More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1073 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0131  glutamine synthetase, type I  63.3 
 
 		 469 aa  640    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000917861  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1073  glutamine synthetase, type I  100 
 
 		 475 aa  985    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1681  glutamine synthetase, type I  62.9 
 
 		 470 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000311602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  62.26 
 
 		 470 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  62.47 
 
 		 470 aa  615  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  62.69 
 
 		 470 aa  616  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  62.9 
 
 		 470 aa  617  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1501  glutamine synthetase, type I  62.05 
 
 		 469 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000036011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0576  glutamine synthetase, type I  62.9 
 
 		 470 aa  614  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  61.41 
 
 		 470 aa  611  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  60.98 
 
 		 470 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  59.79 
 
 		 474 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  59.79 
 
 		 474 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  59.79 
 
 		 474 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  59.36 
 
 		 474 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  59.66 
 
 		 473 aa  588  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1770  glutamine synthetase, type I  60.13 
 
 		 474 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3715  glutamine synthetase, type I  57.47 
 
 		 477 aa  575  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1891  glutamine synthetase, type I  60.34 
 
 		 472 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198707  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  58.64 
 
 		 470 aa  568  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0837  glutamine synthetase, type I  57.63 
 
 		 473 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  57.2 
 
 		 474 aa  566  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0808  glutamine synthetase, type I  57.63 
 
 		 473 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  58.17 
 
 		 473 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1262  glutamine synthetase, type I  56.99 
 
 		 474 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0975496  normal  0.0997444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3142  L-glutamine synthetase  58.85 
 
 		 474 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4220  glutamine synthetase  57.57 
 
 		 469 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4156  glutamine synthetase  57.2 
 
 		 469 aa  558  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35339  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2299  L-glutamine synthetase  57.38 
 
 		 475 aa  560  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00444261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4503  glutamine synthetase  57.36 
 
 		 469 aa  560  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664136  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0027  glutamine synthetase  56.93 
 
 		 469 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  56.93 
 
 		 469 aa  556  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3959  glutamine synthetase  56.99 
 
 		 469 aa  557  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1443  glutamine synthetase, type I  57.2 
 
 		 483 aa  556  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0199962  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4189  glutamine synthetase  56.93 
 
 		 469 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3102  glutamine synthetase, type I  57.69 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0143892  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4881  glutamine synthetase  56.72 
 
 		 469 aa  555  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567284  hitchhiker  0.000124189 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4318  glutamine synthetase, type I  56.96 
 
 		 476 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  56.93 
 
 		 469 aa  553  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  55.86 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  55.86 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03704  hypothetical protein  55.86 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3383  glutamine synthetase, type I  54.14 
 
 		 475 aa  549  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  55.86 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  55.86 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5316  glutamine synthetase  55.86 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.961991  normal  0.126376 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4346  glutamine synthetase  55.86 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0209  glutamine synthetase, type I  54.84 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  55.86 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  55.86 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  55.65 
 
 		 469 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1839  glutamine synthetase, type I  55.63 
 
 		 471 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4335  glutamine synthetase  55.65 
 
 		 469 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  55.65 
 
 		 469 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  57.08 
 
 		 469 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  55.3 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  55.65 
 
 		 469 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3834  L-glutamine synthetase  55.84 
 
 		 473 aa  546  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  55.65 
 
 		 469 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  54.64 
 
 		 473 aa  546  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1915  glutamine synthetase, type I  54.68 
 
 		 472 aa  545  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.031612  hitchhiker  0.00101897 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3291  glutamine synthetase, type I  55.65 
 
 		 474 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0215954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  55.44 
 
 		 474 aa  541  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15370  L-glutamine synthetase  56.14 
 
 		 474 aa  541  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2038  glutamine synthetase, type I  56.5 
 
 		 474 aa  544  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512125  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  56.13 
 
 		 469 aa  541  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0697  glutamine synthetase, type I  55.74 
 
 		 471 aa  544  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.817374 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1855  glutamine synthetase, type I  56.26 
 
 		 474 aa  542  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.636307 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0013  L-glutamine synthetase  53.5 
 
 		 471 aa  543  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778405 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0923  L-glutamine synthetase  55.3 
 
 		 474 aa  541  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  54.37 
 
 		 469 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2112  glutamine synthetase, type I  56.38 
 
 		 474 aa  540  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0742231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0828  glutamine synthetase  53.56 
 
 		 478 aa  538  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0141  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  53.81 
 
 		 473 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07731  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  53.81 
 
 		 473 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0667695 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  54.39 
 
 		 469 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0683  glutamine synthetase, type I  54.26 
 
 		 473 aa  540  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1255  glutamine synthetase, type I  55.53 
 
 		 471 aa  540  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.027099  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2295  L-glutamine synthetase  54.03 
 
 		 474 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1258  glutamine synthetase protein  54.99 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1947  glutamine synthetase, type I  54.99 
 
 		 491 aa  536  1e-151  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0400  glutamine synthetase  54.84 
 
 		 468 aa  538  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0641467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1743  glutamine synthetase, type I  54.47 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0103435  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00588  glutamine synthetase  54.6 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3763  L-glutamine synthetase  56.41 
 
 		 471 aa  537  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.382156  normal  0.0833573 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2634  glutamine synthetase, type I  54.47 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675717  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1217  glutamine synthetase, type I  53.5 
 
 		 471 aa  537  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2770  glutamine synthetase, type I  54.47 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001905  glutamine synthetase type I  54.18 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.168817  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2253  glutamine synthetase, type I  54.47 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07500  L-glutamine synthetase  54.99 
 
 		 474 aa  536  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1844  glutamine synthetase, type I  54.47 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.43293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2690  glutamine synthetase, type I  54.47 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10271  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  53.81 
 
 		 473 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.18298 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1524  glutamine synthetase, type I  54.47 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0626  glutamine synthetase, type I  53.94 
 
 		 471 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2940  glutamine synthetase  54.6 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0466  glutamine synthetase, type I  53.94 
 
 		 471 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3067  glutamine synthetase, type I  54.47 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  55.25 
 
 		 473 aa  537  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.162372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>