More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3062 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  51.11 
 
 
712 aa  727    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  53.79 
 
 
695 aa  780    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  55.71 
 
 
723 aa  788    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  53.51 
 
 
695 aa  777    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  48.37 
 
 
723 aa  655    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 
721 aa  1493    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  56.2 
 
 
721 aa  793    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  47.58 
 
 
729 aa  654    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  51.04 
 
 
722 aa  722    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  50.55 
 
 
727 aa  728    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  55.22 
 
 
711 aa  762    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  49.1 
 
 
714 aa  700    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  49.01 
 
 
732 aa  696    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  55.83 
 
 
726 aa  830    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  49.58 
 
 
713 aa  709    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  53.31 
 
 
723 aa  756    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  57.24 
 
 
726 aa  833    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  52.45 
 
 
722 aa  737    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  53.26 
 
 
723 aa  780    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  46.87 
 
 
702 aa  665    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  49.44 
 
 
730 aa  697    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  50 
 
 
714 aa  702    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  55.01 
 
 
697 aa  766    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  51 
 
 
702 aa  736    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  57.47 
 
 
733 aa  826    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  73.65 
 
 
718 aa  1137    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  54.18 
 
 
730 aa  751    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  50.29 
 
 
729 aa  696    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  51.68 
 
 
703 aa  740    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  50.21 
 
 
724 aa  708    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  48.4 
 
 
724 aa  677    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  48.11 
 
 
729 aa  672    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  55.43 
 
 
699 aa  797    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  50.65 
 
 
695 aa  712    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  55.7 
 
 
725 aa  802    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  49.01 
 
 
727 aa  677    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  49.79 
 
 
697 aa  687    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  53.52 
 
 
695 aa  772    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  49.86 
 
 
714 aa  715    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  49.09 
 
 
697 aa  669    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  54.83 
 
 
701 aa  780    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  50.92 
 
 
697 aa  725    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  50.14 
 
 
724 aa  712    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  54.73 
 
 
725 aa  798    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  54.82 
 
 
723 aa  802    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  56.67 
 
 
726 aa  816    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  48.85 
 
 
696 aa  663    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  47.12 
 
 
728 aa  652    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  48.57 
 
 
706 aa  650    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  57.65 
 
 
727 aa  819    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  58.94 
 
 
717 aa  882    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  53.74 
 
 
695 aa  765    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  64.3 
 
 
734 aa  973    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  79.89 
 
 
716 aa  1220    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  51.06 
 
 
728 aa  712    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  52.73 
 
 
697 aa  754    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  54.57 
 
 
705 aa  777    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  43.21 
 
 
676 aa  575  1.0000000000000001e-162  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  43.16 
 
 
699 aa  560  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  39.54 
 
 
688 aa  514  1e-144  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  39.79 
 
 
716 aa  479  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  38.9 
 
 
688 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  31.25 
 
 
444 aa  72.4  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  40.91 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  32.95 
 
 
444 aa  70.5  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  30.11 
 
 
469 aa  69.7  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  31.03 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  26.2 
 
 
470 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  30.95 
 
 
439 aa  67  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  38.64 
 
 
443 aa  66.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  31.48 
 
 
444 aa  66.6  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  28.06 
 
 
469 aa  65.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  31.48 
 
 
444 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  33.12 
 
 
433 aa  65.9  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  30.86 
 
 
444 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  34.26 
 
 
450 aa  65.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  30.86 
 
 
444 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  30.86 
 
 
444 aa  65.1  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  30.86 
 
 
444 aa  65.1  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  30.86 
 
 
444 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  30.86 
 
 
444 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  30.86 
 
 
444 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  30.86 
 
 
444 aa  65.1  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  30.86 
 
 
444 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  41.11 
 
 
446 aa  65.1  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  25.33 
 
 
470 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1612  L-glutamine synthetase  33.12 
 
 
470 aa  64.3  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  39.33 
 
 
448 aa  63.9  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1766  glutamine synthetase catalytic region  31.1 
 
 
446 aa  63.9  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.98432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  25.86 
 
 
469 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  24.79 
 
 
439 aa  63.5  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  25.86 
 
 
469 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  28.49 
 
 
441 aa  63.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1318  glutamine synthetase  28.02 
 
 
469 aa  62.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  29.44 
 
 
473 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1790  type I glutamine synthetase  27.01 
 
 
490 aa  63.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  29.12 
 
 
469 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  27.37 
 
 
447 aa  62.8  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3154  glutamine synthetase, type I  31.25 
 
 
471 aa  62.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2657  glutamine synthetase catalytic region  31.21 
 
 
474 aa  63.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>