257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1588 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  46.37 
 
 		 730 aa  641    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  46.39 
 
 		 723 aa  643    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  49.15 
 
 		 723 aa  680    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  47.54 
 
 		 729 aa  671    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  46.46 
 
 		 729 aa  636    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  50.14 
 
 		 730 aa  684    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  74.51 
 
 		 713 aa  1123    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  48.16 
 
 		 723 aa  659    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  80.39 
 
 		 727 aa  1231    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  100 
 
 		 714 aa  1479    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  48.15 
 
 		 726 aa  671    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  46.52 
 
 		 697 aa  645    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  74.51 
 
 		 714 aa  1130    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  50.14 
 
 		 716 aa  690    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  48.52 
 
 		 723 aa  679    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  47.29 
 
 		 721 aa  647    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  49.86 
 
 		 695 aa  701    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  48.86 
 
 		 697 aa  679    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  50.21 
 
 		 711 aa  674    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  49.79 
 
 		 727 aa  695    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  48.2 
 
 		 733 aa  663    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  50.71 
 
 		 718 aa  700    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  85.43 
 
 		 722 aa  1295    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  51.47 
 
 		 734 aa  725    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  47.46 
 
 		 724 aa  662    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  49.36 
 
 		 699 aa  682    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  46.69 
 
 		 728 aa  656    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  48.57 
 
 		 695 aa  682    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  49.71 
 
 		 695 aa  700    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  49.1 
 
 		 721 aa  700    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  49.58 
 
 		 723 aa  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  49.07 
 
 		 726 aa  674    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  48.14 
 
 		 695 aa  686    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  83.33 
 
 		 714 aa  1268    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  48.66 
 
 		 732 aa  697    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  49.15 
 
 		 728 aa  688    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  49.43 
 
 		 725 aa  687    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  48.52 
 
 		 726 aa  695    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  48.59 
 
 		 722 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  48.13 
 
 		 727 aa  660    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  48.15 
 
 		 695 aa  671    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  47.76 
 
 		 717 aa  673    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  50.28 
 
 		 697 aa  695    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  50.14 
 
 		 705 aa  675    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  50.56 
 
 		 701 aa  694    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  49.57 
 
 		 703 aa  675    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  50 
 
 		 702 aa  688    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  49.86 
 
 		 725 aa  673    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  83.4 
 
 		 712 aa  1256    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  47.91 
 
 		 729 aa  667    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  47.16 
 
 		 696 aa  642    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  45.6 
 
 		 697 aa  628  1e-179  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  46.16 
 
 		 706 aa  624  1e-177  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  45.33 
 
 		 724 aa  619  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  44.97 
 
 		 724 aa  620  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  44 
 
 		 697 aa  613  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  43.14 
 
 		 702 aa  601  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  42.9 
 
 		 699 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  41.22 
 
 		 676 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  37.89 
 
 		 688 aa  499  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  38.64 
 
 		 688 aa  456  1e-127  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  39.23 
 
 		 716 aa  457  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2657  glutamine synthetase catalytic region  33.04 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  31.82 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2715  glutamine synthetase, catalytic region  37.5 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.846118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  34.23 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  29.06 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  31.82 
 
 		 439 aa  60.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  33.11 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  31.48 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  27.2 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1141  glutamine synthetase catalytic region  33.68 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3142  L-glutamine synthetase  36.45 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  31.36 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  31.86 
 
 		 447 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  34.02 
 
 		 444 aa  56.2  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  26.34 
 
 		 461 aa  56.2  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  28.41 
 
 		 454 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  35.29 
 
 		 443 aa  55.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  33.94 
 
 		 447 aa  54.3  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  28.21 
 
 		 439 aa  54.3  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  30.7 
 
 		 442 aa  54.3  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  37.65 
 
 		 444 aa  54.3  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  26.8 
 
 		 469 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  36.78 
 
 		 445 aa  53.5  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  36.17 
 
 		 444 aa  53.5  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  28.16 
 
 		 452 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  32.11 
 
 		 444 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  28.76 
 
 		 471 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  31.61 
 
 		 441 aa  53.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  30.6 
 
 		 444 aa  53.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  32.28 
 
 		 452 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  35.96 
 
 		 444 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  27.47 
 
 		 469 aa  52.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  30.32 
 
 		 455 aa  52.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  32.43 
 
 		 447 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  36.47 
 
 		 447 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  29.49 
 
 		 443 aa  52  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  34.23 
 
 		 448 aa  52  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  31.4 
 
 		 452 aa  52  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>