More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1805 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  64.8 
 
 		 733 aa  1001    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  62.81 
 
 		 723 aa  947    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  49.29 
 
 		 695 aa  697    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  81.29 
 
 		 727 aa  1268    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  86.09 
 
 		 726 aa  1343    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  53.37 
 
 		 695 aa  761    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  53.7 
 
 		 705 aa  758    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  50.28 
 
 		 714 aa  716    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  49.01 
 
 		 722 aa  697    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  55.85 
 
 		 717 aa  807    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  50.86 
 
 		 697 aa  726    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  49.01 
 
 		 727 aa  697    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  45.71 
 
 		 732 aa  654    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  48.52 
 
 		 714 aa  695    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  49.16 
 
 		 713 aa  706    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  62.81 
 
 		 725 aa  942    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  74.66 
 
 		 726 aa  1160    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  46.07 
 
 		 702 aa  643    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  56.93 
 
 		 723 aa  883    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  53.79 
 
 		 695 aa  773    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  61.02 
 
 		 723 aa  921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  54.2 
 
 		 697 aa  789    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  47.52 
 
 		 727 aa  639    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  54.11 
 
 		 699 aa  786    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  47.86 
 
 		 697 aa  644    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  53.31 
 
 		 718 aa  786    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  57.1 
 
 		 734 aa  849    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  54.91 
 
 		 716 aa  794    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  52.04 
 
 		 711 aa  710    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  54.87 
 
 		 724 aa  804    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  50.64 
 
 		 703 aa  706    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  50.21 
 
 		 697 aa  673    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  52.54 
 
 		 729 aa  789    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  56.45 
 
 		 722 aa  850    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  54.89 
 
 		 730 aa  765    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  54.22 
 
 		 695 aa  778    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  53.06 
 
 		 702 aa  748    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  53.72 
 
 		 695 aa  780    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  49.01 
 
 		 714 aa  695    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  61.35 
 
 		 721 aa  919    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  71.27 
 
 		 730 aa  1106    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  53.57 
 
 		 724 aa  814    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  62.95 
 
 		 725 aa  967    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  56.67 
 
 		 721 aa  816    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 		 726 aa  1513    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  50.92 
 
 		 697 aa  711    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  63.64 
 
 		 723 aa  988    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  55.24 
 
 		 701 aa  779    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  48.3 
 
 		 696 aa  657    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  50 
 
 		 712 aa  710    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  45.09 
 
 		 729 aa  633  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  47.02 
 
 		 706 aa  632  1e-180  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  45.89 
 
 		 728 aa  633  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  45.31 
 
 		 723 aa  631  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  44.88 
 
 		 724 aa  619  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  43.62 
 
 		 729 aa  608  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  43.24 
 
 		 728 aa  588  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  43.58 
 
 		 699 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  41.95 
 
 		 676 aa  556  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  40.06 
 
 		 688 aa  504  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  36.62 
 
 		 688 aa  436  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  36.22 
 
 		 716 aa  409  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  31.21 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  26.84 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  25.54 
 
 		 439 aa  73.2  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  30.77 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  26.41 
 
 		 470 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  26.57 
 
 		 439 aa  72  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  36.94 
 
 		 447 aa  70.1  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  26.41 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  26.41 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  29.71 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  27.42 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  27.21 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  37.08 
 
 		 450 aa  67  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  28.66 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  27.11 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  27.11 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  27.11 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  25.65 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  26.6 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  30.13 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  28.73 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  25.54 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  25.65 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  29.51 
 
 		 446 aa  63.5  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 452 aa  63.9  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  29.73 
 
 		 442 aa  63.5  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  25.54 
 
 		 469 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  29.07 
 
 		 454 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0276  glutamine synthetase, type I  30.38 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00270748  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  30.41 
 
 		 469 aa  63.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  27.95 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  33.77 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  35.78 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  25.77 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1947  glutamine synthetase, type I  26.86 
 
 		 491 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3315  glutamine synthetase, type I  28.73 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>