More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1341 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1341  glutamine synthetase, type I  100 
 
 		 471 aa  970    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0145067  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1612  L-glutamine synthetase  77.45 
 
 		 470 aa  778    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1790  type I glutamine synthetase  50.32 
 
 		 490 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2299  L-glutamine synthetase  48.35 
 
 		 475 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00444261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1891  glutamine synthetase, type I  49.48 
 
 		 472 aa  425  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198707  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1628  glutamine synthetase, type I  48.35 
 
 		 473 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1771  type I glutamine synthetase  46.06 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0131  glutamine synthetase, type I  46.53 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000917861  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3383  glutamine synthetase, type I  48.54 
 
 		 475 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129415  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  47 
 
 		 473 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1901  glutamine synthetase, type I  46.31 
 
 		 474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.624126  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4318  glutamine synthetase, type I  45.77 
 
 		 476 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1681  glutamine synthetase, type I  47.18 
 
 		 470 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000311602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  46.97 
 
 		 470 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  46.88 
 
 		 470 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  46.99 
 
 		 470 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1947  glutamine synthetase, type I  45.23 
 
 		 491 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  46.97 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0923  L-glutamine synthetase  46.38 
 
 		 474 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2983  glutamine synthetase, type I  46.31 
 
 		 474 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0886  glutamine synthetase protein  45.57 
 
 		 491 aa  398  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0716545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3142  L-glutamine synthetase  45.98 
 
 		 474 aa  398  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1807  L-glutamine synthetase  46.79 
 
 		 471 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000345989 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0243  L-glutamine synthetase  45.28 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1770  glutamine synthetase, type I  45.87 
 
 		 474 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  46.47 
 
 		 474 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1262  glutamine synthetase, type I  46.19 
 
 		 474 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0975496  normal  0.0997444 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  46.88 
 
 		 470 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  47.58 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  46.67 
 
 		 470 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  45.88 
 
 		 473 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5046  glutamine synthetase, type I  45.36 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5853  glutamine synthetase  46.09 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07500  L-glutamine synthetase  45.04 
 
 		 474 aa  391  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5098  glutamine synthetase, type I  45.15 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3763  L-glutamine synthetase  47.29 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.382156  normal  0.0833573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  45.06 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3581  glutamine synthetase, type I  46.38 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0932  glutamine synthetase, type I  45.68 
 
 		 474 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.017954 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3154  glutamine synthetase, type I  46.69 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2979  glutamine synthetase, type I  45.76 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4920  glutamine synthetase, type I  45.36 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0418  glutamine synthetase, type I  45.36 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.910839  normal  0.393257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1390  glutamine synthetase, type I  44.7 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45850  glutamine synthetase, type I; GlnA  45.15 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0013  L-glutamine synthetase  46.06 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5002  glutamine synthetase, type I  46.57 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67600  glutamine synthetase  46.09 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0576  glutamine synthetase, type I  45.51 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.547936 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  45.19 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  45.19 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3291  glutamine synthetase, type I  45.76 
 
 		 474 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0215954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  45.19 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4817  glutamine synthetase type I  45.99 
 
 		 468 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  45.4 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1443  glutamine synthetase, type I  46.3 
 
 		 483 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0199962  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4335  glutamine synthetase  45.4 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3648  glutamine synthetase, type I  46.36 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.663211  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1501  glutamine synthetase, type I  44.49 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000036011  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  45.4 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03704  hypothetical protein  45.19 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2780  glutamine synthetase, type I  45.96 
 
 		 471 aa  388  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481689  hitchhiker  0.00799964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1442  L-glutamine synthetase  45.96 
 
 		 471 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  45.19 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  45.4 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0502  L-glutamine synthetase  45.7 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4346  glutamine synthetase  45.19 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  45.19 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0970  glutamine synthetase, type I  44.56 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.545228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  45.19 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2076  L-glutamine synthetase  46.78 
 
 		 472 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943231  normal  0.983586 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0209  glutamine synthetase, type I  45.59 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692281  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  45.4 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4140  L-glutamine synthetase  44.63 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5316  glutamine synthetase  45.19 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.961991  normal  0.126376 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1258  glutamine synthetase protein  45.66 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  44.56 
 
 		 469 aa  385  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0359  glutamine synthetase, type I  45.57 
 
 		 468 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2057  L-glutamine synthetase  45.87 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.648979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2652  glutamine synthetase type I  46.36 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127344  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0344  L-glutamine synthetase  45.57 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2112  glutamine synthetase, type I  45.04 
 
 		 474 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0742231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4896  glutamine synthetase type I  45.23 
 
 		 479 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2062  L-glutamine synthetase  45.66 
 
 		 471 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00147579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3102  glutamine synthetase, type I  46.06 
 
 		 474 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0143892  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2577  glutamine synthetase, type I  45.21 
 
 		 469 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1217  glutamine synthetase, type I  44.38 
 
 		 471 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3585  glutamine synthetase, type I  43.83 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0280122  normal  0.0233949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0925  glutamine synthetase, type I  43.6 
 
 		 474 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12249  glutamine synthetase glnA1  44.33 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.465808  normal  0.443746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3331  L-glutamine synthetase  42.8 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2503  L-glutamine synthetase  46.44 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  45.45 
 
 		 474 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3554  glutamine synthetase  46.28 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  45.25 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2928  glutamine synthetase, type I  43.21 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.304351  normal  0.179293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1522  L-glutamine synthetase  45.45 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000686427  normal  0.138561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1189  L-glutamine synthetase  44.93 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.868262  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0466  glutamine synthetase, type I  44.93 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3382  L-glutamine synthetase  42.8 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00327217  normal  0.0657894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>