More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0988 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3291  glutamine synthetase, type I  71.52 
 
 		 474 aa  712    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0215954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0925  glutamine synthetase, type I  69.62 
 
 		 474 aa  702    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13400  L-glutamine synthetase  64.98 
 
 		 474 aa  657    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0496712  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2112  glutamine synthetase, type I  71.52 
 
 		 474 aa  725    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0742231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1770  glutamine synthetase, type I  70.68 
 
 		 474 aa  723    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3332  glutamine synthetase, type I  69.41 
 
 		 474 aa  704    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0195703  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12249  glutamine synthetase glnA1  68.43 
 
 		 478 aa  674    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.465808  normal  0.443746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 474 aa  977    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1484  glutamine synthetase, type I  64.98 
 
 		 474 aa  659    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.836953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1594  glutamine synthetase, type I  65.4 
 
 		 474 aa  653    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000352701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4896  glutamine synthetase type I  70.04 
 
 		 479 aa  714    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3331  L-glutamine synthetase  68.29 
 
 		 478 aa  667    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3102  glutamine synthetase, type I  75.53 
 
 		 474 aa  768    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0143892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3373  glutamine synthetase, type I  71.28 
 
 		 477 aa  711    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3142  L-glutamine synthetase  68.78 
 
 		 474 aa  707    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2928  glutamine synthetase, type I  68.29 
 
 		 478 aa  669    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.304351  normal  0.179293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0932  glutamine synthetase, type I  83.54 
 
 		 474 aa  841    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.017954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1855  glutamine synthetase, type I  69.62 
 
 		 474 aa  698    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.636307 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2038  glutamine synthetase, type I  68.99 
 
 		 474 aa  694    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7410  glutamine synthetase, type I  72.15 
 
 		 474 aa  724    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3080  glutamine synthetase, type I  67.71 
 
 		 477 aa  667    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0496817  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07500  L-glutamine synthetase  70.04 
 
 		 474 aa  702    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3320  L-glutamine synthetase  68.29 
 
 		 478 aa  667    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3568  glutamine synthetase, type I  68.99 
 
 		 474 aa  702    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16410  L-glutamine synthetase  64.77 
 
 		 474 aa  655    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0465358  normal  0.186154 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16500  L-glutamine synthetase  67.23 
 
 		 476 aa  666    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.399242  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1510  glutamine synthetase, type I  67.71 
 
 		 477 aa  679    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1262  glutamine synthetase, type I  76.16 
 
 		 474 aa  768    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0975496  normal  0.0997444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1600  L-glutamine synthetase  65.19 
 
 		 474 aa  653    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  75.95 
 
 		 474 aa  759    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0923  L-glutamine synthetase  73.84 
 
 		 474 aa  735    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15370  L-glutamine synthetase  70.68 
 
 		 474 aa  709    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2295  L-glutamine synthetase  67.3 
 
 		 474 aa  683    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3382  L-glutamine synthetase  68.29 
 
 		 478 aa  667    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00327217  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1915  glutamine synthetase, type I  68.35 
 
 		 472 aa  682    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.031612  hitchhiker  0.00101897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3585  glutamine synthetase, type I  69.13 
 
 		 478 aa  673    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0280122  normal  0.0233949 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  63.21 
 
 		 473 aa  624  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2983  glutamine synthetase, type I  62.39 
 
 		 474 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1140  glutamine synthetase, type I  62.08 
 
 		 478 aa  608  1e-173  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1901  glutamine synthetase, type I  61.54 
 
 		 474 aa  610  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.624126  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1891  glutamine synthetase, type I  62.24 
 
 		 472 aa  608  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4318  glutamine synthetase, type I  60.97 
 
 		 476 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0828  glutamine synthetase  62.39 
 
 		 478 aa  607  9.999999999999999e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  60.68 
 
 		 470 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2299  L-glutamine synthetase  60 
 
 		 475 aa  598  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00444261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  58.49 
 
 		 474 aa  595  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  58.44 
 
 		 473 aa  594  1e-169  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0243  glutamine synthetase, type I  59.62 
 
 		 475 aa  596  1e-169  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.823516  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  60.09 
 
 		 470 aa  591  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  58.55 
 
 		 473 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  58.76 
 
 		 470 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0808  glutamine synthetase, type I  58.44 
 
 		 473 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  58.97 
 
 		 470 aa  588  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0837  glutamine synthetase, type I  58.44 
 
 		 473 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  60.53 
 
 		 474 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  58.33 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  60.53 
 
 		 474 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  58.97 
 
 		 474 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3834  L-glutamine synthetase  56.33 
 
 		 473 aa  587  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  58.33 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1681  glutamine synthetase, type I  58.12 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000311602  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1390  glutamine synthetase, type I  58.24 
 
 		 471 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  60.31 
 
 		 474 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1501  glutamine synthetase, type I  59.19 
 
 		 469 aa  579  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000036011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  57.26 
 
 		 470 aa  581  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  57.17 
 
 		 473 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0576  glutamine synthetase, type I  58.55 
 
 		 470 aa  578  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09401  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  56.96 
 
 		 473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256855  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07731  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  56.54 
 
 		 473 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0667695 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3715  glutamine synthetase, type I  56.9 
 
 		 477 aa  575  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0141  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  56.54 
 
 		 473 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10031  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  56.75 
 
 		 473 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.913163  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10271  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  56.62 
 
 		 473 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.18298 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09391  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  56.96 
 
 		 473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1839  glutamine synthetase, type I  57.93 
 
 		 471 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0886  glutamine synthetase protein  57.17 
 
 		 491 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0716545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3959  glutamine synthetase  58.81 
 
 		 469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16421  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  57.17 
 
 		 473 aa  571  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0027  glutamine synthetase  58.17 
 
 		 469 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  58.17 
 
 		 469 aa  569  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4189  glutamine synthetase  58.17 
 
 		 469 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4220  glutamine synthetase  57.96 
 
 		 469 aa  566  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1947  glutamine synthetase, type I  57.32 
 
 		 491 aa  567  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  58.39 
 
 		 469 aa  566  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4881  glutamine synthetase  57.54 
 
 		 469 aa  567  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567284  hitchhiker  0.000124189 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1443  glutamine synthetase, type I  58.1 
 
 		 483 aa  566  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0199962  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4503  glutamine synthetase  57.54 
 
 		 469 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664136  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4156  glutamine synthetase  57.96 
 
 		 469 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35339  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1265  glutamine synthetase type I  55.49 
 
 		 473 aa  562  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  57.96 
 
 		 469 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  57.54 
 
 		 469 aa  561  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  57.54 
 
 		 469 aa  561  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  57.54 
 
 		 469 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  57.54 
 
 		 469 aa  561  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  57.54 
 
 		 469 aa  561  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1205  L-glutamine synthetase  55.27 
 
 		 473 aa  561  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.488763  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  57.54 
 
 		 469 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  57.54 
 
 		 469 aa  561  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  57.54 
 
 		 469 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  57.54 
 
 		 469 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>