More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0683 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0683  glutamine synthetase, type I  100 
 
 		 473 aa  990    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  63.71 
 
 		 474 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  63.71 
 
 		 474 aa  648    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  63.71 
 
 		 474 aa  647    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  63.71 
 
 		 474 aa  648    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  62 
 
 		 470 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  61.15 
 
 		 470 aa  621  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  60.93 
 
 		 470 aa  618  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0576  glutamine synthetase, type I  61.36 
 
 		 470 aa  617  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  60.3 
 
 		 470 aa  617  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  60.51 
 
 		 470 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  60.08 
 
 		 470 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4318  glutamine synthetase, type I  58.55 
 
 		 476 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1501  glutamine synthetase, type I  59.79 
 
 		 469 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000036011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2299  L-glutamine synthetase  60.04 
 
 		 475 aa  601  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00444261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1681  glutamine synthetase, type I  59.24 
 
 		 470 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000311602  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  59.06 
 
 		 473 aa  596  1e-169  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  58.72 
 
 		 473 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0808  glutamine synthetase, type I  58.72 
 
 		 473 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1839  glutamine synthetase, type I  59.7 
 
 		 471 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0837  glutamine synthetase, type I  58.72 
 
 		 473 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3834  L-glutamine synthetase  57.36 
 
 		 473 aa  588  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  59.02 
 
 		 470 aa  589  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2983  glutamine synthetase, type I  59.24 
 
 		 474 aa  581  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1891  glutamine synthetase, type I  58.9 
 
 		 472 aa  580  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198707  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1443  glutamine synthetase, type I  58.97 
 
 		 483 aa  580  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0199962  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0923  L-glutamine synthetase  58.97 
 
 		 474 aa  580  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1901  glutamine synthetase, type I  58.6 
 
 		 474 aa  576  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.624126  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0886  glutamine synthetase protein  57.17 
 
 		 491 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0716545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3102  glutamine synthetase, type I  58.55 
 
 		 474 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0143892  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0243  glutamine synthetase, type I  57.17 
 
 		 475 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.823516  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  58.39 
 
 		 473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3142  L-glutamine synthetase  57.48 
 
 		 474 aa  570  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4896  glutamine synthetase type I  57.32 
 
 		 479 aa  568  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1770  glutamine synthetase, type I  57.48 
 
 		 474 aa  566  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  56.84 
 
 		 474 aa  565  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1262  glutamine synthetase, type I  57.26 
 
 		 474 aa  568  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0975496  normal  0.0997444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3383  glutamine synthetase, type I  55.6 
 
 		 475 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129415  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1855  glutamine synthetase, type I  57.32 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.636307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1390  glutamine synthetase, type I  56.05 
 
 		 471 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07500  L-glutamine synthetase  58.39 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0925  glutamine synthetase, type I  56.26 
 
 		 474 aa  561  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3715  glutamine synthetase, type I  55.06 
 
 		 477 aa  557  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0932  glutamine synthetase, type I  56.62 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.017954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7410  glutamine synthetase, type I  56.62 
 
 		 474 aa  552  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3373  glutamine synthetase, type I  56.96 
 
 		 477 aa  553  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2112  glutamine synthetase, type I  56.6 
 
 		 474 aa  554  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0742231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3291  glutamine synthetase, type I  55.98 
 
 		 474 aa  550  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0215954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2295  L-glutamine synthetase  54.91 
 
 		 474 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07731  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  55.53 
 
 		 473 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0667695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  56.84 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15370  L-glutamine synthetase  55.77 
 
 		 474 aa  545  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09401  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  55.96 
 
 		 473 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256855  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12249  glutamine synthetase glnA1  54.6 
 
 		 478 aa  543  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.465808  normal  0.443746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3332  glutamine synthetase, type I  55.53 
 
 		 474 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0195703  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3568  glutamine synthetase, type I  55.53 
 
 		 474 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0141  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  55.32 
 
 		 473 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  54.24 
 
 		 474 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09391  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  55.96 
 
 		 473 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1265  glutamine synthetase type I  55.53 
 
 		 473 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10031  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  55.74 
 
 		 473 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.913163  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  55.96 
 
 		 473 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10271  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  55.22 
 
 		 473 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.18298 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2038  glutamine synthetase, type I  55.34 
 
 		 474 aa  538  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512125  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1073  glutamine synthetase, type I  54.26 
 
 		 475 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2928  glutamine synthetase, type I  53.97 
 
 		 478 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.304351  normal  0.179293 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1205  L-glutamine synthetase  55.11 
 
 		 473 aa  535  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.488763  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3585  glutamine synthetase, type I  53.77 
 
 		 478 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0280122  normal  0.0233949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1510  glutamine synthetase, type I  53.8 
 
 		 477 aa  532  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13400  L-glutamine synthetase  55.41 
 
 		 474 aa  532  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0496712  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16421  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  54.68 
 
 		 473 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0131  glutamine synthetase, type I  54.22 
 
 		 469 aa  533  1e-150  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000917861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3331  L-glutamine synthetase  53.77 
 
 		 478 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3320  L-glutamine synthetase  53.77 
 
 		 478 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3382  L-glutamine synthetase  53.77 
 
 		 478 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00327217  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  53.93 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1484  glutamine synthetase, type I  53.5 
 
 		 474 aa  527  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.836953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3080  glutamine synthetase, type I  53.93 
 
 		 477 aa  527  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0496817  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  54.49 
 
 		 473 aa  526  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1947  glutamine synthetase, type I  53.28 
 
 		 491 aa  523  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16500  L-glutamine synthetase  54.55 
 
 		 476 aa  522  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.399242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1594  glutamine synthetase, type I  54.35 
 
 		 474 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000352701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1915  glutamine synthetase, type I  54.24 
 
 		 472 aa  524  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.031612  hitchhiker  0.00101897 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4220  glutamine synthetase  52.87 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1628  glutamine synthetase, type I  53.36 
 
 		 473 aa  519  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4881  glutamine synthetase  53.29 
 
 		 469 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567284  hitchhiker  0.000124189 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  53.29 
 
 		 469 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  53.29 
 
 		 469 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4346  glutamine synthetase  53.29 
 
 		 469 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  52.65 
 
 		 469 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  52.65 
 
 		 469 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  53.29 
 
 		 469 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  52.65 
 
 		 469 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03704  hypothetical protein  53.29 
 
 		 469 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  53.29 
 
 		 469 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4503  glutamine synthetase  52.65 
 
 		 469 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5316  glutamine synthetase  53.29 
 
 		 469 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.961991  normal  0.126376 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  53.29 
 
 		 469 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1600  L-glutamine synthetase  53.93 
 
 		 474 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  52.87 
 
 		 469 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>