More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1590 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  64.88 
 
 		 723 aa  995    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  46.38 
 
 		 702 aa  641    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  56.8 
 
 		 695 aa  807    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  50.28 
 
 		 697 aa  712    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  49.93 
 
 		 713 aa  714    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  56.48 
 
 		 717 aa  806    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  54.09 
 
 		 695 aa  762    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  49.65 
 
 		 697 aa  681    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  56.94 
 
 		 716 aa  803    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  59.66 
 
 		 734 aa  854    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  49.86 
 
 		 727 aa  702    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  49.07 
 
 		 714 aa  674    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  76.03 
 
 		 726 aa  1172    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  56.65 
 
 		 695 aa  804    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 726 aa  1508    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  58.49 
 
 		 723 aa  888    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  51.85 
 
 		 702 aa  732    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  63.36 
 
 		 723 aa  951    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  50.85 
 
 		 714 aa  706    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  61.64 
 
 		 721 aa  915    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  49.58 
 
 		 696 aa  661    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  47.58 
 
 		 697 aa  638    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  46.79 
 
 		 732 aa  667    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  49.36 
 
 		 712 aa  687    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  53.5 
 
 		 729 aa  799    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  49.79 
 
 		 722 aa  681    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  54.13 
 
 		 718 aa  790    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  54.55 
 
 		 730 aa  768    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  49.64 
 
 		 695 aa  701    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  56.24 
 
 		 724 aa  832    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  54.25 
 
 		 699 aa  793    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  52.75 
 
 		 711 aa  724    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  51.51 
 
 		 703 aa  714    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  80.88 
 
 		 727 aa  1242    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  63.22 
 
 		 725 aa  935    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  60.85 
 
 		 723 aa  926    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  69.26 
 
 		 730 aa  1083    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  55.87 
 
 		 695 aa  796    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  48.8 
 
 		 714 aa  684    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  48.03 
 
 		 727 aa  652    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  54.86 
 
 		 724 aa  826    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  63.22 
 
 		 725 aa  959    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  86.09 
 
 		 726 aa  1343    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  64.44 
 
 		 733 aa  994    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  54.48 
 
 		 697 aa  780    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  57 
 
 		 722 aa  856    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  46.71 
 
 		 723 aa  647    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  46.14 
 
 		 728 aa  638    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  57.24 
 
 		 721 aa  833    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  52.29 
 
 		 697 aa  733    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  53.5 
 
 		 705 aa  755    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  56.81 
 
 		 701 aa  794    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  45.54 
 
 		 729 aa  645    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  47.42 
 
 		 706 aa  632  1e-180  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  45.28 
 
 		 724 aa  619  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  45.26 
 
 		 729 aa  620  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  44.21 
 
 		 728 aa  595  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  44.48 
 
 		 699 aa  567  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  41.24 
 
 		 676 aa  545  1e-154  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  39.86 
 
 		 688 aa  504  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  38.22 
 
 		 688 aa  459  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  36.02 
 
 		 716 aa  426  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  28.5 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  26.84 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  25.57 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  26.64 
 
 		 470 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  27.96 
 
 		 441 aa  72  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  26.2 
 
 		 470 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  27.66 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  30.77 
 
 		 447 aa  70.1  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1790  type I glutamine synthetase  24.48 
 
 		 490 aa  70.1  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  25 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  25 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  25.08 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  29.26 
 
 		 448 aa  68.6  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  26.37 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1612  L-glutamine synthetase  28.71 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  29.48 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  29.3 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  25.09 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  28.11 
 
 		 443 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  26.24 
 
 		 439 aa  67  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  31.18 
 
 		 443 aa  67.4  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  29.26 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  30.6 
 
 		 469 aa  66.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1108  L-glutamine synthetase  28.49 
 
 		 469 aa  66.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0181625  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0149  glutamine synthetase, type I  29.34 
 
 		 470 aa  66.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  29.05 
 
 		 469 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1390  glutamine synthetase, type I  25.76 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  30.67 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  27.87 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  24.29 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0276  glutamine synthetase, type I  30.46 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00270748  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  26.6 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  29.19 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  27.62 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  26.88 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  26.45 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  26.06 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>