More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3763 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  77.27 
 
 
443 aa  730    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  100 
 
 
457 aa  952    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  61.05 
 
 
443 aa  560  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  57.73 
 
 
443 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  58.47 
 
 
444 aa  537  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  57.92 
 
 
442 aa  531  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  57.17 
 
 
444 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  57.4 
 
 
444 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  56.59 
 
 
443 aa  526  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  56.62 
 
 
444 aa  523  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  54.67 
 
 
449 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  56.49 
 
 
441 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  53.62 
 
 
440 aa  508  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2810  glutamate--ammonia ligase  55.53 
 
 
432 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000780353  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  55.33 
 
 
443 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  54.57 
 
 
445 aa  498  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  53.38 
 
 
445 aa  489  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  51.81 
 
 
442 aa  478  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  52.05 
 
 
442 aa  476  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2030  glutamate--ammonia ligase  55.58 
 
 
445 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  52.94 
 
 
444 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  50.88 
 
 
444 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  47.87 
 
 
445 aa  461  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  50.44 
 
 
444 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  50.91 
 
 
443 aa  456  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  51.69 
 
 
446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  50.11 
 
 
444 aa  448  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  50.9 
 
 
445 aa  451  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 
444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 
444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 
444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  49.89 
 
 
444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 
444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  50.67 
 
 
444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  50.67 
 
 
444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  50.56 
 
 
444 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 
446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 
444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 
446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  48.75 
 
 
447 aa  443  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  49.66 
 
 
444 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  50.91 
 
 
442 aa  437  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  48.98 
 
 
442 aa  436  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  48.08 
 
 
446 aa  433  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  49.78 
 
 
453 aa  432  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  48.1 
 
 
448 aa  423  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  45.17 
 
 
447 aa  423  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  46.65 
 
 
456 aa  422  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  47.98 
 
 
447 aa  423  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  49.31 
 
 
451 aa  421  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  49.09 
 
 
441 aa  421  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  48.05 
 
 
442 aa  420  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  49.43 
 
 
443 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  48.09 
 
 
450 aa  413  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  45.64 
 
 
448 aa  412  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  48.99 
 
 
451 aa  412  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  48.25 
 
 
452 aa  410  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  46.47 
 
 
442 aa  409  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  48.31 
 
 
449 aa  410  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  47.96 
 
 
456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  48.65 
 
 
451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  48.05 
 
 
433 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  45.43 
 
 
439 aa  395  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  44.65 
 
 
439 aa  390  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  45.96 
 
 
450 aa  391  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  45.21 
 
 
446 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  42.6 
 
 
447 aa  385  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  45.07 
 
 
439 aa  386  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  45.68 
 
 
452 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  45.08 
 
 
461 aa  384  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  43.96 
 
 
439 aa  382  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  44.97 
 
 
446 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  44.42 
 
 
444 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0202  L-glutamine synthetase  45.8 
 
 
440 aa  383  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  46.09 
 
 
446 aa  383  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  45.6 
 
 
441 aa  382  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  43.95 
 
 
448 aa  379  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  44.52 
 
 
446 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  43.76 
 
 
443 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  44.07 
 
 
443 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  42.63 
 
 
444 aa  369  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  43.08 
 
 
448 aa  371  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  43.54 
 
 
443 aa  368  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  43.43 
 
 
444 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  41.28 
 
 
448 aa  363  5.0000000000000005e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  42.66 
 
 
443 aa  360  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  43.27 
 
 
443 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  42.63 
 
 
446 aa  359  5e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  41.93 
 
 
447 aa  359  5e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  42.38 
 
 
447 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  43.05 
 
 
444 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  42.79 
 
 
446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  42.54 
 
 
446 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  42.06 
 
 
449 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  44.34 
 
 
437 aa  354  2e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  43.44 
 
 
445 aa  353  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  43.15 
 
 
446 aa  351  1e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  43.68 
 
 
444 aa  350  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2016  glutamine synthetase, type I  43.51 
 
 
447 aa  349  7e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  hitchhiker  0.0000000000000396297 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  41.04 
 
 
445 aa  344  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>