More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1612 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1341  glutamine synthetase, type I  77.45 
 
 		 471 aa  775    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0145067  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1612  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 470 aa  966    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1790  type I glutamine synthetase  51.37 
 
 		 490 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1891  glutamine synthetase, type I  47.72 
 
 		 472 aa  423  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198707  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0131  glutamine synthetase, type I  46.19 
 
 		 469 aa  415  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000917861  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  46.91 
 
 		 473 aa  412  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1901  glutamine synthetase, type I  45.1 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.624126  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2983  glutamine synthetase, type I  45.79 
 
 		 474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2299  L-glutamine synthetase  46.8 
 
 		 475 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00444261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1628  glutamine synthetase, type I  45.96 
 
 		 473 aa  403  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3383  glutamine synthetase, type I  45.64 
 
 		 475 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  45.34 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4318  glutamine synthetase, type I  45.25 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1947  glutamine synthetase, type I  44.79 
 
 		 491 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  45.76 
 
 		 470 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  45.55 
 
 		 470 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4896  glutamine synthetase type I  45.74 
 
 		 479 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791455  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0886  glutamine synthetase protein  44.54 
 
 		 491 aa  398  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0716545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0932  glutamine synthetase, type I  45.34 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.017954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  45.42 
 
 		 470 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3142  L-glutamine synthetase  44.98 
 
 		 474 aa  395  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1770  glutamine synthetase, type I  45.3 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  45.21 
 
 		 470 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1681  glutamine synthetase, type I  45.34 
 
 		 470 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000311602  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16500  L-glutamine synthetase  45.57 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.399242  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1390  glutamine synthetase, type I  45.13 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1771  type I glutamine synthetase  44.26 
 
 		 481 aa  392  1e-108  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07500  L-glutamine synthetase  45.34 
 
 		 474 aa  395  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0576  glutamine synthetase, type I  44.51 
 
 		 470 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3763  L-glutamine synthetase  45.7 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.382156  normal  0.0833573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  44.42 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  45.13 
 
 		 470 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1501  glutamine synthetase, type I  43.69 
 
 		 469 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000036011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0243  L-glutamine synthetase  44.84 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2038  glutamine synthetase, type I  45.34 
 
 		 474 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512125  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2112  glutamine synthetase, type I  44.54 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0742231  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  44.89 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  44.89 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0925  glutamine synthetase, type I  43.89 
 
 		 474 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  44.68 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03704  hypothetical protein  44.89 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4346  glutamine synthetase  44.89 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5316  glutamine synthetase  44.89 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.961991  normal  0.126376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1262  glutamine synthetase, type I  44.72 
 
 		 474 aa  388  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0975496  normal  0.0997444 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  44.89 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  44.68 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1807  L-glutamine synthetase  46.27 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000345989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1915  glutamine synthetase, type I  44.72 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.031612  hitchhiker  0.00101897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  44.68 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  44.68 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  44.89 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3291  glutamine synthetase, type I  44.72 
 
 		 474 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0215954 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  44.89 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15370  L-glutamine synthetase  45.13 
 
 		 474 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  44.89 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1443  glutamine synthetase, type I  44.95 
 
 		 483 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0199962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2295  L-glutamine synthetase  44.51 
 
 		 474 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4335  glutamine synthetase  44.68 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1855  glutamine synthetase, type I  45.06 
 
 		 474 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.636307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  44.1 
 
 		 474 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12249  glutamine synthetase glnA1  43.83 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.465808  normal  0.443746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01591  glutamine synthetase  45.49 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  44.54 
 
 		 474 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0243  glutamine synthetase, type I  42.95 
 
 		 475 aa  382  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.823516  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0209  glutamine synthetase, type I  45.8 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692281  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3102  glutamine synthetase, type I  45.28 
 
 		 474 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0143892  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0923  L-glutamine synthetase  43.8 
 
 		 474 aa  385  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3585  glutamine synthetase, type I  44.03 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0280122  normal  0.0233949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1510  glutamine synthetase, type I  44.06 
 
 		 477 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3373  glutamine synthetase, type I  44.6 
 
 		 477 aa  381  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3331  L-glutamine synthetase  43.42 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  43.6 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  43.6 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2979  glutamine synthetase, type I  45.64 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  45.28 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3080  glutamine synthetase, type I  44.03 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0496817  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2928  glutamine synthetase, type I  43.62 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.304351  normal  0.179293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3320  L-glutamine synthetase  43.42 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  45.44 
 
 		 473 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3382  L-glutamine synthetase  43.42 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00327217  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  43.8 
 
 		 474 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10271  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  43.36 
 
 		 473 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.18298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1258  glutamine synthetase protein  44.72 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0683  glutamine synthetase, type I  42.8 
 
 		 473 aa  376  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  43.51 
 
 		 473 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  44.05 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4189  glutamine synthetase  43.42 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1073  glutamine synthetase, type I  42.92 
 
 		 475 aa  378  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  43.42 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3715  glutamine synthetase, type I  43.42 
 
 		 477 aa  378  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5002  glutamine synthetase, type I  45.64 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1484  glutamine synthetase, type I  43.48 
 
 		 474 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.836953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3332  glutamine synthetase, type I  43.69 
 
 		 474 aa  378  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0195703  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1025  glutamine synthetase  44.03 
 
 		 469 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4881  glutamine synthetase  43.84 
 
 		 469 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567284  hitchhiker  0.000124189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3568  glutamine synthetase, type I  43.48 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0027  glutamine synthetase  43.42 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1086  glutamine synthetase, type I  44.31 
 
 		 471 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0418  glutamine synthetase, type I  43.88 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.910839  normal  0.393257 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3581  glutamine synthetase, type I  44.81 
 
 		 471 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>