More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1149 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  47.91 
 
 		 696 aa  650    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  52.72 
 
 		 697 aa  742    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  50 
 
 		 733 aa  714    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  49.14 
 
 		 729 aa  665    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  52.31 
 
 		 723 aa  731    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  47.34 
 
 		 728 aa  664    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  53.81 
 
 		 695 aa  768    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  47.86 
 
 		 706 aa  650    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  49.35 
 
 		 697 aa  707    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  50.43 
 
 		 713 aa  706    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  51.14 
 
 		 727 aa  713    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  51.03 
 
 		 711 aa  701    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  50.14 
 
 		 714 aa  703    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  53.81 
 
 		 695 aa  771    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  53.45 
 
 		 726 aa  756    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  49.5 
 
 		 703 aa  685    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  54.07 
 
 		 734 aa  746    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  51.45 
 
 		 723 aa  714    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  49.71 
 
 		 695 aa  681    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  49.86 
 
 		 722 aa  688    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  54.55 
 
 		 726 aa  782    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  49.44 
 
 		 721 aa  717    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  50.86 
 
 		 702 aa  714    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  51.29 
 
 		 717 aa  704    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  53.58 
 
 		 723 aa  763    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  51.15 
 
 		 718 aa  711    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  51 
 
 		 714 aa  719    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 730 aa  1517    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  52.81 
 
 		 725 aa  737    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  53.81 
 
 		 695 aa  749    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  48.93 
 
 		 724 aa  672    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  45.21 
 
 		 724 aa  636    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  54.74 
 
 		 727 aa  773    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  55.04 
 
 		 699 aa  788    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  51.22 
 
 		 716 aa  721    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  45.47 
 
 		 723 aa  637    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  51.65 
 
 		 721 aa  706    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  45.44 
 
 		 727 aa  644    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  52.44 
 
 		 695 aa  752    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  49.93 
 
 		 714 aa  702    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  47.66 
 
 		 724 aa  662    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  53.24 
 
 		 725 aa  749    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  50.56 
 
 		 722 aa  704    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  54.89 
 
 		 726 aa  782    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  50 
 
 		 723 aa  734    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  50.42 
 
 		 730 aa  709    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  51.85 
 
 		 712 aa  724    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  46.41 
 
 		 702 aa  648    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  51.87 
 
 		 697 aa  732    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  53.3 
 
 		 705 aa  755    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  55.24 
 
 		 701 aa  770    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  45.16 
 
 		 729 aa  635  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  44.98 
 
 		 728 aa  626  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  46.37 
 
 		 697 aa  627  1e-178  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  44.75 
 
 		 729 aa  619  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  44.91 
 
 		 697 aa  618  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  44.22 
 
 		 732 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  44.95 
 
 		 699 aa  558  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  40.93 
 
 		 676 aa  534  1e-150  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  37.93 
 
 		 688 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  38.16 
 
 		 688 aa  443  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  36.11 
 
 		 716 aa  439  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  29.56 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  34.03 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  29.56 
 
 		 431 aa  66.6  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  26.98 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  29.89 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  31.18 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  33.12 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  34.58 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  29.68 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  27.45 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  27.15 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  32.38 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  30.52 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  27.88 
 
 		 439 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2715  glutamine synthetase, catalytic region  36.36 
 
 		 476 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.846118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  27.56 
 
 		 461 aa  63.9  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  28.65 
 
 		 444 aa  63.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1141  glutamine synthetase catalytic region  34.34 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  29.07 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  27.63 
 
 		 454 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  34 
 
 		 443 aa  63.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  29.75 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  30.56 
 
 		 447 aa  62  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  26.6 
 
 		 448 aa  62  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  28.95 
 
 		 471 aa  62  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  26.59 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  31.54 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  25.82 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4462  glutamine synthetase, type I  26.3 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0756731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  28.41 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  28.49 
 
 		 446 aa  62  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  30.57 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  27.65 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2657  glutamine synthetase catalytic region  34.23 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  30.05 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  28.25 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  28.09 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  28.09 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>