More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2156 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  63.54 
 
 		 474 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  63.54 
 
 		 470 aa  636    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  65.03 
 
 		 470 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3102  glutamine synthetase, type I  62.03 
 
 		 474 aa  634    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0143892  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10271  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  65.82 
 
 		 473 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.18298 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09391  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  67.3 
 
 		 473 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  83.09 
 
 		 473 aa  830    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0141  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  67.3 
 
 		 473 aa  687    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16421  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  65.82 
 
 		 473 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  64.18 
 
 		 470 aa  644    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  78.81 
 
 		 474 aa  795    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1839  glutamine synthetase, type I  85.11 
 
 		 471 aa  847    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  63.54 
 
 		 474 aa  644    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  63.97 
 
 		 470 aa  639    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1265  glutamine synthetase type I  66.88 
 
 		 473 aa  677    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1205  L-glutamine synthetase  65.82 
 
 		 473 aa  671    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.488763  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  63.54 
 
 		 470 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  67.51 
 
 		 473 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 473 aa  988    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  63.42 
 
 		 474 aa  646    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  63.54 
 
 		 474 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09401  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  67.3 
 
 		 473 aa  682    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256855  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10031  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  66.88 
 
 		 473 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.913163  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0837  glutamine synthetase, type I  82.24 
 
 		 473 aa  826    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1891  glutamine synthetase, type I  65.33 
 
 		 472 aa  645    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198707  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0808  glutamine synthetase, type I  82.24 
 
 		 473 aa  826    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3834  L-glutamine synthetase  80.34 
 
 		 473 aa  811    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07731  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  67.3 
 
 		 473 aa  687    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0667695 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4318  glutamine synthetase, type I  63.71 
 
 		 476 aa  650    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3715  glutamine synthetase, type I  78.11 
 
 		 477 aa  791    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  63.97 
 
 		 470 aa  634    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  61.37 
 
 		 470 aa  631  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1681  glutamine synthetase, type I  63.33 
 
 		 470 aa  631  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000311602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1443  glutamine synthetase, type I  60.93 
 
 		 483 aa  628  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0199962  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2983  glutamine synthetase, type I  62.03 
 
 		 474 aa  626  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0576  glutamine synthetase, type I  62.34 
 
 		 470 aa  625  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1501  glutamine synthetase, type I  63.19 
 
 		 469 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000036011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1901  glutamine synthetase, type I  61.6 
 
 		 474 aa  619  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.624126  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2299  L-glutamine synthetase  61.26 
 
 		 475 aa  620  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00444261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1262  glutamine synthetase, type I  60.34 
 
 		 474 aa  618  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0975496  normal  0.0997444 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15370  L-glutamine synthetase  60.76 
 
 		 474 aa  614  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  61.18 
 
 		 473 aa  611  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1770  glutamine synthetase, type I  60.34 
 
 		 474 aa  608  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  58.86 
 
 		 474 aa  609  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0923  L-glutamine synthetase  60.34 
 
 		 474 aa  610  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1855  glutamine synthetase, type I  59.7 
 
 		 474 aa  606  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.636307 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3291  glutamine synthetase, type I  58.86 
 
 		 474 aa  604  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0215954 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0243  glutamine synthetase, type I  60.25 
 
 		 475 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.823516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3142  L-glutamine synthetase  59.49 
 
 		 474 aa  600  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07500  L-glutamine synthetase  58.65 
 
 		 474 aa  597  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  58.44 
 
 		 474 aa  594  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0683  glutamine synthetase, type I  59.06 
 
 		 473 aa  596  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2112  glutamine synthetase, type I  59.06 
 
 		 474 aa  597  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0742231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2295  L-glutamine synthetase  57.72 
 
 		 474 aa  595  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2038  glutamine synthetase, type I  57.38 
 
 		 474 aa  593  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512125  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1628  glutamine synthetase, type I  57.47 
 
 		 473 aa  591  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1594  glutamine synthetase, type I  56.99 
 
 		 474 aa  588  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000352701 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1073  glutamine synthetase, type I  59.66 
 
 		 475 aa  588  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7410  glutamine synthetase, type I  58.35 
 
 		 474 aa  590  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1600  L-glutamine synthetase  57.2 
 
 		 474 aa  591  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3383  glutamine synthetase, type I  58.51 
 
 		 475 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0925  glutamine synthetase, type I  57.81 
 
 		 474 aa  586  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13400  L-glutamine synthetase  57.05 
 
 		 474 aa  582  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0496712  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0886  glutamine synthetase protein  57.77 
 
 		 491 aa  579  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0716545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  59.4 
 
 		 469 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3585  glutamine synthetase, type I  59.49 
 
 		 471 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0932  glutamine synthetase, type I  55.91 
 
 		 474 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.017954 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2928  glutamine synthetase, type I  57.05 
 
 		 478 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.304351  normal  0.179293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12249  glutamine synthetase glnA1  57.47 
 
 		 478 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.465808  normal  0.443746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3332  glutamine synthetase, type I  57.36 
 
 		 474 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0195703  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3080  glutamine synthetase, type I  56.18 
 
 		 477 aa  574  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0496817  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3568  glutamine synthetase, type I  56.29 
 
 		 474 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1510  glutamine synthetase, type I  56.39 
 
 		 477 aa  573  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4896  glutamine synthetase type I  56.41 
 
 		 479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3585  glutamine synthetase, type I  57.05 
 
 		 478 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0280122  normal  0.0233949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1484  glutamine synthetase, type I  56.12 
 
 		 474 aa  571  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.836953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3331  L-glutamine synthetase  56.84 
 
 		 478 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1482  glutamine synthetase, type I  58.39 
 
 		 486 aa  568  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.140298 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3320  L-glutamine synthetase  56.84 
 
 		 478 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3382  L-glutamine synthetase  56.84 
 
 		 478 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00327217  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1390  glutamine synthetase, type I  55.63 
 
 		 471 aa  566  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16500  L-glutamine synthetase  56.3 
 
 		 476 aa  565  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.399242  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  58.81 
 
 		 470 aa  565  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3373  glutamine synthetase, type I  55.35 
 
 		 477 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3315  glutamine synthetase, type I  59.83 
 
 		 469 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651786  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  58.39 
 
 		 470 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  59.4 
 
 		 469 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  59.4 
 
 		 469 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  57.91 
 
 		 469 aa  561  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4831  L-glutamine synthetase  58.39 
 
 		 470 aa  557  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  59.28 
 
 		 469 aa  557  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1736  glutamine synthetase, type I  57.69 
 
 		 469 aa  558  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.654979  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  57.23 
 
 		 469 aa  555  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2375  glutamine synthetase  57.48 
 
 		 469 aa  557  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1216  glutamine synthetase, type I  59.7 
 
 		 469 aa  556  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3057  glutamine synthetase, type I  56.48 
 
 		 477 aa  556  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  59.19 
 
 		 469 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  59.49 
 
 		 469 aa  557  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1920  glutamine synthetase, type I  57.69 
 
 		 469 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4220  glutamine synthetase  55.98 
 
 		 469 aa  551  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>