More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3373 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12249  glutamine synthetase glnA1  72.57 
 
 
478 aa  739    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.465808  normal  0.443746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07500  L-glutamine synthetase  70.02 
 
 
474 aa  715    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3331  L-glutamine synthetase  73 
 
 
478 aa  741    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  71.91 
 
 
474 aa  731    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7410  glutamine synthetase, type I  74.63 
 
 
474 aa  742    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2112  glutamine synthetase, type I  70.02 
 
 
474 aa  710    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0742231  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  71.28 
 
 
474 aa  711    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1594  glutamine synthetase, type I  64.78 
 
 
474 aa  641    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000352701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3102  glutamine synthetase, type I  71.28 
 
 
474 aa  734    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0143892  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1262  glutamine synthetase, type I  71.7 
 
 
474 aa  726    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0975496  normal  0.0997444 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0932  glutamine synthetase, type I  70.02 
 
 
474 aa  708    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.017954 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3291  glutamine synthetase, type I  73.79 
 
 
474 aa  733    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0215954 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1484  glutamine synthetase, type I  64.99 
 
 
474 aa  668    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.836953  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1855  glutamine synthetase, type I  70.02 
 
 
474 aa  705    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.636307 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3142  L-glutamine synthetase  69.18 
 
 
474 aa  703    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3568  glutamine synthetase, type I  73.58 
 
 
474 aa  745    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3080  glutamine synthetase, type I  73.17 
 
 
477 aa  750    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0496817  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4896  glutamine synthetase type I  71.91 
 
 
479 aa  734    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791455  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1915  glutamine synthetase, type I  72.75 
 
 
472 aa  737    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.031612  hitchhiker  0.00101897 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3373  glutamine synthetase, type I  100 
 
 
477 aa  986    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1510  glutamine synthetase, type I  73.17 
 
 
477 aa  759    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16410  L-glutamine synthetase  64.78 
 
 
474 aa  660    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0465358  normal  0.186154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3320  L-glutamine synthetase  73 
 
 
478 aa  741    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3332  glutamine synthetase, type I  72.75 
 
 
474 aa  738    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0195703  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0925  glutamine synthetase, type I  74.21 
 
 
474 aa  752    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16500  L-glutamine synthetase  67.51 
 
 
476 aa  683    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.399242  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15370  L-glutamine synthetase  71.07 
 
 
474 aa  716    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1600  L-glutamine synthetase  64.99 
 
 
474 aa  642    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2038  glutamine synthetase, type I  69.18 
 
 
474 aa  697    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512125  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2928  glutamine synthetase, type I  73.21 
 
 
478 aa  746    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.304351  normal  0.179293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0923  L-glutamine synthetase  72.75 
 
 
474 aa  741    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1770  glutamine synthetase, type I  70.44 
 
 
474 aa  707    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2295  L-glutamine synthetase  70.23 
 
 
474 aa  718    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3382  L-glutamine synthetase  73 
 
 
478 aa  741    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00327217  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3585  glutamine synthetase, type I  73.63 
 
 
478 aa  750    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0280122  normal  0.0233949 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0828  glutamine synthetase  62.39 
 
 
478 aa  629  1e-179  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1140  glutamine synthetase, type I  61.97 
 
 
478 aa  626  1e-178  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13400  L-glutamine synthetase  62.68 
 
 
474 aa  622  1e-177  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0496712  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0243  glutamine synthetase, type I  61.52 
 
 
475 aa  617  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.823516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2983  glutamine synthetase, type I  61.34 
 
 
474 aa  609  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55604  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  59.92 
 
 
470 aa  596  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1901  glutamine synthetase, type I  59.66 
 
 
474 aa  595  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.624126  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4318  glutamine synthetase, type I  58.39 
 
 
476 aa  591  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  58.02 
 
 
470 aa  588  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  58.44 
 
 
470 aa  588  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  59.07 
 
 
474 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  59.07 
 
 
474 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  58.23 
 
 
470 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2299  L-glutamine synthetase  57.65 
 
 
475 aa  581  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00444261  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  58.86 
 
 
474 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3383  glutamine synthetase, type I  57.81 
 
 
475 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1501  glutamine synthetase, type I  57.59 
 
 
469 aa  578  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000036011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  58.44 
 
 
474 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  58.02 
 
 
470 aa  581  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  56.81 
 
 
473 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  56.75 
 
 
470 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1390  glutamine synthetase, type I  58.56 
 
 
471 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3715  glutamine synthetase, type I  55.74 
 
 
477 aa  574  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  58.82 
 
 
473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0808  glutamine synthetase, type I  56.81 
 
 
473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0837  glutamine synthetase, type I  56.81 
 
 
473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  57.72 
 
 
470 aa  568  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1681  glutamine synthetase, type I  57.17 
 
 
470 aa  570  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000311602  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  55.46 
 
 
474 aa  565  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1443  glutamine synthetase, type I  56.9 
 
 
483 aa  565  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0199962  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0886  glutamine synthetase protein  56.75 
 
 
491 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0716545  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  55.35 
 
 
473 aa  561  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0576  glutamine synthetase, type I  57.17 
 
 
470 aa  562  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3834  L-glutamine synthetase  53.67 
 
 
473 aa  557  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1891  glutamine synthetase, type I  56.6 
 
 
472 aa  557  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198707  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0683  glutamine synthetase, type I  56.96 
 
 
473 aa  553  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1839  glutamine synthetase, type I  55.25 
 
 
471 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1628  glutamine synthetase, type I  53.14 
 
 
473 aa  542  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  54.41 
 
 
473 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09401  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  54.41 
 
 
473 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256855  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09391  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  54.41 
 
 
473 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0141  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  53.57 
 
 
473 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07731  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  53.78 
 
 
473 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0667695 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1265  glutamine synthetase type I  53.99 
 
 
473 aa  535  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10271  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  53.57 
 
 
473 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.18298 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16421  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  54.41 
 
 
473 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1947  glutamine synthetase, type I  52.52 
 
 
491 aa  533  1e-150  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1205  L-glutamine synthetase  53.78 
 
 
473 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.488763  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10031  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  53.99 
 
 
473 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.913163  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0448  glutamine synthetase, type I  57.05 
 
 
485 aa  530  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00416538 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1073  glutamine synthetase, type I  52.74 
 
 
475 aa  520  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3959  glutamine synthetase  53.38 
 
 
469 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  54.24 
 
 
473 aa  502  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0027  glutamine synthetase  53.38 
 
 
469 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4220  glutamine synthetase  53.16 
 
 
469 aa  499  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  53.38 
 
 
469 aa  501  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4189  glutamine synthetase  53.38 
 
 
469 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4881  glutamine synthetase  52.95 
 
 
469 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567284  hitchhiker  0.000124189 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  52.11 
 
 
469 aa  495  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  52.11 
 
 
469 aa  495  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  52.53 
 
 
469 aa  497  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2577  glutamine synthetase, type I  53.38 
 
 
469 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4503  glutamine synthetase  52.74 
 
 
469 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664136  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  52.11 
 
 
469 aa  495  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5316  glutamine synthetase  52.11 
 
 
469 aa  495  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.961991  normal  0.126376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>