211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1105 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  53.92 
 
 		 699 aa  777    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  50.22 
 
 		 717 aa  688    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  46.97 
 
 		 727 aa  649    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  50.22 
 
 		 726 aa  685    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  49.65 
 
 		 726 aa  681    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  59.22 
 
 		 706 aa  852    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  58.56 
 
 		 697 aa  845    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  46.51 
 
 		 713 aa  660    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  47.35 
 
 		 722 aa  638    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  49.28 
 
 		 723 aa  671    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  50.71 
 
 		 718 aa  691    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  46.54 
 
 		 712 aa  652    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  47.93 
 
 		 724 aa  649    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  51.14 
 
 		 734 aa  707    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  51.8 
 
 		 695 aa  748    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  51.44 
 
 		 711 aa  712    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  49.79 
 
 		 721 aa  687    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  46.27 
 
 		 722 aa  650    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  52.45 
 
 		 695 aa  740    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  47.09 
 
 		 714 aa  658    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 697 aa  1453    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  48.29 
 
 		 733 aa  655    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  60.43 
 
 		 696 aa  877    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  50.28 
 
 		 727 aa  687    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  49.28 
 
 		 725 aa  674    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  50.21 
 
 		 726 aa  673    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  53.82 
 
 		 697 aa  773    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  49.86 
 
 		 697 aa  726    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  50.93 
 
 		 705 aa  730    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  55.65 
 
 		 701 aa  786    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  49.21 
 
 		 723 aa  659    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  49.72 
 
 		 716 aa  685    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  52.37 
 
 		 695 aa  736    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  49.28 
 
 		 725 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  52.16 
 
 		 695 aa  739    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  52.01 
 
 		 695 aa  739    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  46.95 
 
 		 714 aa  656    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  51.07 
 
 		 702 aa  730    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  51.3 
 
 		 697 aa  729    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  49.29 
 
 		 703 aa  666    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  49.43 
 
 		 721 aa  645    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  46.46 
 
 		 729 aa  632  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  48.92 
 
 		 723 aa  634  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  47.56 
 
 		 730 aa  634  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  45.6 
 
 		 714 aa  628  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  47.1 
 
 		 728 aa  626  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  45.26 
 
 		 723 aa  617  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  45.35 
 
 		 702 aa  617  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  44.29 
 
 		 732 aa  612  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  45.11 
 
 		 729 aa  614  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  44.62 
 
 		 728 aa  605  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  44.51 
 
 		 727 aa  607  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  46.37 
 
 		 730 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  45.08 
 
 		 723 aa  602  1.0000000000000001e-171  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  44.46 
 
 		 729 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  44.25 
 
 		 724 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  42.49 
 
 		 724 aa  555  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  40 
 
 		 676 aa  532  1e-150  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  42.23 
 
 		 699 aa  525  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  37.72 
 
 		 688 aa  496  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  35.98 
 
 		 688 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  37.05 
 
 		 716 aa  424  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  33.77 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  29.24 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  29.81 
 
 		 439 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  29.81 
 
 		 439 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  34.23 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  28.41 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  31.14 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  29.61 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  30.36 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  29.41 
 
 		 448 aa  56.6  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  27.97 
 
 		 430 aa  57  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  29.73 
 
 		 447 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  29.94 
 
 		 445 aa  55.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  31.03 
 
 		 443 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  28.76 
 
 		 442 aa  55.8  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  32.41 
 
 		 446 aa  55.1  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  30.66 
 
 		 444 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  30.28 
 
 		 443 aa  55.1  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  31.25 
 
 		 444 aa  55.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  31.61 
 
 		 446 aa  55.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  31.61 
 
 		 446 aa  55.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  29.79 
 
 		 448 aa  55.5  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  30.82 
 
 		 444 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  30.82 
 
 		 444 aa  55.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  30.82 
 
 		 444 aa  55.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  30.82 
 
 		 444 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  30.82 
 
 		 444 aa  55.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  30.82 
 
 		 444 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  30.82 
 
 		 444 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  30.82 
 
 		 444 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  30.82 
 
 		 444 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  30.28 
 
 		 443 aa  54.7  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  32.37 
 
 		 446 aa  54.3  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  37.04 
 
 		 450 aa  54.3  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  30.14 
 
 		 444 aa  53.9  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  26.8 
 
 		 444 aa  53.9  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  30.28 
 
 		 443 aa  53.9  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  30.28 
 
 		 447 aa  53.9  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>