More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4424 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  56.2 
 
 		 721 aa  793    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  55.91 
 
 		 717 aa  782    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  47.14 
 
 		 722 aa  650    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  67.27 
 
 		 723 aa  1001    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  57.3 
 
 		 722 aa  818    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  56.27 
 
 		 734 aa  801    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  55.14 
 
 		 695 aa  780    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  55.97 
 
 		 716 aa  782    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  61.85 
 
 		 733 aa  917    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  49 
 
 		 712 aa  666    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  49.71 
 
 		 714 aa  687    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  51.65 
 
 		 730 aa  689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  61.64 
 
 		 726 aa  915    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  61.23 
 
 		 727 aa  909    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  61.9 
 
 		 723 aa  929    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 721 aa  1472    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  47.71 
 
 		 727 aa  662    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  54.09 
 
 		 701 aa  752    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  47.29 
 
 		 714 aa  647    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  61.85 
 
 		 726 aa  934    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  46 
 
 		 702 aa  651    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  53.59 
 
 		 695 aa  750    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  57.71 
 
 		 723 aa  839    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  49.43 
 
 		 697 aa  700    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  49.43 
 
 		 697 aa  645    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  55.29 
 
 		 695 aa  781    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  53.99 
 
 		 718 aa  764    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  52.65 
 
 		 705 aa  747    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  48.42 
 
 		 695 aa  669    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  54.09 
 
 		 724 aa  761    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  52.72 
 
 		 699 aa  761    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  46.78 
 
 		 724 aa  647    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  75.14 
 
 		 725 aa  1120    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  68.65 
 
 		 723 aa  1014    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  52.49 
 
 		 702 aa  729    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  53.22 
 
 		 697 aa  759    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  46.69 
 
 		 728 aa  662    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  55.38 
 
 		 695 aa  785    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  47.29 
 
 		 714 aa  654    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  51.93 
 
 		 729 aa  732    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  54.75 
 
 		 724 aa  783    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  75.14 
 
 		 725 aa  1137    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  47.59 
 
 		 727 aa  636    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  61.35 
 
 		 726 aa  919    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  55.56 
 
 		 730 aa  832    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  48.35 
 
 		 697 aa  698    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  49 
 
 		 713 aa  682    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  51.31 
 
 		 711 aa  709    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  49.86 
 
 		 703 aa  697    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  45.39 
 
 		 732 aa  635  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  45.75 
 
 		 729 aa  627  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  45.01 
 
 		 729 aa  628  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  46.59 
 
 		 723 aa  626  1e-178  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  44.92 
 
 		 728 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  47.85 
 
 		 696 aa  628  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  46.71 
 
 		 706 aa  615  1e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  47.35 
 
 		 697 aa  613  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  43.1 
 
 		 699 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  42.34 
 
 		 676 aa  549  1e-155  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  38.83 
 
 		 688 aa  456  1e-127  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  37.05 
 
 		 688 aa  457  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  36 
 
 		 716 aa  402  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1839  glutamine synthetase, type I  28 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  32.82 
 
 		 474 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  29.18 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  29.18 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  29.18 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  28.32 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  26.35 
 
 		 469 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  26.35 
 
 		 469 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  25.7 
 
 		 470 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3585  glutamine synthetase, type I  26.06 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1612  L-glutamine synthetase  29.91 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  28.82 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  27.99 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3834  L-glutamine synthetase  25.85 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  25.26 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  39.8 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0576  glutamine synthetase, type I  27.7 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1054  glutamine synthetase, type I  31 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  26.26 
 
 		 469 aa  67  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  25.35 
 
 		 470 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  26.79 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1108  L-glutamine synthetase  26.87 
 
 		 469 aa  66.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0181625  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  27.6 
 
 		 473 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  23.24 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  26.99 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  25.86 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  27.38 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  29.51 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  28.27 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  27.96 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1681  glutamine synthetase, type I  31.34 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000311602  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1022  L-glutamine synthetase  26.14 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  25.89 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  36.11 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  30.51 
 
 		 469 aa  63.5  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  26.29 
 
 		 469 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  32.47 
 
 		 443 aa  63.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4462  glutamine synthetase, type I  26.47 
 
 		 468 aa  63.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0756731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>