More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3485 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  47.44 
 
 		 705 aa  665    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  48.35 
 
 		 695 aa  671    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  52.45 
 
 		 733 aa  789    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  49.93 
 
 		 716 aa  712    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  52.96 
 
 		 723 aa  798    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  47.66 
 
 		 730 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  54.86 
 
 		 726 aa  826    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  46.55 
 
 		 727 aa  636    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  53.85 
 
 		 726 aa  808    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  46.74 
 
 		 712 aa  650    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  47.99 
 
 		 695 aa  662    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  66.71 
 
 		 723 aa  1039    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  53.18 
 
 		 723 aa  786    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  49.5 
 
 		 699 aa  694    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  65.56 
 
 		 722 aa  1006    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  50.14 
 
 		 721 aa  712    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  47.93 
 
 		 718 aa  698    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  54.07 
 
 		 725 aa  791    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  76.93 
 
 		 724 aa  1168    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  47.42 
 
 		 697 aa  659    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  51.27 
 
 		 734 aa  735    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  47.54 
 
 		 701 aa  654    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  53.94 
 
 		 723 aa  793    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  48.29 
 
 		 695 aa  669    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  46.56 
 
 		 695 aa  656    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  73.62 
 
 		 729 aa  1134    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  45.49 
 
 		 728 aa  640    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  100 
 
 		 724 aa  1504    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  53.93 
 
 		 725 aa  797    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  53.57 
 
 		 726 aa  814    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  45.3 
 
 		 697 aa  638    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  54.75 
 
 		 721 aa  783    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  49.72 
 
 		 717 aa  681    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  48.84 
 
 		 730 aa  737    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  47.08 
 
 		 702 aa  650    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  51.65 
 
 		 727 aa  785    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  43.79 
 
 		 732 aa  629  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  45.07 
 
 		 713 aa  630  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  45.17 
 
 		 714 aa  627  1e-178  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  47.32 
 
 		 711 aa  625  1e-178  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  45.25 
 
 		 724 aa  627  1e-178  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  45.58 
 
 		 722 aa  628  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  43.88 
 
 		 728 aa  625  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  44.66 
 
 		 729 aa  620  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  44.97 
 
 		 714 aa  620  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  44.59 
 
 		 697 aa  619  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  44.32 
 
 		 727 aa  615  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  44.57 
 
 		 714 aa  617  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  44.57 
 
 		 703 aa  612  9.999999999999999e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  43.27 
 
 		 729 aa  610  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  43.92 
 
 		 702 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  43.09 
 
 		 723 aa  600  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  43.55 
 
 		 695 aa  597  1e-169  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  45.04 
 
 		 696 aa  591  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  44.04 
 
 		 697 aa  571  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  42.49 
 
 		 697 aa  555  1e-157  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  42.84 
 
 		 706 aa  553  1e-156  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  39.6 
 
 		 676 aa  532  1e-150  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  38.87 
 
 		 699 aa  509  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  36.38 
 
 		 688 aa  458  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  37.69 
 
 		 688 aa  422  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  35.42 
 
 		 716 aa  387  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  31.52 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  40.7 
 
 		 447 aa  73.9  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  31.4 
 
 		 439 aa  73.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  37.04 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  31.82 
 
 		 444 aa  73.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  25.6 
 
 		 448 aa  70.1  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  29.44 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  30.32 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  33.06 
 
 		 447 aa  67  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  25 
 
 		 446 aa  67  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  32.03 
 
 		 454 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  25 
 
 		 446 aa  67  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  27.96 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  25.23 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  28.32 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  32.03 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  39.13 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  27.97 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  26.72 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  29.41 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  35.85 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  32.61 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  28.42 
 
 		 441 aa  63.9  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  28.65 
 
 		 455 aa  63.9  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  31.15 
 
 		 445 aa  63.9  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  29.45 
 
 		 444 aa  63.9  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09401  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  25.67 
 
 		 473 aa  63.9  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  30.5 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  30.5 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  30.5 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  30.5 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  30.5 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  31.91 
 
 		 445 aa  63.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  30.5 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  26 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  28.44 
 
 		 454 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  29.8 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  28.24 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>