More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_22357 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  58.93 
 
 
688 aa  841    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  100 
 
 
716 aa  1499    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  40.06 
 
 
699 aa  498  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  40.6 
 
 
705 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  38.78 
 
 
697 aa  488  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  39.52 
 
 
701 aa  487  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  39.79 
 
 
721 aa  479  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  39.67 
 
 
734 aa  476  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  38.86 
 
 
716 aa  474  1e-132  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  39.58 
 
 
718 aa  473  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  38.7 
 
 
697 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  38.01 
 
 
697 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  38.44 
 
 
702 aa  465  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  38.33 
 
 
695 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  38.12 
 
 
695 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  39.23 
 
 
714 aa  457  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  37.93 
 
 
695 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  35.7 
 
 
702 aa  456  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  38.3 
 
 
717 aa  453  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  37.93 
 
 
695 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  39.86 
 
 
711 aa  451  1e-125  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  38.54 
 
 
712 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  37.59 
 
 
722 aa  443  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  37.99 
 
 
695 aa  445  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  38.34 
 
 
727 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  36.41 
 
 
729 aa  442  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  36.61 
 
 
714 aa  441  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  37.68 
 
 
714 aa  438  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  36.86 
 
 
703 aa  434  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  36.44 
 
 
713 aa  430  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  35.59 
 
 
723 aa  432  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  35.84 
 
 
726 aa  429  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  37.57 
 
 
733 aa  427  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  37.05 
 
 
697 aa  424  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  35.65 
 
 
676 aa  424  1e-117  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  36.02 
 
 
726 aa  426  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  35.45 
 
 
723 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  36.11 
 
 
730 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  35.95 
 
 
697 aa  420  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  36.5 
 
 
732 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  37.03 
 
 
723 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  36.12 
 
 
727 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  37.93 
 
 
725 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  36.22 
 
 
726 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  36.45 
 
 
722 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  33.65 
 
 
727 aa  406  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  37.59 
 
 
729 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  36.5 
 
 
728 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  36 
 
 
721 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  36.08 
 
 
723 aa  405  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  37.86 
 
 
696 aa  399  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  34.83 
 
 
730 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  36.89 
 
 
724 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  35.27 
 
 
728 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  35.43 
 
 
706 aa  402  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  36.38 
 
 
725 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  35.36 
 
 
724 aa  392  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  35.31 
 
 
723 aa  391  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  35.42 
 
 
724 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  35.67 
 
 
729 aa  382  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  34.43 
 
 
699 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  31.64 
 
 
688 aa  352  1e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  38.54 
 
 
433 aa  62.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  25.55 
 
 
459 aa  62.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  35.05 
 
 
454 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  34.02 
 
 
454 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  32.99 
 
 
454 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  27.11 
 
 
455 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  27.88 
 
 
447 aa  60.1  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  35.14 
 
 
452 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  31.96 
 
 
471 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  30.51 
 
 
455 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  29.87 
 
 
431 aa  57.8  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3142  L-glutamine synthetase  29.44 
 
 
475 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  35.14 
 
 
452 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  26.95 
 
 
452 aa  56.2  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0149  glutamine synthetase, type I  27.13 
 
 
470 aa  56.6  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  33.67 
 
 
445 aa  55.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  35.64 
 
 
447 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4831  L-glutamine synthetase  27.27 
 
 
470 aa  55.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  25.64 
 
 
451 aa  55.1  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  36.14 
 
 
447 aa  55.1  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  33.33 
 
 
455 aa  55.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  27.81 
 
 
444 aa  55.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  30.93 
 
 
454 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  30.93 
 
 
459 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  28.29 
 
 
431 aa  54.7  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  30.93 
 
 
454 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  30.93 
 
 
454 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  26.62 
 
 
443 aa  54.3  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  34.78 
 
 
444 aa  54.3  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  35.79 
 
 
447 aa  54.3  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2657  glutamine synthetase catalytic region  37.78 
 
 
474 aa  54.3  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  29.24 
 
 
444 aa  54.3  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  40 
 
 
439 aa  54.3  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  38.55 
 
 
476 aa  54.3  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  25 
 
 
451 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  25 
 
 
451 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  34.78 
 
 
444 aa  53.9  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  34.78 
 
 
444 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>