More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1265 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_09391  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  86.05 
 
 
473 aa  869    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0141  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  86.47 
 
 
473 aa  874    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1839  glutamine synthetase, type I  67.52 
 
 
471 aa  669    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  63.85 
 
 
474 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1265  glutamine synthetase type I  100 
 
 
473 aa  988    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1205  L-glutamine synthetase  93.02 
 
 
473 aa  934    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.488763  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07731  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  86.68 
 
 
473 aa  877    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0667695 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  86.26 
 
 
473 aa  870    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  66.88 
 
 
473 aa  677    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09401  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  86.26 
 
 
473 aa  871    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256855  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16421  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  86.89 
 
 
473 aa  875    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0837  glutamine synthetase, type I  66.46 
 
 
473 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  66.03 
 
 
473 aa  675    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3834  L-glutamine synthetase  65.4 
 
 
473 aa  663    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10271  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  86.05 
 
 
473 aa  862    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.18298 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10031  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  86.05 
 
 
473 aa  867    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.913163  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0808  glutamine synthetase, type I  66.46 
 
 
473 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3715  glutamine synthetase, type I  65.55 
 
 
477 aa  657    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0243  glutamine synthetase, type I  60.17 
 
 
475 aa  592  1e-168  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.823516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1770  glutamine synthetase, type I  58.77 
 
 
474 aa  588  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3142  L-glutamine synthetase  58.56 
 
 
474 aa  585  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  59.2 
 
 
473 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4318  glutamine synthetase, type I  56.33 
 
 
476 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13400  L-glutamine synthetase  58.47 
 
 
474 aa  579  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0496712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2299  L-glutamine synthetase  56.72 
 
 
475 aa  575  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00444261  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3102  glutamine synthetase, type I  57.81 
 
 
474 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0143892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  58.21 
 
 
470 aa  575  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0932  glutamine synthetase, type I  57.29 
 
 
474 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.017954 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  56.6 
 
 
474 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1855  glutamine synthetase, type I  57.29 
 
 
474 aa  570  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.636307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  56.33 
 
 
474 aa  568  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  57.17 
 
 
474 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  56.96 
 
 
474 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  56.96 
 
 
474 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2038  glutamine synthetase, type I  56.75 
 
 
474 aa  569  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512125  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1262  glutamine synthetase, type I  56.12 
 
 
474 aa  565  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0975496  normal  0.0997444 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15370  L-glutamine synthetase  56.87 
 
 
474 aa  566  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07500  L-glutamine synthetase  56.96 
 
 
474 aa  565  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1901  glutamine synthetase, type I  56.75 
 
 
474 aa  566  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.624126  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1891  glutamine synthetase, type I  56.99 
 
 
472 aa  565  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198707  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0923  L-glutamine synthetase  56.96 
 
 
474 aa  565  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  55.49 
 
 
474 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2983  glutamine synthetase, type I  56.12 
 
 
474 aa  561  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55604  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  58.33 
 
 
469 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3315  glutamine synthetase, type I  58.55 
 
 
469 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651786  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3291  glutamine synthetase, type I  56.66 
 
 
474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0215954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1600  L-glutamine synthetase  56.57 
 
 
474 aa  562  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1594  glutamine synthetase, type I  56.57 
 
 
474 aa  562  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000352701 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  57.36 
 
 
469 aa  558  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  57.11 
 
 
470 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1443  glutamine synthetase, type I  55.56 
 
 
483 aa  561  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0199962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2112  glutamine synthetase, type I  57.17 
 
 
474 aa  558  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0742231  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2615  glutamine synthetase, type I  56.9 
 
 
471 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0119922  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1628  glutamine synthetase, type I  55.7 
 
 
473 aa  556  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1484  glutamine synthetase, type I  56.54 
 
 
474 aa  558  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.836953  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  57.36 
 
 
469 aa  558  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1122  glutamine synthetase, type I  57.11 
 
 
471 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744153  normal  0.286491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  57.11 
 
 
470 aa  558  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  57.51 
 
 
469 aa  557  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  57.69 
 
 
469 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2979  glutamine synthetase, type I  56.69 
 
 
471 aa  556  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7410  glutamine synthetase, type I  56.45 
 
 
474 aa  557  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1807  L-glutamine synthetase  56.48 
 
 
471 aa  555  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000345989 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  57.36 
 
 
469 aa  557  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1481  glutamine synthetase, type I  57.11 
 
 
471 aa  557  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.494323  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  57.23 
 
 
470 aa  557  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2295  L-glutamine synthetase  54.12 
 
 
474 aa  557  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  56.38 
 
 
470 aa  554  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  57.48 
 
 
469 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  56.6 
 
 
470 aa  553  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3383  glutamine synthetase, type I  55.6 
 
 
475 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  57.48 
 
 
469 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5928  glutamine synthetase, type I  56.48 
 
 
471 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2167  glutamine synthetase, type I  56.48 
 
 
471 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2186  glutamine synthetase, type I  56.26 
 
 
471 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2059  glutamine synthetase, type I  56.48 
 
 
471 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2149  glutamine synthetase, type I  56.48 
 
 
471 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3067  glutamine synthetase, type I  56.48 
 
 
471 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2253  glutamine synthetase, type I  56.48 
 
 
471 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1743  glutamine synthetase, type I  56.48 
 
 
471 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0103435  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2634  glutamine synthetase, type I  56.48 
 
 
471 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675717  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2770  glutamine synthetase, type I  56.48 
 
 
471 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1524  glutamine synthetase, type I  56.48 
 
 
471 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1501  glutamine synthetase, type I  57.96 
 
 
469 aa  549  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000036011  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5458  L-glutamine synthetase  56.05 
 
 
471 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1255  glutamine synthetase, type I  57.32 
 
 
471 aa  550  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.027099  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1522  L-glutamine synthetase  56.48 
 
 
471 aa  551  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000686427  normal  0.138561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  55.74 
 
 
470 aa  548  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  56.38 
 
 
470 aa  550  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16500  L-glutamine synthetase  55.58 
 
 
476 aa  550  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.399242  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2690  glutamine synthetase, type I  56.48 
 
 
471 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0886  glutamine synthetase protein  54.85 
 
 
491 aa  547  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0716545  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2780  glutamine synthetase, type I  56.05 
 
 
471 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481689  hitchhiker  0.00799964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  56.84 
 
 
469 aa  547  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  55.11 
 
 
470 aa  545  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00588  glutamine synthetase  56.65 
 
 
469 aa  548  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1844  glutamine synthetase, type I  56.26 
 
 
471 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.43293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0925  glutamine synthetase, type I  54.64 
 
 
474 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3581  glutamine synthetase, type I  56.05 
 
 
471 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2577  glutamine synthetase, type I  56.99 
 
 
469 aa  545  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>