More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1735 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  47.71 
 
 		 697 aa  663    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  46.88 
 
 		 695 aa  661    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  47.42 
 
 		 705 aa  666    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  45.07 
 
 		 733 aa  635    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  45.74 
 
 		 729 aa  652    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  45.69 
 
 		 722 aa  662    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  64.41 
 
 		 728 aa  983    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  63.17 
 
 		 732 aa  953    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  45.12 
 
 		 723 aa  648    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  63.92 
 
 		 729 aa  1003    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  47 
 
 		 697 aa  662    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  47.67 
 
 		 714 aa  665    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  47.27 
 
 		 727 aa  664    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  47.46 
 
 		 714 aa  670    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  48.92 
 
 		 697 aa  668    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  46.94 
 
 		 726 aa  658    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  48.58 
 
 		 712 aa  676    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  59.61 
 
 		 723 aa  889    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  46.49 
 
 		 723 aa  668    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  47.15 
 
 		 695 aa  671    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  46.91 
 
 		 713 aa  666    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  46.48 
 
 		 696 aa  643    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  48.79 
 
 		 723 aa  676    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  48.86 
 
 		 716 aa  668    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  49.08 
 
 		 695 aa  678    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  48.54 
 
 		 718 aa  686    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  61.92 
 
 		 727 aa  901    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  49.72 
 
 		 734 aa  698    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  100 
 
 		 724 aa  1499    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  48.4 
 
 		 721 aa  689    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  62.05 
 
 		 729 aa  923    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  47.43 
 
 		 711 aa  666    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  47.46 
 
 		 717 aa  660    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  47.31 
 
 		 722 aa  659    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  47.97 
 
 		 703 aa  663    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  46.88 
 
 		 702 aa  659    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  47.22 
 
 		 695 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  47.59 
 
 		 714 aa  668    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  47.93 
 
 		 697 aa  657    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  63.47 
 
 		 728 aa  956    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  48.92 
 
 		 701 aa  671    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  45.25 
 
 		 724 aa  640    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  46.78 
 
 		 721 aa  661    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  46.44 
 
 		 725 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  48.57 
 
 		 699 aa  681    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  44.93 
 
 		 727 aa  640    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  46.14 
 
 		 725 aa  651    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  47.58 
 
 		 695 aa  674    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  45.67 
 
 		 723 aa  634  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  44.63 
 
 		 724 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  45.28 
 
 		 726 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  44.88 
 
 		 726 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  45.21 
 
 		 730 aa  626  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  45.13 
 
 		 706 aa  617  1e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  45.44 
 
 		 697 aa  614  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  44.24 
 
 		 702 aa  594  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  43.26 
 
 		 730 aa  591  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  40.49 
 
 		 699 aa  544  1e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  39.03 
 
 		 688 aa  485  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  38.09 
 
 		 676 aa  477  1e-133  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  37.39 
 
 		 688 aa  437  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  35.28 
 
 		 716 aa  396  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  32.77 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  28.26 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  26.07 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  31.71 
 
 		 448 aa  67.4  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  28.65 
 
 		 470 aa  67  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  25.76 
 
 		 444 aa  67.4  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  33.33 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  28.87 
 
 		 469 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  27.07 
 
 		 469 aa  66.6  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3142  L-glutamine synthetase  31.65 
 
 		 475 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  28.35 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  28.87 
 
 		 469 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  28.21 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  29.69 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  23.92 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  30.51 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  28.27 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3648  glutamine synthetase, type I  26.98 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.663211  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1482  glutamine synthetase, type I  29.8 
 
 		 486 aa  63.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.140298 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1442  L-glutamine synthetase  27.32 
 
 		 471 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3154  glutamine synthetase, type I  30.06 
 
 		 471 aa  63.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3763  L-glutamine synthetase  27.66 
 
 		 471 aa  63.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.382156  normal  0.0833573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2657  glutamine synthetase catalytic region  28.78 
 
 		 474 aa  63.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  27.42 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2715  glutamine synthetase, catalytic region  24.11 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.846118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 		 440 aa  63.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0149  glutamine synthetase, type I  27.72 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  26.78 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>