More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1252 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  53.95 
 
 		 695 aa  764    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  53.95 
 
 		 699 aa  736    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  51.94 
 
 		 695 aa  698    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  51.51 
 
 		 696 aa  708    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  48.97 
 
 		 722 aa  668    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  49.07 
 
 		 728 aa  674    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  51.15 
 
 		 697 aa  698    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  54.03 
 
 		 716 aa  746    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  50.48 
 
 		 723 aa  696    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  48.16 
 
 		 728 aa  657    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  50.56 
 
 		 727 aa  684    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  57.77 
 
 		 703 aa  806    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  50.21 
 
 		 714 aa  674    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  52.47 
 
 		 726 aa  725    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  52.37 
 
 		 697 aa  731    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  53.53 
 
 		 695 aa  735    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  49.18 
 
 		 723 aa  666    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  52.5 
 
 		 733 aa  725    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  48.84 
 
 		 730 aa  658    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  52.75 
 
 		 726 aa  724    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  46.51 
 
 		 732 aa  639    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  53.92 
 
 		 718 aa  733    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  53.23 
 
 		 717 aa  702    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  47.43 
 
 		 724 aa  659    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 711 aa  1477    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  54.29 
 
 		 734 aa  751    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  52.48 
 
 		 725 aa  723    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  50.36 
 
 		 714 aa  683    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  50.78 
 
 		 722 aa  684    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  50.43 
 
 		 713 aa  697    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  55.22 
 
 		 721 aa  762    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  53.8 
 
 		 695 aa  764    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  50.78 
 
 		 714 aa  679    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  51.49 
 
 		 712 aa  697    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  54.65 
 
 		 723 aa  749    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  51.03 
 
 		 730 aa  683    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  53.57 
 
 		 727 aa  705    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  52.76 
 
 		 725 aa  731    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  52.04 
 
 		 726 aa  710    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  51.44 
 
 		 697 aa  712    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  51.44 
 
 		 723 aa  705    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  49.86 
 
 		 706 aa  679    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  52.22 
 
 		 697 aa  701    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  51.87 
 
 		 702 aa  715    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  51.31 
 
 		 721 aa  709    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  52.59 
 
 		 697 aa  728    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  53.3 
 
 		 705 aa  733    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  56.59 
 
 		 701 aa  761    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  53.66 
 
 		 695 aa  761    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  46.86 
 
 		 729 aa  632  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  47.09 
 
 		 729 aa  629  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  46.98 
 
 		 702 aa  629  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  46.77 
 
 		 727 aa  627  1e-178  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  47.32 
 
 		 724 aa  625  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  46.58 
 
 		 723 aa  606  9.999999999999999e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  45.24 
 
 		 729 aa  606  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  45.57 
 
 		 724 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  43.15 
 
 		 676 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  43.4 
 
 		 699 aa  523  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  39.65 
 
 		 688 aa  485  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  38.28 
 
 		 688 aa  457  1e-127  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  39.86 
 
 		 716 aa  451  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  33.33 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3142  L-glutamine synthetase  37.1 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2715  glutamine synthetase, catalytic region  37.86 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.846118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  25.28 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1947  glutamine synthetase, type I  25.29 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  24.23 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  26.46 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  25.28 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  24.23 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  24.24 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  32.58 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  36.36 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1141  glutamine synthetase catalytic region  35.92 
 
 		 473 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  23.93 
 
 		 469 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  29.56 
 
 		 447 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  32.76 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  23.48 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  31.35 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  27.85 
 
 		 458 aa  62  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  25.25 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  26.95 
 
 		 473 aa  62  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  31.15 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  29.53 
 
 		 452 aa  62  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  31.15 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4462  glutamine synthetase, type I  24.38 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0756731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  23.48 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  30.52 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  31.98 
 
 		 448 aa  60.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1205  L-glutamine synthetase  31.05 
 
 		 473 aa  60.1  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.488763  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  30.77 
 
 		 473 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  23.48 
 
 		 469 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0149  glutamine synthetase, type I  27.69 
 
 		 470 aa  60.1  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  31.17 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1108  L-glutamine synthetase  28.49 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0181625  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  28.67 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2087  glutamine synthetase, type I  28.65 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  33.64 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09401  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  30.77 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>