More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1593 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  48.84 
 
 		 711 aa  658    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  47.08 
 
 		 703 aa  652    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  56.87 
 
 		 725 aa  860    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  49.28 
 
 		 695 aa  686    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  57.89 
 
 		 723 aa  868    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  67.22 
 
 		 727 aa  1049    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 730 aa  1516    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  53.3 
 
 		 701 aa  734    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  50 
 
 		 699 aa  706    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  49.79 
 
 		 705 aa  698    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  46.38 
 
 		 727 aa  639    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  57.24 
 
 		 723 aa  879    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  46.37 
 
 		 714 aa  641    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  50.93 
 
 		 697 aa  717    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  65.44 
 
 		 726 aa  1000    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  52.91 
 
 		 723 aa  801    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  53.2 
 
 		 716 aa  743    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  52.37 
 
 		 717 aa  732    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  69.26 
 
 		 726 aa  1083    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  46.71 
 
 		 713 aa  655    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  54.18 
 
 		 721 aa  751    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  50.07 
 
 		 729 aa  734    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  46.01 
 
 		 695 aa  643    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  52.79 
 
 		 718 aa  728    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  47.93 
 
 		 697 aa  674    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  59.89 
 
 		 733 aa  904    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  50.57 
 
 		 695 aa  709    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  50.88 
 
 		 724 aa  748    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  48.01 
 
 		 702 aa  679    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  57.89 
 
 		 723 aa  865    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  52.95 
 
 		 722 aa  795    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  50.42 
 
 		 730 aa  693    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  46.08 
 
 		 712 aa  639    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  56.23 
 
 		 734 aa  774    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  50.35 
 
 		 695 aa  713    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  50.57 
 
 		 695 aa  710    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  48.51 
 
 		 697 aa  666    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  48.84 
 
 		 724 aa  737    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  57.06 
 
 		 725 aa  876    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  71.27 
 
 		 726 aa  1106    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  55.56 
 
 		 721 aa  832    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  47.73 
 
 		 714 aa  659    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  47.56 
 
 		 697 aa  634  1e-180  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  45.82 
 
 		 722 aa  631  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  45.39 
 
 		 714 aa  630  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  42.16 
 
 		 732 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  44.03 
 
 		 728 aa  615  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  42.57 
 
 		 729 aa  615  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  44.62 
 
 		 702 aa  611  1e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  46.77 
 
 		 696 aa  607  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  44.6 
 
 		 727 aa  607  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  43.51 
 
 		 729 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  45.78 
 
 		 706 aa  591  1e-167  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  42.49 
 
 		 723 aa  592  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  44.79 
 
 		 697 aa  588  1e-166  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  43.26 
 
 		 724 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  42.08 
 
 		 728 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  43.43 
 
 		 699 aa  556  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  40.29 
 
 		 676 aa  537  1e-151  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  38.62 
 
 		 688 aa  486  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  35.76 
 
 		 688 aa  409  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  34.83 
 
 		 716 aa  402  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  27.92 
 
 		 439 aa  70.1  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  25.91 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  23.16 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  27.66 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  27.14 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  23.81 
 
 		 470 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  27.78 
 
 		 452 aa  63.9  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  32.14 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  27.21 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  23.47 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  23.16 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  23.16 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  31.82 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  25.62 
 
 		 469 aa  62  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  29.17 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  27.27 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  27.45 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  35.14 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  26.42 
 
 		 443 aa  60.5  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  29.05 
 
 		 439 aa  60.1  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  27.87 
 
 		 446 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  28.33 
 
 		 443 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  27.27 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  28 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  27.27 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  28.1 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1443  glutamine synthetase, type I  29.03 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0199962  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  28.32 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  27.33 
 
 		 443 aa  60.1  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  23.41 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  27.84 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  29.61 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  27.97 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  26.67 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  25.83 
 
 		 443 aa  57  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  28.93 
 
 		 444 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  30.84 
 
 		 476 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  28.32 
 
 		 447 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>