More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0102 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  76.03 
 
 		 726 aa  1172    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  64.74 
 
 		 723 aa  972    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  49.5 
 
 		 712 aa  690    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  55.79 
 
 		 716 aa  803    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  73.18 
 
 		 727 aa  1129    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  55.38 
 
 		 699 aa  808    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  48.01 
 
 		 695 aa  703    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  60.09 
 
 		 734 aa  872    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  49.22 
 
 		 727 aa  687    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  54.6 
 
 		 701 aa  783    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  48.15 
 
 		 714 aa  671    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  48 
 
 		 696 aa  656    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  100 
 
 		 726 aa  1515    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  55.3 
 
 		 717 aa  809    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  50.64 
 
 		 714 aa  702    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  58.57 
 
 		 723 aa  882    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  47.86 
 
 		 706 aa  647    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  53.45 
 
 		 730 aa  737    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  54.48 
 
 		 697 aa  793    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  62.64 
 
 		 723 aa  954    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  61.85 
 
 		 721 aa  934    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  62.76 
 
 		 733 aa  979    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  47.17 
 
 		 727 aa  645    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  45.92 
 
 		 702 aa  649    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  54.09 
 
 		 718 aa  804    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  55.08 
 
 		 695 aa  797    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  56.89 
 
 		 722 aa  844    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  65.44 
 
 		 730 aa  1000    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  53.08 
 
 		 695 aa  768    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  53.14 
 
 		 729 aa  785    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  54.53 
 
 		 724 aa  810    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  46.94 
 
 		 724 aa  646    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  63.14 
 
 		 725 aa  944    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  53.64 
 
 		 705 aa  773    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  50.14 
 
 		 713 aa  702    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  47.64 
 
 		 697 aa  642    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  52.47 
 
 		 711 aa  725    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  55.83 
 
 		 721 aa  830    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  54.73 
 
 		 695 aa  804    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  48.5 
 
 		 714 aa  675    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  50.65 
 
 		 703 aa  714    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  51.29 
 
 		 697 aa  736    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  47.66 
 
 		 728 aa  666    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  45.97 
 
 		 732 aa  651    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  53.85 
 
 		 724 aa  808    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  54.94 
 
 		 695 aa  797    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  63.41 
 
 		 725 aa  966    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  74.66 
 
 		 726 aa  1160    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  51.43 
 
 		 702 aa  741    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  50.22 
 
 		 697 aa  685    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  64.51 
 
 		 723 aa  985    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  49.72 
 
 		 722 aa  684    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  51.35 
 
 		 697 aa  746    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  45.34 
 
 		 723 aa  632  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  45.35 
 
 		 729 aa  634  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  45.03 
 
 		 729 aa  627  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  44.04 
 
 		 728 aa  616  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  44.71 
 
 		 699 aa  580  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  41.31 
 
 		 676 aa  551  1e-155  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  40.61 
 
 		 688 aa  537  1e-151  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  38.9 
 
 		 688 aa  481  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  35.84 
 
 		 716 aa  429  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  26.44 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  26.44 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  27.85 
 
 		 439 aa  70.5  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  29.25 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  34.29 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  28.19 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  26.64 
 
 		 470 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  28.26 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  37.63 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  38.2 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  26.1 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  26.2 
 
 		 470 aa  67  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  30.95 
 
 		 452 aa  66.6  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1612  L-glutamine synthetase  27.57 
 
 		 470 aa  66.6  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  32.91 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  31.15 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  25.78 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  29.52 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  29.94 
 
 		 443 aa  63.5  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  29.75 
 
 		 446 aa  63.9  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  29.75 
 
 		 446 aa  63.9  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  38.89 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  28.04 
 
 		 445 aa  63.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  27.64 
 
 		 447 aa  63.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  30.47 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  32.35 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  31.54 
 
 		 448 aa  62  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  24.27 
 
 		 446 aa  62  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3585  glutamine synthetase, type I  25.85 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  28 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0149  glutamine synthetase, type I  29.41 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  30.77 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  26.07 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  24.19 
 
 		 446 aa  60.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  29.49 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  27.09 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1790  type I glutamine synthetase  21.89 
 
 		 490 aa  60.1  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>