More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0384 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  95.52 
 
 
446 aa  892    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  73.44 
 
 
448 aa  713    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  80.72 
 
 
446 aa  775    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  95.07 
 
 
446 aa  890    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  100 
 
 
446 aa  924    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  54.05 
 
 
445 aa  488  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  52.6 
 
 
443 aa  488  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  53.94 
 
 
441 aa  489  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  52.7 
 
 
444 aa  482  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  53.93 
 
 
443 aa  483  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  52.03 
 
 
442 aa  483  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  52.25 
 
 
445 aa  480  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  52.94 
 
 
444 aa  481  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  51.95 
 
 
444 aa  475  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  52.15 
 
 
444 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  51.95 
 
 
444 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  54.99 
 
 
444 aa  476  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  52.83 
 
 
443 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  52.62 
 
 
442 aa  476  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  52.17 
 
 
444 aa  475  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  51.72 
 
 
444 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  51.72 
 
 
444 aa  474  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  51.72 
 
 
444 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  53.69 
 
 
444 aa  471  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  51.72 
 
 
444 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  52.9 
 
 
442 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  51.72 
 
 
444 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  52.06 
 
 
449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  51.03 
 
 
444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  50.34 
 
 
442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  51.26 
 
 
444 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  51.26 
 
 
444 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  50.79 
 
 
446 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  50.11 
 
 
456 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  49.55 
 
 
443 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  50.79 
 
 
446 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  50.68 
 
 
443 aa  464  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  50.68 
 
 
446 aa  462  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  49.1 
 
 
447 aa  462  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  52.2 
 
 
444 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  53.46 
 
 
439 aa  463  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  51.13 
 
 
442 aa  464  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  49.55 
 
 
442 aa  461  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  51.45 
 
 
456 aa  458  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  48.87 
 
 
442 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  48.87 
 
 
446 aa  456  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  51.57 
 
 
449 aa  457  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  50.46 
 
 
451 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  50.9 
 
 
441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  51.79 
 
 
439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  50.34 
 
 
439 aa  451  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  47.33 
 
 
452 aa  449  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  51.13 
 
 
444 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  49.32 
 
 
433 aa  449  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  51 
 
 
450 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  49.54 
 
 
443 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  50.11 
 
 
448 aa  443  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  50.34 
 
 
439 aa  442  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  48.87 
 
 
445 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  49.44 
 
 
446 aa  444  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  49.77 
 
 
443 aa  442  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 
444 aa  444  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  48.17 
 
 
447 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  49.77 
 
 
447 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  49.11 
 
 
450 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  49.31 
 
 
440 aa  440  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  48.42 
 
 
445 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  47.74 
 
 
461 aa  436  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  47.87 
 
 
448 aa  432  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 
451 aa  432  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  49.43 
 
 
447 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  48.52 
 
 
447 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  47.4 
 
 
441 aa  431  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  49.32 
 
 
447 aa  430  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  48.09 
 
 
448 aa  429  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  48.89 
 
 
451 aa  429  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  49.22 
 
 
444 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  47.66 
 
 
450 aa  427  1e-118  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  50.34 
 
 
446 aa  426  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  45.19 
 
 
446 aa  425  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  47.38 
 
 
449 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  47.64 
 
 
437 aa  424  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  46.91 
 
 
448 aa  418  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  46.55 
 
 
443 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  45.88 
 
 
443 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  45.66 
 
 
443 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  45.52 
 
 
453 aa  412  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  48.31 
 
 
452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  44.75 
 
 
443 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  43.95 
 
 
448 aa  404  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  47.86 
 
 
444 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  43.81 
 
 
444 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  43.56 
 
 
444 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  43.82 
 
 
443 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  44.52 
 
 
457 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  41.48 
 
 
445 aa  372  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  41.76 
 
 
453 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  41.57 
 
 
445 aa  368  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  41.12 
 
 
445 aa  367  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  42.07 
 
 
447 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>