More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0131 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1073  glutamine synthetase, type I  63.3 
 
 		 475 aa  640    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0131  glutamine synthetase, type I  100 
 
 		 469 aa  976    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000917861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  61.47 
 
 		 474 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  61.26 
 
 		 474 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  61.47 
 
 		 474 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  60.21 
 
 		 474 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0576  glutamine synthetase, type I  60.04 
 
 		 470 aa  580  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  60.26 
 
 		 470 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  60.47 
 
 		 470 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  60.04 
 
 		 470 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  59.62 
 
 		 470 aa  569  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  60.04 
 
 		 470 aa  569  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  59.62 
 
 		 470 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1443  glutamine synthetase, type I  57.75 
 
 		 483 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0199962  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1681  glutamine synthetase, type I  58.76 
 
 		 470 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000311602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4318  glutamine synthetase, type I  57.84 
 
 		 476 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1501  glutamine synthetase, type I  58.12 
 
 		 469 aa  554  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000036011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2299  L-glutamine synthetase  56.6 
 
 		 475 aa  553  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00444261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1891  glutamine synthetase, type I  58.85 
 
 		 472 aa  551  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198707  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  57.14 
 
 		 473 aa  550  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  57.87 
 
 		 473 aa  543  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3383  glutamine synthetase, type I  54.35 
 
 		 475 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129415  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  54.16 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  54.16 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  54.16 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1839  glutamine synthetase, type I  57.36 
 
 		 471 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4346  glutamine synthetase  54.16 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  54.16 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03704  hypothetical protein  54.16 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  54.16 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  56.93 
 
 		 473 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5316  glutamine synthetase  54.16 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.961991  normal  0.126376 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0013  L-glutamine synthetase  54.8 
 
 		 471 aa  536  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778405 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  54.16 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  54.12 
 
 		 473 aa  536  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  53.73 
 
 		 469 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  53.73 
 
 		 469 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  55.93 
 
 		 474 aa  531  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1262  glutamine synthetase, type I  55.2 
 
 		 474 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0975496  normal  0.0997444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  53.73 
 
 		 469 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1770  glutamine synthetase, type I  55.81 
 
 		 474 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3102  glutamine synthetase, type I  56.03 
 
 		 474 aa  532  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0143892  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0683  glutamine synthetase, type I  54.22 
 
 		 473 aa  533  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  56.05 
 
 		 470 aa  534  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  53.73 
 
 		 469 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1947  glutamine synthetase, type I  55.65 
 
 		 491 aa  533  1e-150  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4335  glutamine synthetase  53.73 
 
 		 469 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  54.97 
 
 		 474 aa  531  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0837  glutamine synthetase, type I  56.93 
 
 		 473 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  53.09 
 
 		 469 aa  529  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0027  glutamine synthetase  53.09 
 
 		 469 aa  529  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3142  L-glutamine synthetase  55.18 
 
 		 474 aa  529  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  53.73 
 
 		 469 aa  529  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4189  glutamine synthetase  53.09 
 
 		 469 aa  529  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4220  glutamine synthetase  53.09 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0808  glutamine synthetase, type I  56.93 
 
 		 473 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  55.2 
 
 		 474 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3585  glutamine synthetase, type I  54.43 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3959  glutamine synthetase  52.99 
 
 		 469 aa  525  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4503  glutamine synthetase  52.88 
 
 		 469 aa  527  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664136  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  53.94 
 
 		 469 aa  528  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2983  glutamine synthetase, type I  55.86 
 
 		 474 aa  526  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  53.21 
 
 		 469 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0886  glutamine synthetase protein  54.12 
 
 		 491 aa  522  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0716545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4881  glutamine synthetase  52.03 
 
 		 469 aa  522  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567284  hitchhiker  0.000124189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3763  L-glutamine synthetase  54.26 
 
 		 471 aa  522  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.382156  normal  0.0833573 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2652  glutamine synthetase type I  52.67 
 
 		 469 aa  524  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127344  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4156  glutamine synthetase  52.99 
 
 		 469 aa  522  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35339  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3715  glutamine synthetase, type I  55.27 
 
 		 477 aa  523  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0502  L-glutamine synthetase  54.37 
 
 		 468 aa  522  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  52.88 
 
 		 469 aa  518  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1736  glutamine synthetase, type I  53.52 
 
 		 469 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.654979  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0243  glutamine synthetase, type I  53.05 
 
 		 475 aa  520  1e-146  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.823516  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1217  glutamine synthetase, type I  52.24 
 
 		 471 aa  521  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1920  glutamine synthetase, type I  53.3 
 
 		 469 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0970  glutamine synthetase, type I  52.88 
 
 		 469 aa  518  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.545228  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  53.96 
 
 		 469 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1544  L-glutamine synthetase  52.88 
 
 		 469 aa  520  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2375  glutamine synthetase  53.3 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0923  L-glutamine synthetase  54.35 
 
 		 474 aa  520  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1901  glutamine synthetase, type I  55.22 
 
 		 474 aa  521  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.624126  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0400  glutamine synthetase  53.3 
 
 		 468 aa  515  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0641467  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01591  glutamine synthetase  53.53 
 
 		 469 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1390  glutamine synthetase, type I  53.42 
 
 		 471 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0626  glutamine synthetase, type I  51.71 
 
 		 471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0736  glutamine synthetase, type I  54.39 
 
 		 468 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00218328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  52.78 
 
 		 469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0466  glutamine synthetase, type I  51.71 
 
 		 471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2087  glutamine synthetase, type I  52.88 
 
 		 469 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0209  glutamine synthetase, type I  52.36 
 
 		 469 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692281  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0300  glutamine synthetase  54.27 
 
 		 469 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.114886  hitchhiker  0.00271616 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3057  glutamine synthetase, type I  53.86 
 
 		 477 aa  513  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5046  glutamine synthetase, type I  54.53 
 
 		 468 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4410  glutamine synthetase  53.85 
 
 		 469 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0828  glutamine synthetase  53.65 
 
 		 478 aa  511  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  54.16 
 
 		 469 aa  513  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3454  glutamine synthetase  53.85 
 
 		 469 aa  512  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00170098  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0243  L-glutamine synthetase  52.14 
 
 		 469 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4920  glutamine synthetase, type I  54.53 
 
 		 468 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45850  glutamine synthetase, type I; GlnA  53.76 
 
 		 467 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>