More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1141 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2715  glutamine synthetase, catalytic region  73.09 
 
 
476 aa  741    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.846118  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3142  L-glutamine synthetase  66.31 
 
 
475 aa  676    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2657  glutamine synthetase catalytic region  74.73 
 
 
474 aa  767    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  71.46 
 
 
476 aa  739    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1141  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 
473 aa  981    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  34.55 
 
 
446 aa  227  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  34.55 
 
 
446 aa  227  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  35.55 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  34.91 
 
 
445 aa  221  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  33.17 
 
 
439 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  33.72 
 
 
447 aa  219  1e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  34.71 
 
 
447 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  33.87 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  33.18 
 
 
446 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  34.41 
 
 
444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  33.57 
 
 
444 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  33.95 
 
 
444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  33.41 
 
 
448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  33.95 
 
 
444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  34.18 
 
 
444 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  33.48 
 
 
444 aa  213  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  33.95 
 
 
444 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  34.11 
 
 
444 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  33.72 
 
 
444 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  33.72 
 
 
444 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  33.72 
 
 
444 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  33.72 
 
 
444 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  33.72 
 
 
444 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  34.91 
 
 
452 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  34.04 
 
 
442 aa  209  7e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  33.89 
 
 
442 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  32.4 
 
 
443 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  32.94 
 
 
447 aa  207  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  32.41 
 
 
444 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  32.13 
 
 
439 aa  207  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  33.63 
 
 
449 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  33.41 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  31.44 
 
 
444 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  32.51 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  31.89 
 
 
442 aa  202  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  32.11 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  32.36 
 
 
439 aa  201  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  32.18 
 
 
445 aa  200  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  33.65 
 
 
443 aa  199  9e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  34.44 
 
 
442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  31.95 
 
 
445 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  30 
 
 
446 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  32.88 
 
 
443 aa  197  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  31.98 
 
 
441 aa  197  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  32.94 
 
 
448 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  30.79 
 
 
437 aa  194  4e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  32.87 
 
 
443 aa  194  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  31.95 
 
 
450 aa  194  4e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  31.88 
 
 
443 aa  193  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  32.53 
 
 
433 aa  192  8e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  31.7 
 
 
456 aa  192  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  32.39 
 
 
447 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  31.06 
 
 
445 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  33 
 
 
441 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  31.81 
 
 
452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 
453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  31.33 
 
 
448 aa  190  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  31.86 
 
 
445 aa  191  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  32.33 
 
 
439 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  33.51 
 
 
443 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  34.26 
 
 
441 aa  189  7e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  30.88 
 
 
446 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  31.67 
 
 
440 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  32.32 
 
 
446 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  31.71 
 
 
446 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  31.11 
 
 
444 aa  187  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  31.62 
 
 
443 aa  186  6e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  31.44 
 
 
443 aa  186  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  34.2 
 
 
446 aa  186  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  31.88 
 
 
444 aa  186  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  32.38 
 
 
451 aa  186  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  31.7 
 
 
453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  32.78 
 
 
449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  30.14 
 
 
442 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  32.15 
 
 
446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  31.46 
 
 
447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  31.39 
 
 
443 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  32.17 
 
 
453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  30.21 
 
 
450 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  29.69 
 
 
445 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  32.02 
 
 
447 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  29.27 
 
 
445 aa  182  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  31.69 
 
 
447 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  31.16 
 
 
442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  30.66 
 
 
448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  31.35 
 
 
448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  32.18 
 
 
453 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  32.54 
 
 
446 aa  178  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  29.83 
 
 
445 aa  179  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  29.56 
 
 
445 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  31.39 
 
 
449 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  31.36 
 
 
456 aa  177  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  30.26 
 
 
446 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  31.92 
 
 
451 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  29.7 
 
 
448 aa  176  7e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>