More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0990 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  100 
 
 		 439 aa  903    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  69.72 
 
 		 439 aa  635    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  64.62 
 
 		 439 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  60.5 
 
 		 439 aa  558  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  57.4 
 
 		 441 aa  520  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  56.62 
 
 		 444 aa  513  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  55.23 
 
 		 442 aa  509  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  56.12 
 
 		 444 aa  508  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  55.96 
 
 		 444 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  54.61 
 
 		 443 aa  503  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  54.67 
 
 		 445 aa  499  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  54.79 
 
 		 440 aa  497  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  54.15 
 
 		 442 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  54.61 
 
 		 443 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  55.3 
 
 		 443 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  55.5 
 
 		 444 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  55.86 
 
 		 445 aa  488  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  53.67 
 
 		 444 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  55.66 
 
 		 442 aa  488  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  53.67 
 
 		 444 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  53.67 
 
 		 444 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  53.44 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  53.44 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  53.44 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  53.44 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  55.66 
 
 		 444 aa  485  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  53.44 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  54.02 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  53.21 
 
 		 446 aa  484  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  53.56 
 
 		 442 aa  483  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  51.86 
 
 		 443 aa  483  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  53.44 
 
 		 444 aa  484  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  52.75 
 
 		 444 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  53.44 
 
 		 444 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  53.79 
 
 		 444 aa  478  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  52.52 
 
 		 446 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  52.52 
 
 		 446 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  53.6 
 
 		 433 aa  478  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  52.41 
 
 		 442 aa  479  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  54.69 
 
 		 446 aa  478  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  52.31 
 
 		 442 aa  476  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  52.41 
 
 		 447 aa  471  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  52.52 
 
 		 444 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  51.84 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  53.67 
 
 		 443 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  51.03 
 
 		 461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  52.05 
 
 		 445 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  53.44 
 
 		 456 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  51.83 
 
 		 447 aa  464  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  53.23 
 
 		 441 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  50.46 
 
 		 456 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  53.46 
 
 		 448 aa  462  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  51.69 
 
 		 446 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  53.88 
 
 		 451 aa  462  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  52.68 
 
 		 451 aa  464  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  53.72 
 
 		 437 aa  463  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  51.6 
 
 		 446 aa  464  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  49.43 
 
 		 442 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  49.43 
 
 		 441 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  52.16 
 
 		 452 aa  460  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  51.03 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  52.3 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  51.95 
 
 		 444 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  51.24 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  54.57 
 
 		 451 aa  459  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  51.8 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  50.46 
 
 		 443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  50.23 
 
 		 443 aa  450  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  50.46 
 
 		 443 aa  450  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  50.34 
 
 		 446 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  50 
 
 		 450 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  50.57 
 
 		 449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  53.7 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  48.74 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  49.54 
 
 		 443 aa  441  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  49.2 
 
 		 444 aa  441  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  49.66 
 
 		 448 aa  438  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  50.68 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  50.68 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  49.42 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  48.86 
 
 		 452 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  47.19 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  48.4 
 
 		 447 aa  421  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  49.09 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  48.86 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  49.54 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  47.03 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  47.14 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  46.01 
 
 		 444 aa  408  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  47.53 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  48.63 
 
 		 450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  47.76 
 
 		 453 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  46.35 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  46.03 
 
 		 443 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  46.26 
 
 		 444 aa  398  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  45.1 
 
 		 444 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  47.94 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3262  glutamine synthetase catalytic region  45.68 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216944  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  46 
 
 		 445 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>