.74 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  44.34 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  43.33 
 
 		 446 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  43.33 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  45.98 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  43.46 
 
 		 448 aa  388  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  45.25 
 
 		 447 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  44.98 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  46.03 
 
 		 447 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  43.56 
 
 		 446 aa  388  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  44.19 
 
 		 452 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  43.95 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  43.72 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3262  glutamine synthetase catalytic region  44.97 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216944  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  44.74 
 
 		 445 aa  383  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  44.84 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>