More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1790 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1790  type I glutamine synthetase  100 
 
 		 490 aa  1028    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1612  L-glutamine synthetase  51.37 
 
 		 470 aa  491  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1341  glutamine synthetase, type I  50.32 
 
 		 471 aa  477  1e-133  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0145067  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1771  type I glutamine synthetase  44.17 
 
 		 481 aa  404  1e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1891  glutamine synthetase, type I  44.61 
 
 		 472 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198707  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  44.81 
 
 		 473 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10271  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  43.39 
 
 		 473 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.18298 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10031  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  42.86 
 
 		 473 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.913163  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2299  L-glutamine synthetase  44.12 
 
 		 475 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00444261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1901  glutamine synthetase, type I  43.15 
 
 		 474 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.624126  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09401  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  42.86 
 
 		 473 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256855  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1770  glutamine synthetase, type I  44.47 
 
 		 474 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0141  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  43.18 
 
 		 473 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1265  glutamine synthetase type I  42.86 
 
 		 473 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1205  L-glutamine synthetase  42.86 
 
 		 473 aa  383  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.488763  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  42.65 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07731  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  43.39 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0667695 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09391  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  42.65 
 
 		 473 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2983  glutamine synthetase, type I  43.09 
 
 		 474 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1947  glutamine synthetase, type I  43.63 
 
 		 491 aa  382  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3142  L-glutamine synthetase  44.05 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4318  glutamine synthetase, type I  42.59 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1262  glutamine synthetase, type I  44.07 
 
 		 474 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0975496  normal  0.0997444 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0131  glutamine synthetase, type I  43.13 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000917861  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0886  glutamine synthetase protein  43.42 
 
 		 491 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0716545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3715  glutamine synthetase, type I  43.21 
 
 		 477 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1390  glutamine synthetase, type I  41.67 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1628  glutamine synthetase, type I  41.74 
 
 		 473 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16421  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  42.5 
 
 		 473 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  43.1 
 
 		 473 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07500  L-glutamine synthetase  42.98 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  43.45 
 
 		 474 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  42.38 
 
 		 474 aa  363  3e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  43.24 
 
 		 473 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  41.79 
 
 		 473 aa  363  5.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  42.92 
 
 		 474 aa  362  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1501  glutamine synthetase, type I  42.5 
 
 		 469 aa  361  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000036011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1443  glutamine synthetase, type I  42.11 
 
 		 483 aa  361  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0199962  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0932  glutamine synthetase, type I  42.39 
 
 		 474 aa  361  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.017954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3383  glutamine synthetase, type I  42.08 
 
 		 475 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129415  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0808  glutamine synthetase, type I  42.56 
 
 		 473 aa  360  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0837  glutamine synthetase, type I  42.56 
 
 		 473 aa  360  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2503  L-glutamine synthetase  42.56 
 
 		 469 aa  359  5e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3102  glutamine synthetase, type I  42.83 
 
 		 474 aa  358  9e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0143892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  40.99 
 
 		 470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0576  glutamine synthetase, type I  42.71 
 
 		 470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0923  L-glutamine synthetase  42.41 
 
 		 474 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2288  glutamine synthetase, type I  42.5 
 
 		 469 aa  356  5e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  41.79 
 
 		 474 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3291  glutamine synthetase, type I  42 
 
 		 474 aa  355  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0215954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16500  L-glutamine synthetase  41.82 
 
 		 476 aa  355  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.399242  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0769  glutamine synthetase, type I  41.7 
 
 		 467 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3080  glutamine synthetase, type I  41.53 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0496817  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0209  glutamine synthetase, type I  40.68 
 
 		 469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  40.83 
 
 		 469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  42 
 
 		 470 aa  353  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  41.58 
 
 		 474 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  41.58 
 
 		 474 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1073  glutamine synthetase, type I  41.75 
 
 		 475 aa  353  4e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  41.72 
 
 		 469 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  41.67 
 
 		 470 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1681  glutamine synthetase, type I  41.88 
 
 		 470 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000311602  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  41.46 
 
 		 470 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1839  glutamine synthetase  42.05 
 
 		 468 aa  351  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.724651  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  41.3 
 
 		 469 aa  351  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13400  L-glutamine synthetase  39.92 
 
 		 474 aa  350  3e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0496712  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4335  glutamine synthetase  40 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  40 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15370  L-glutamine synthetase  41.96 
 
 		 474 aa  350  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  40 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  40 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  40 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  40 
 
 		 469 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  40 
 
 		 469 aa  350  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  40 
 
 		 469 aa  350  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  40 
 
 		 469 aa  350  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5316  glutamine synthetase  40 
 
 		 469 aa  350  4e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.961991  normal  0.126376 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03704  hypothetical protein  40 
 
 		 469 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4346  glutamine synthetase  40 
 
 		 469 aa  350  4e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  40 
 
 		 469 aa  350  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  40 
 
 		 469 aa  350  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  41.58 
 
 		 474 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3763  L-glutamine synthetase  42.17 
 
 		 471 aa  350  5e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.382156  normal  0.0833573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  42.2 
 
 		 470 aa  349  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  41.46 
 
 		 470 aa  349  6e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2295  L-glutamine synthetase  41.16 
 
 		 474 aa  349  6e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0733  glutamine synthetase, type I  41 
 
 		 469 aa  349  8e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.02678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  41.67 
 
 		 470 aa  348  9e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0736  glutamine synthetase, type I  41.6 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00218328  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0400  glutamine synthetase  41.39 
 
 		 468 aa  347  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0641467  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4896  glutamine synthetase type I  42.15 
 
 		 479 aa  348  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001905  glutamine synthetase type I  39.58 
 
 		 469 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.168817  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1510  glutamine synthetase, type I  41.08 
 
 		 477 aa  348  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  40.42 
 
 		 469 aa  347  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0502  L-glutamine synthetase  42.17 
 
 		 468 aa  347  3e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2112  glutamine synthetase, type I  40.99 
 
 		 474 aa  347  3e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0742231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00588  glutamine synthetase  39.79 
 
 		 469 aa  346  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0013  L-glutamine synthetase  41 
 
 		 471 aa  346  5e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2652  glutamine synthetase type I  40.79 
 
 		 469 aa  346  7e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127344  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1484  glutamine synthetase, type I  40 
 
 		 474 aa  345  7e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.836953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>