More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1258 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  51.27 
 
 		 725 aa  714    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  51.51 
 
 		 726 aa  714    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  48.44 
 
 		 728 aa  679    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  53.55 
 
 		 699 aa  756    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 703 aa  1463    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  47.81 
 
 		 713 aa  680    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  47.11 
 
 		 728 aa  635    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  47.08 
 
 		 730 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  49.08 
 
 		 722 aa  678    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  48.71 
 
 		 697 aa  655    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  51.07 
 
 		 697 aa  725    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  48.35 
 
 		 722 aa  680    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  49.29 
 
 		 717 aa  680    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  49.86 
 
 		 721 aa  697    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  50.78 
 
 		 733 aa  709    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  47.59 
 
 		 727 aa  678    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  49.57 
 
 		 714 aa  675    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  50.65 
 
 		 726 aa  714    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  57.77 
 
 		 711 aa  806    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  47.3 
 
 		 706 aa  639    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  48.71 
 
 		 723 aa  691    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  49.57 
 
 		 712 aa  694    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  52.87 
 
 		 697 aa  748    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  49.29 
 
 		 697 aa  666    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  46.69 
 
 		 732 aa  643    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  50.35 
 
 		 727 aa  711    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  49.5 
 
 		 730 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  51.29 
 
 		 702 aa  739    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  51.28 
 
 		 718 aa  721    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  47.87 
 
 		 714 aa  684    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  47.97 
 
 		 724 aa  654    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  54.3 
 
 		 695 aa  768    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  50.07 
 
 		 695 aa  702    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  51.93 
 
 		 734 aa  742    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  50.21 
 
 		 696 aa  687    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  48.92 
 
 		 723 aa  677    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  55.81 
 
 		 695 aa  787    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  49.5 
 
 		 714 aa  680    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  50.07 
 
 		 723 aa  691    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  51.8 
 
 		 723 aa  728    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  51.01 
 
 		 725 aa  709    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  50.64 
 
 		 726 aa  706    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  54.44 
 
 		 695 aa  768    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  54.01 
 
 		 695 aa  766    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  51.68 
 
 		 721 aa  740    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  53.65 
 
 		 697 aa  747    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  51.35 
 
 		 716 aa  719    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  54.35 
 
 		 705 aa  767    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  53.22 
 
 		 701 aa  742    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  47.26 
 
 		 727 aa  627  1e-178  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  45.93 
 
 		 729 aa  623  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  44.92 
 
 		 702 aa  620  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  45.6 
 
 		 729 aa  612  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  44.57 
 
 		 724 aa  612  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  44.71 
 
 		 724 aa  610  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  45.66 
 
 		 729 aa  604  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  44.68 
 
 		 723 aa  591  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  41.34 
 
 		 676 aa  535  1e-151  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  42.47 
 
 		 699 aa  530  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  39.05 
 
 		 688 aa  503  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  37.55 
 
 		 688 aa  450  1e-125  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  36.86 
 
 		 716 aa  434  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2657  glutamine synthetase catalytic region  28.66 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  32.71 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  34.88 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  29.21 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1141  glutamine synthetase catalytic region  34.38 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  22.73 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2715  glutamine synthetase, catalytic region  34.38 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.846118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  32.52 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  37.21 
 
 		 444 aa  57  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  31.02 
 
 		 455 aa  57  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  28.86 
 
 		 431 aa  57.4  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  31.34 
 
 		 433 aa  56.2  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  30.94 
 
 		 444 aa  56.6  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  35.16 
 
 		 447 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  22.42 
 
 		 470 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  32.29 
 
 		 476 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  35.16 
 
 		 447 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  34.88 
 
 		 443 aa  55.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  29.56 
 
 		 455 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  27.64 
 
 		 444 aa  54.7  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  26 
 
 		 431 aa  54.7  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  30.43 
 
 		 454 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  26.37 
 
 		 430 aa  54.7  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  27.92 
 
 		 444 aa  54.3  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  29.85 
 
 		 444 aa  54.3  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1612  L-glutamine synthetase  26.83 
 
 		 470 aa  54.3  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  29.84 
 
 		 442 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  34.07 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  34.88 
 
 		 444 aa  53.5  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10271  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  28.8 
 
 		 473 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.18298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3142  L-glutamine synthetase  29.3 
 
 		 475 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  29.93 
 
 		 439 aa  52.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1947  glutamine synthetase, type I  23.35 
 
 		 491 aa  53.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  21.34 
 
 		 469 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  31.87 
 
 		 443 aa  52.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  28.99 
 
 		 454 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  26 
 
 		 442 aa  52.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>