More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0147 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4318  glutamine synthetase, type I  62.92 
 
 
476 aa  636    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0837  glutamine synthetase, type I  78.81 
 
 
473 aa  788    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0141  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  64.06 
 
 
473 aa  649    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  100 
 
 
474 aa  990    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1265  glutamine synthetase type I  63.85 
 
 
473 aa  645    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07731  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  64.06 
 
 
473 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0667695 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  78.81 
 
 
473 aa  795    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1839  glutamine synthetase, type I  77 
 
 
471 aa  771    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3715  glutamine synthetase, type I  87.42 
 
 
477 aa  886    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3834  L-glutamine synthetase  77.64 
 
 
473 aa  779    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0808  glutamine synthetase, type I  78.81 
 
 
473 aa  788    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  79.03 
 
 
473 aa  784    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1205  L-glutamine synthetase  61.73 
 
 
473 aa  632  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.488763  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16421  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  62.79 
 
 
473 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10271  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  62 
 
 
473 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.18298 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  62.37 
 
 
473 aa  624  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09401  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  62.16 
 
 
473 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256855  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09391  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  62.16 
 
 
473 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2299  L-glutamine synthetase  62.16 
 
 
475 aa  624  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00444261  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10031  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  62.63 
 
 
473 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.913163  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  61.23 
 
 
470 aa  618  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  61.44 
 
 
470 aa  618  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1891  glutamine synthetase, type I  62.37 
 
 
472 aa  619  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3102  glutamine synthetase, type I  61.05 
 
 
474 aa  615  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0143892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  61.02 
 
 
470 aa  615  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0576  glutamine synthetase, type I  61.23 
 
 
470 aa  614  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  60.34 
 
 
470 aa  613  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  60.59 
 
 
470 aa  608  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  61.02 
 
 
474 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  61.02 
 
 
474 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  59.75 
 
 
470 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1501  glutamine synthetase, type I  60.59 
 
 
469 aa  606  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000036011  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  61.02 
 
 
474 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  59.32 
 
 
470 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1681  glutamine synthetase, type I  60.59 
 
 
470 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000311602  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  59.58 
 
 
474 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  59.75 
 
 
474 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1901  glutamine synthetase, type I  58.77 
 
 
474 aa  600  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.624126  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  58.49 
 
 
474 aa  595  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1443  glutamine synthetase, type I  57.74 
 
 
483 aa  595  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0199962  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0923  L-glutamine synthetase  59.83 
 
 
474 aa  595  1e-169  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2983  glutamine synthetase, type I  58.14 
 
 
474 aa  592  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55604  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3383  glutamine synthetase, type I  57.72 
 
 
475 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129415  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1262  glutamine synthetase, type I  58.74 
 
 
474 aa  592  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0975496  normal  0.0997444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1770  glutamine synthetase, type I  59.16 
 
 
474 aa  588  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2295  L-glutamine synthetase  57.72 
 
 
474 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0932  glutamine synthetase, type I  56 
 
 
474 aa  578  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.017954 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12249  glutamine synthetase glnA1  57.17 
 
 
478 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.465808  normal  0.443746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3142  L-glutamine synthetase  57.68 
 
 
474 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15370  L-glutamine synthetase  59.41 
 
 
474 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2928  glutamine synthetase, type I  56.96 
 
 
478 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.304351  normal  0.179293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2038  glutamine synthetase, type I  57.77 
 
 
474 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512125  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1855  glutamine synthetase, type I  57.05 
 
 
474 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.636307 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1510  glutamine synthetase, type I  55.88 
 
 
477 aa  572  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3585  glutamine synthetase, type I  56.96 
 
 
478 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0280122  normal  0.0233949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3291  glutamine synthetase, type I  55.79 
 
 
474 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0215954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7410  glutamine synthetase, type I  55.79 
 
 
474 aa  568  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  57.32 
 
 
473 aa  571  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1482  glutamine synthetase, type I  59.24 
 
 
486 aa  565  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.140298 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1628  glutamine synthetase, type I  56.18 
 
 
473 aa  565  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1073  glutamine synthetase, type I  57.2 
 
 
475 aa  566  1e-160  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07500  L-glutamine synthetase  56.12 
 
 
474 aa  565  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3373  glutamine synthetase, type I  55.46 
 
 
477 aa  565  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3080  glutamine synthetase, type I  55.37 
 
 
477 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0496817  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2375  glutamine synthetase  59.07 
 
 
469 aa  564  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3331  L-glutamine synthetase  55.49 
 
 
478 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3320  L-glutamine synthetase  55.49 
 
 
478 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1484  glutamine synthetase, type I  57.68 
 
 
474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.836953  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3382  L-glutamine synthetase  55.49 
 
 
478 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00327217  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  58.02 
 
 
469 aa  560  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0243  glutamine synthetase, type I  55.84 
 
 
475 aa  560  1e-158  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.823516  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2112  glutamine synthetase, type I  56 
 
 
474 aa  557  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0742231  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1920  glutamine synthetase, type I  58.26 
 
 
469 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1390  glutamine synthetase, type I  54.24 
 
 
471 aa  555  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3315  glutamine synthetase, type I  59.32 
 
 
469 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651786  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  56.93 
 
 
469 aa  556  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  59.11 
 
 
469 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  58.02 
 
 
469 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1736  glutamine synthetase, type I  58.47 
 
 
469 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.654979  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0886  glutamine synthetase protein  55.51 
 
 
491 aa  552  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0716545  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  58.9 
 
 
469 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  59.11 
 
 
469 aa  554  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1947  glutamine synthetase, type I  55.84 
 
 
491 aa  553  1e-156  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1915  glutamine synthetase, type I  54.53 
 
 
472 aa  551  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.031612  hitchhiker  0.00101897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2076  L-glutamine synthetase  56.17 
 
 
472 aa  548  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943231  normal  0.983586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4831  L-glutamine synthetase  58.67 
 
 
470 aa  548  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  58.47 
 
 
469 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1594  glutamine synthetase, type I  54.97 
 
 
474 aa  548  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000352701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0925  glutamine synthetase, type I  54.89 
 
 
474 aa  548  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1544  L-glutamine synthetase  56.96 
 
 
469 aa  550  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  56.84 
 
 
469 aa  547  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  58.02 
 
 
469 aa  546  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4896  glutamine synthetase type I  54.32 
 
 
479 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791455  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0970  glutamine synthetase, type I  56.84 
 
 
469 aa  547  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.545228  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3581  glutamine synthetase, type I  55.96 
 
 
471 aa  547  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1600  L-glutamine synthetase  54.97 
 
 
474 aa  548  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  55.96 
 
 
469 aa  542  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13400  L-glutamine synthetase  54.53 
 
 
474 aa  542  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0496712  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4156  glutamine synthetase  54.89 
 
 
469 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0683  glutamine synthetase, type I  54.24 
 
 
473 aa  543  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>