More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3568 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1510  glutamine synthetase, type I  71.28 
 
 
477 aa  729    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1915  glutamine synthetase, type I  69.13 
 
 
472 aa  705    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.031612  hitchhiker  0.00101897 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3102  glutamine synthetase, type I  70.25 
 
 
474 aa  723    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0143892  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16500  L-glutamine synthetase  68.28 
 
 
476 aa  696    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.399242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7410  glutamine synthetase, type I  75.48 
 
 
474 aa  758    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13400  L-glutamine synthetase  64.56 
 
 
474 aa  656    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0496712  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3331  L-glutamine synthetase  69.07 
 
 
478 aa  709    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15370  L-glutamine synthetase  71.25 
 
 
474 aa  722    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3291  glutamine synthetase, type I  72.36 
 
 
474 aa  738    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0215954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  68.99 
 
 
474 aa  702    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4896  glutamine synthetase type I  79.96 
 
 
479 aa  811    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791455  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1855  glutamine synthetase, type I  72.36 
 
 
474 aa  734    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.636307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12249  glutamine synthetase glnA1  69.77 
 
 
478 aa  717    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.465808  normal  0.443746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3080  glutamine synthetase, type I  68.55 
 
 
477 aa  702    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0496817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0932  glutamine synthetase, type I  69.62 
 
 
474 aa  710    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.017954 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2928  glutamine synthetase, type I  69.28 
 
 
478 aa  716    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.304351  normal  0.179293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1594  glutamine synthetase, type I  68.01 
 
 
474 aa  679    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000352701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3142  L-glutamine synthetase  68.35 
 
 
474 aa  701    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1770  glutamine synthetase, type I  69.41 
 
 
474 aa  707    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2112  glutamine synthetase, type I  74.47 
 
 
474 aa  754    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0742231  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07500  L-glutamine synthetase  73.42 
 
 
474 aa  760    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  70.46 
 
 
474 aa  726    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3568  glutamine synthetase, type I  100 
 
 
474 aa  984    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3320  L-glutamine synthetase  69.07 
 
 
478 aa  709    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1484  glutamine synthetase, type I  66.24 
 
 
474 aa  677    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.836953  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16410  L-glutamine synthetase  66.53 
 
 
474 aa  686    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0465358  normal  0.186154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3373  glutamine synthetase, type I  73.58 
 
 
477 aa  745    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1262  glutamine synthetase, type I  70.46 
 
 
474 aa  725    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0975496  normal  0.0997444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1600  L-glutamine synthetase  67.16 
 
 
474 aa  674    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2038  glutamine synthetase, type I  71.94 
 
 
474 aa  725    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0925  glutamine synthetase, type I  75.32 
 
 
474 aa  774    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0923  L-glutamine synthetase  78.06 
 
 
474 aa  785    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2295  L-glutamine synthetase  70.89 
 
 
474 aa  722    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3382  L-glutamine synthetase  69.07 
 
 
478 aa  709    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00327217  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3332  glutamine synthetase, type I  96.41 
 
 
474 aa  963    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0195703  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3585  glutamine synthetase, type I  69.7 
 
 
478 aa  717    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0280122  normal  0.0233949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2983  glutamine synthetase, type I  60.89 
 
 
474 aa  599  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55604  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0828  glutamine synthetase  61.91 
 
 
478 aa  598  1e-170  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0243  glutamine synthetase, type I  60 
 
 
475 aa  597  1e-169  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.823516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1901  glutamine synthetase, type I  59.41 
 
 
474 aa  590  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.624126  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1140  glutamine synthetase, type I  60.85 
 
 
478 aa  588  1e-167  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4318  glutamine synthetase, type I  58.85 
 
 
476 aa  586  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  57.38 
 
 
473 aa  580  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  57.66 
 
 
474 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  59.06 
 
 
470 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  57.23 
 
 
474 aa  574  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  58.51 
 
 
470 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0837  glutamine synthetase, type I  56.45 
 
 
473 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0808  glutamine synthetase, type I  56.45 
 
 
473 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  57.23 
 
 
474 aa  574  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  57.78 
 
 
470 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  57.02 
 
 
474 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  56.29 
 
 
473 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2299  L-glutamine synthetase  57.89 
 
 
475 aa  572  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00444261  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3834  L-glutamine synthetase  54.85 
 
 
473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  56.03 
 
 
473 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0886  glutamine synthetase protein  57.93 
 
 
491 aa  566  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0716545  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1891  glutamine synthetase, type I  58.56 
 
 
472 aa  567  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  57.36 
 
 
470 aa  566  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  58 
 
 
470 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1501  glutamine synthetase, type I  56.69 
 
 
469 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000036011  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1390  glutamine synthetase, type I  57.75 
 
 
471 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  57.57 
 
 
470 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1839  glutamine synthetase, type I  56.45 
 
 
471 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1681  glutamine synthetase, type I  56.93 
 
 
470 aa  559  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000311602  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  55.53 
 
 
470 aa  552  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16421  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  55.06 
 
 
473 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1443  glutamine synthetase, type I  55.77 
 
 
483 aa  545  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0199962  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3715  glutamine synthetase, type I  52.93 
 
 
477 aa  545  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3383  glutamine synthetase, type I  55.41 
 
 
475 aa  541  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0683  glutamine synthetase, type I  55.53 
 
 
473 aa  543  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0576  glutamine synthetase, type I  56.05 
 
 
470 aa  544  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10271  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  54.22 
 
 
473 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.18298 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1628  glutamine synthetase, type I  54.11 
 
 
473 aa  536  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0141  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  53.38 
 
 
473 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  53.8 
 
 
473 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07731  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  53.59 
 
 
473 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0667695 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09401  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  53.59 
 
 
473 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256855  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09391  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  53.59 
 
 
473 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1265  glutamine synthetase type I  54.01 
 
 
473 aa  532  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  53.19 
 
 
474 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1205  L-glutamine synthetase  53.16 
 
 
473 aa  529  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.488763  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10031  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  53.16 
 
 
473 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.913163  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1947  glutamine synthetase, type I  52.67 
 
 
491 aa  524  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0448  glutamine synthetase, type I  56.9 
 
 
485 aa  514  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00416538 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1073  glutamine synthetase, type I  52.98 
 
 
475 aa  511  1e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3959  glutamine synthetase  53.53 
 
 
469 aa  507  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0027  glutamine synthetase  52.68 
 
 
469 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  52.68 
 
 
469 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4189  glutamine synthetase  52.68 
 
 
469 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  52.68 
 
 
469 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  52.89 
 
 
469 aa  501  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  52.68 
 
 
469 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  52.68 
 
 
469 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4346  glutamine synthetase  52.68 
 
 
469 aa  499  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  52.68 
 
 
469 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4881  glutamine synthetase  52.03 
 
 
469 aa  500  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567284  hitchhiker  0.000124189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  52.68 
 
 
469 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  52.68 
 
 
469 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  52.68 
 
 
469 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>