More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4041 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  50.79 
 
 		 695 aa  708    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  49.86 
 
 		 702 aa  705    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  51 
 
 		 697 aa  703    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  57.76 
 
 		 725 aa  853    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  58.86 
 
 		 723 aa  861    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  59.5 
 
 		 723 aa  871    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  56.79 
 
 		 733 aa  851    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  51.95 
 
 		 716 aa  736    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  50.29 
 
 		 701 aa  704    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  49.86 
 
 		 727 aa  709    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  63.85 
 
 		 729 aa  973    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  48.59 
 
 		 714 aa  671    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  52.55 
 
 		 734 aa  751    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  56.89 
 
 		 726 aa  844    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  57 
 
 		 726 aa  856    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  45.7 
 
 		 695 aa  647    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  73.82 
 
 		 723 aa  1119    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  47.43 
 
 		 697 aa  669    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  52.45 
 
 		 721 aa  737    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  48.49 
 
 		 713 aa  689    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  49.29 
 
 		 714 aa  697    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  48.97 
 
 		 711 aa  668    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  49.44 
 
 		 722 aa  691    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  49.86 
 
 		 705 aa  699    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  58.59 
 
 		 723 aa  879    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  52.5 
 
 		 718 aa  739    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  49.24 
 
 		 712 aa  709    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  50.72 
 
 		 695 aa  709    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  57.3 
 
 		 721 aa  818    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  64.77 
 
 		 724 aa  988    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  45.69 
 
 		 724 aa  650    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  50.72 
 
 		 695 aa  711    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  46.68 
 
 		 697 aa  666    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  45.78 
 
 		 728 aa  638    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 722 aa  1492    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  48.35 
 
 		 703 aa  680    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  49.07 
 
 		 695 aa  698    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  48.93 
 
 		 714 aa  682    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  52.51 
 
 		 717 aa  722    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  49.86 
 
 		 730 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  65.56 
 
 		 724 aa  1006    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  52.95 
 
 		 730 aa  795    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  58.09 
 
 		 725 aa  862    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  56.45 
 
 		 726 aa  850    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  56.02 
 
 		 727 aa  835    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  51.14 
 
 		 699 aa  716    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  47.35 
 
 		 697 aa  638    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  45.34 
 
 		 727 aa  633  1e-180  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  44.76 
 
 		 702 aa  634  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  43.76 
 
 		 729 aa  625  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  44.38 
 
 		 728 aa  621  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  43.27 
 
 		 729 aa  617  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  46.37 
 
 		 697 aa  609  1e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  46.29 
 
 		 696 aa  611  1e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  42.86 
 
 		 732 aa  611  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  44.17 
 
 		 723 aa  607  9.999999999999999e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  44.98 
 
 		 706 aa  591  1e-167  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  42.04 
 
 		 699 aa  560  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  40.09 
 
 		 676 aa  534  1e-150  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  36.54 
 
 		 688 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  37.19 
 
 		 688 aa  436  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  36.45 
 
 		 716 aa  406  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  27.07 
 
 		 439 aa  76.6  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  27.57 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  33.06 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  26.63 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  26.53 
 
 		 430 aa  67  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  34.26 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  28.57 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  26.67 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  27.45 
 
 		 443 aa  63.9  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  33.09 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  29.94 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  28.22 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  29.94 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  31.06 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  26.39 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  28.12 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  30.5 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1612  L-glutamine synthetase  29.81 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1790  type I glutamine synthetase  32.87 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  26.09 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  31.21 
 
 		 444 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  28.39 
 
 		 474 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  30.26 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  27.69 
 
 		 440 aa  62  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1022  L-glutamine synthetase  27.99 
 
 		 468 aa  62  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  30.53 
 
 		 447 aa  62  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  25.2 
 
 		 444 aa  62  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  31.97 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  27.78 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  29.46 
 
 		 448 aa  60.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  30.91 
 
 		 444 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  24.78 
 
 		 447 aa  60.5  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  33.09 
 
 		 444 aa  60.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  25.55 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  29.24 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1839  glutamine synthetase  27.51 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.724651  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  29.71 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1839  glutamine synthetase, type I  25.69 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>