More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1609 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 430 aa  878    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  68.6 
 
 		 433 aa  614  1e-175  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  65.57 
 
 		 431 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  65.33 
 
 		 431 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1766  glutamine synthetase catalytic region  54.11 
 
 		 446 aa  480  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.98432 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  37.41 
 
 		 439 aa  276  4e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  38.12 
 
 		 439 aa  269  7e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  38.17 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  37.59 
 
 		 444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  38.3 
 
 		 439 aa  265  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  36.04 
 
 		 445 aa  260  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  37.02 
 
 		 445 aa  260  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  36.12 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  35.29 
 
 		 441 aa  256  4e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  37.35 
 
 		 447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  36.22 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  35.08 
 
 		 450 aa  253  6e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  33.95 
 
 		 445 aa  252  9.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  34.93 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  34.93 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  35.09 
 
 		 443 aa  251  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 		 444 aa  249  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  34.81 
 
 		 442 aa  249  6e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 		 444 aa  249  9e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  35.2 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  34.73 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  34.22 
 
 		 442 aa  248  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  36.45 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  36.53 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  36.41 
 
 		 453 aa  246  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  35.84 
 
 		 444 aa  246  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  34.01 
 
 		 446 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  35.12 
 
 		 446 aa  246  8e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  35.9 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  37.5 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  35.29 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  35.55 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  35.67 
 
 		 461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  34.1 
 
 		 442 aa  244  3e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  35.05 
 
 		 442 aa  244  3e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  35.43 
 
 		 446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  33.79 
 
 		 440 aa  243  5e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  35.94 
 
 		 444 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  35.12 
 
 		 446 aa  243  5e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0202  L-glutamine synthetase  35.07 
 
 		 440 aa  243  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  35.24 
 
 		 444 aa  243  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  37.59 
 
 		 433 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  34.91 
 
 		 444 aa  242  9e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  38.08 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  37.63 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  34.96 
 
 		 446 aa  240  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  37 
 
 		 443 aa  239  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  34.77 
 
 		 443 aa  239  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  36.56 
 
 		 451 aa  239  8e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  37.53 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  36.74 
 
 		 447 aa  239  1e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  34.17 
 
 		 442 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  34.22 
 
 		 442 aa  237  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  34.51 
 
 		 446 aa  236  4e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  36.49 
 
 		 443 aa  237  4e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  34.09 
 
 		 452 aa  236  4e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  35.78 
 
 		 443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  35.55 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  35.57 
 
 		 448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  36.04 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  34.31 
 
 		 448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  35.01 
 
 		 456 aa  234  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  36.87 
 
 		 447 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  34.79 
 
 		 441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  33.26 
 
 		 449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  33.96 
 
 		 445 aa  233  7.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  34.86 
 
 		 446 aa  232  9e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  33.8 
 
 		 443 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  33.79 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 446 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 446 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  36.98 
 
 		 444 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  34.32 
 
 		 448 aa  230  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  33.87 
 
 		 448 aa  230  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  35.81 
 
 		 447 aa  229  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  35.67 
 
 		 446 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  35.67 
 
 		 446 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  35.67 
 
 		 446 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  31.5 
 
 		 443 aa  229  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  36.04 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  35.39 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  34.11 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  36.11 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  35.83 
 
 		 451 aa  226  4e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  34.46 
 
 		 447 aa  226  9e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  35.99 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  33.49 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  36.21 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1089  glutamate--ammonia ligase  34.59 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  37.3 
 
 		 451 aa  223  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>