More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_39960 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  58.93 
 
 
716 aa  841    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  100 
 
 
688 aa  1440    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  38.93 
 
 
705 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  39.17 
 
 
699 aa  500  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  39.32 
 
 
697 aa  499  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  39.06 
 
 
701 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  38.67 
 
 
697 aa  492  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  38.03 
 
 
695 aa  486  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  39.86 
 
 
702 aa  484  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  38.9 
 
 
726 aa  481  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  38.16 
 
 
695 aa  477  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  36.98 
 
 
697 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  39.61 
 
 
734 aa  477  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  38.37 
 
 
695 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  39.34 
 
 
716 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  38.9 
 
 
721 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  38.52 
 
 
695 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  38.97 
 
 
717 aa  468  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  38.91 
 
 
727 aa  463  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  38.22 
 
 
726 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  38.28 
 
 
711 aa  457  1e-127  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  38.64 
 
 
714 aa  456  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  38.83 
 
 
721 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  37.72 
 
 
722 aa  450  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  38.26 
 
 
712 aa  451  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  37.55 
 
 
703 aa  450  1e-125  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  37.68 
 
 
723 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  38.92 
 
 
718 aa  452  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  36.83 
 
 
713 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  36.76 
 
 
695 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  37.38 
 
 
727 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  35.98 
 
 
697 aa  447  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  36.87 
 
 
702 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  37.32 
 
 
733 aa  449  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  37.63 
 
 
714 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  36.69 
 
 
728 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  36.19 
 
 
729 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  37 
 
 
732 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  36.57 
 
 
714 aa  442  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  35.98 
 
 
697 aa  440  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  38.9 
 
 
723 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  37.2 
 
 
729 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  36.16 
 
 
723 aa  442  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  36.04 
 
 
706 aa  436  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  37.19 
 
 
722 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  37.69 
 
 
723 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  37.85 
 
 
725 aa  438  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  36.62 
 
 
726 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  37.36 
 
 
728 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  37.75 
 
 
725 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  36.04 
 
 
696 aa  429  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  38.24 
 
 
724 aa  430  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  35.94 
 
 
723 aa  426  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  36.65 
 
 
724 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  38.16 
 
 
730 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  35.79 
 
 
676 aa  424  1e-117  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  37.69 
 
 
724 aa  422  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  35.76 
 
 
730 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  35.66 
 
 
727 aa  411  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  36.58 
 
 
729 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  35.16 
 
 
699 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  33.53 
 
 
688 aa  384  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  31.18 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  28.09 
 
 
447 aa  66.6  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  29.59 
 
 
443 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  38.55 
 
 
444 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  38.55 
 
 
444 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  38.55 
 
 
444 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  38.55 
 
 
444 aa  65.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  38.55 
 
 
444 aa  65.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  38.55 
 
 
444 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  38.55 
 
 
444 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  38.55 
 
 
444 aa  65.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  38.55 
 
 
444 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  38.55 
 
 
444 aa  65.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  29.96 
 
 
444 aa  65.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  31.97 
 
 
445 aa  65.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  35.16 
 
 
447 aa  64.7  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  29.76 
 
 
444 aa  64.3  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  37.35 
 
 
444 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  30.63 
 
 
444 aa  63.9  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  37.78 
 
 
445 aa  62.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  22.76 
 
 
451 aa  63.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  26.72 
 
 
439 aa  62.4  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  35.42 
 
 
431 aa  62.4  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 
444 aa  62.4  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  38.27 
 
 
445 aa  62.4  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  35.71 
 
 
454 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 
452 aa  61.2  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  36.36 
 
 
447 aa  60.8  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1766  glutamine synthetase catalytic region  29.38 
 
 
446 aa  60.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.98432 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  34.94 
 
 
446 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  26.9 
 
 
439 aa  59.7  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  37.5 
 
 
444 aa  59.3  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  35.56 
 
 
448 aa  59.7  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  34.94 
 
 
446 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  34.94 
 
 
446 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  35.23 
 
 
446 aa  59.7  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  34.07 
 
 
471 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  29.07 
 
 
449 aa  58.9  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>