More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1484 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_16500  L-glutamine synthetase  71.43 
 
 		 476 aa  744    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.399242  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0925  glutamine synthetase, type I  64.77 
 
 		 474 aa  675    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2928  glutamine synthetase, type I  64.35 
 
 		 478 aa  665    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.304351  normal  0.179293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1484  glutamine synthetase, type I  100 
 
 		 474 aa  983    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.836953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1855  glutamine synthetase, type I  77 
 
 		 474 aa  776    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.636307 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2112  glutamine synthetase, type I  74.05 
 
 		 474 aa  747    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0742231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  64.98 
 
 		 474 aa  659    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12249  glutamine synthetase glnA1  63.08 
 
 		 478 aa  658    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.465808  normal  0.443746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1770  glutamine synthetase, type I  64.56 
 
 		 474 aa  664    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3102  glutamine synthetase, type I  68.14 
 
 		 474 aa  699    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0143892  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1915  glutamine synthetase, type I  64.77 
 
 		 472 aa  667    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.031612  hitchhiker  0.00101897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1262  glutamine synthetase, type I  65.61 
 
 		 474 aa  672    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0975496  normal  0.0997444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3332  glutamine synthetase, type I  66.46 
 
 		 474 aa  679    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0195703  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16410  L-glutamine synthetase  71.94 
 
 		 474 aa  738    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0465358  normal  0.186154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3142  L-glutamine synthetase  63.92 
 
 		 474 aa  661    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3331  L-glutamine synthetase  63.29 
 
 		 478 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13400  L-glutamine synthetase  69.41 
 
 		 474 aa  704    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0496712  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3080  glutamine synthetase, type I  63.31 
 
 		 477 aa  654    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0496817  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3568  glutamine synthetase, type I  66.24 
 
 		 474 aa  677    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  67.93 
 
 		 474 aa  692    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4896  glutamine synthetase type I  66.46 
 
 		 479 aa  684    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0932  glutamine synthetase, type I  63.29 
 
 		 474 aa  657    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.017954 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0828  glutamine synthetase  65.34 
 
 		 478 aa  652    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3373  glutamine synthetase, type I  64.99 
 
 		 477 aa  668    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15370  L-glutamine synthetase  79.11 
 
 		 474 aa  798    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3320  L-glutamine synthetase  63.29 
 
 		 478 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2038  glutamine synthetase, type I  76.37 
 
 		 474 aa  767    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1594  glutamine synthetase, type I  68.35 
 
 		 474 aa  691    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000352701 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3291  glutamine synthetase, type I  71.52 
 
 		 474 aa  738    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0215954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1600  L-glutamine synthetase  68.14 
 
 		 474 aa  692    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7410  glutamine synthetase, type I  67.3 
 
 		 474 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3585  glutamine synthetase, type I  64.35 
 
 		 478 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0280122  normal  0.0233949 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0923  L-glutamine synthetase  68.99 
 
 		 474 aa  706    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07500  L-glutamine synthetase  67.72 
 
 		 474 aa  693    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2295  L-glutamine synthetase  67.3 
 
 		 474 aa  698    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1510  glutamine synthetase, type I  66.67 
 
 		 477 aa  689    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3382  L-glutamine synthetase  63.29 
 
 		 478 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00327217  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1140  glutamine synthetase, type I  64.5 
 
 		 478 aa  644    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0243  glutamine synthetase, type I  58.94 
 
 		 475 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.823516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2983  glutamine synthetase, type I  57.51 
 
 		 474 aa  577  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2299  L-glutamine synthetase  58.32 
 
 		 475 aa  577  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00444261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  57.54 
 
 		 474 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  56.75 
 
 		 473 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  56.12 
 
 		 473 aa  571  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  57.54 
 
 		 470 aa  568  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  57.75 
 
 		 470 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1901  glutamine synthetase, type I  56.03 
 
 		 474 aa  567  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.624126  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  56.9 
 
 		 474 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  56.9 
 
 		 474 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  56.9 
 
 		 474 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3834  L-glutamine synthetase  56.12 
 
 		 473 aa  568  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1443  glutamine synthetase, type I  56.84 
 
 		 483 aa  566  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0199962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  56.48 
 
 		 470 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0837  glutamine synthetase, type I  56.75 
 
 		 473 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  57.68 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4318  glutamine synthetase, type I  56.29 
 
 		 476 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3715  glutamine synthetase, type I  56.69 
 
 		 477 aa  562  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0808  glutamine synthetase, type I  56.75 
 
 		 473 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1681  glutamine synthetase, type I  57.11 
 
 		 470 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000311602  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1390  glutamine synthetase, type I  56.6 
 
 		 471 aa  560  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1265  glutamine synthetase type I  56.54 
 
 		 473 aa  558  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1205  L-glutamine synthetase  55.7 
 
 		 473 aa  558  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.488763  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  55.63 
 
 		 470 aa  555  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  56.9 
 
 		 470 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  56.45 
 
 		 473 aa  555  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1891  glutamine synthetase, type I  58.02 
 
 		 472 aa  553  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198707  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1501  glutamine synthetase, type I  56.69 
 
 		 469 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000036011  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10031  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  54.43 
 
 		 473 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.913163  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  54.97 
 
 		 473 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  56.26 
 
 		 470 aa  552  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10271  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  54.55 
 
 		 473 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.18298 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09401  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  54.76 
 
 		 473 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256855  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07731  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  54.55 
 
 		 473 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0667695 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09391  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  54.76 
 
 		 473 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0141  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  54.55 
 
 		 473 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1839  glutamine synthetase, type I  55.81 
 
 		 471 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  54.89 
 
 		 470 aa  546  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3383  glutamine synthetase, type I  56.05 
 
 		 475 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129415  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0886  glutamine synthetase protein  54.22 
 
 		 491 aa  541  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0716545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16421  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  54.43 
 
 		 473 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1628  glutamine synthetase, type I  53.89 
 
 		 473 aa  536  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  55.01 
 
 		 469 aa  525  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0683  glutamine synthetase, type I  53.5 
 
 		 473 aa  527  1e-148  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0576  glutamine synthetase, type I  54.14 
 
 		 470 aa  527  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4220  glutamine synthetase  54.14 
 
 		 469 aa  521  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3959  glutamine synthetase  54.58 
 
 		 469 aa  522  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  54.56 
 
 		 469 aa  522  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  53.72 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  53.72 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1318  glutamine synthetase  55.51 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1315  glutamine synthetase  55.51 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  53.72 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  53.72 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  53.72 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4335  glutamine synthetase  53.72 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  53.72 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4346  glutamine synthetase  53.72 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  53.72 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1947  glutamine synthetase, type I  53.29 
 
 		 491 aa  518  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  53.72 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>