More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3374 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  53.92 
 
 		 696 aa  774    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  53.21 
 
 		 723 aa  746    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  52.99 
 
 		 697 aa  749    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  51.07 
 
 		 697 aa  730    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  51 
 
 		 721 aa  736    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  47.16 
 
 		 732 aa  655    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  49.15 
 
 		 727 aa  694    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  50 
 
 		 714 aa  688    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  52.93 
 
 		 706 aa  753    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  51.43 
 
 		 726 aa  741    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  51.64 
 
 		 717 aa  729    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  49.36 
 
 		 723 aa  688    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  64.46 
 
 		 695 aa  953    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  53.04 
 
 		 727 aa  753    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  62.1 
 
 		 695 aa  922    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  49.02 
 
 		 712 aa  692    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  50.42 
 
 		 714 aa  705    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  51.85 
 
 		 726 aa  732    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  52.7 
 
 		 723 aa  732    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 702 aa  1454    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  50.65 
 
 		 702 aa  734    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  51.92 
 
 		 718 aa  738    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  51.87 
 
 		 711 aa  715    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  51.29 
 
 		 703 aa  739    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  50 
 
 		 713 aa  695    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  53 
 
 		 723 aa  750    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  50.86 
 
 		 730 aa  693    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  46.88 
 
 		 724 aa  650    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  47.67 
 
 		 729 aa  635    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  49.86 
 
 		 722 aa  705    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  46.02 
 
 		 728 aa  657    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  53.43 
 
 		 716 aa  753    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  46.1 
 
 		 729 aa  646    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  62.09 
 
 		 697 aa  927    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  61.35 
 
 		 695 aa  905    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  48.86 
 
 		 714 aa  676    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  48.01 
 
 		 730 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  54.12 
 
 		 734 aa  770    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  50.21 
 
 		 728 aa  705    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  47.08 
 
 		 724 aa  650    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  53.86 
 
 		 725 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  62.54 
 
 		 695 aa  923    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  53.06 
 
 		 726 aa  748    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  64.56 
 
 		 697 aa  959    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  58 
 
 		 697 aa  860    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  66.09 
 
 		 705 aa  963    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  61.93 
 
 		 701 aa  895    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  48.79 
 
 		 722 aa  689    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  55.57 
 
 		 695 aa  819    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  65.24 
 
 		 699 aa  962    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  53.79 
 
 		 733 aa  775    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  52.49 
 
 		 721 aa  729    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  53.63 
 
 		 725 aa  742    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  44.94 
 
 		 729 aa  632  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  47.22 
 
 		 724 aa  628  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  44.54 
 
 		 723 aa  616  1e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  44.32 
 
 		 676 aa  615  1e-175  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  44.84 
 
 		 727 aa  612  9.999999999999999e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  40.2 
 
 		 688 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  41.27 
 
 		 699 aa  538  1e-151  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  39.86 
 
 		 688 aa  484  1e-135  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  38.44 
 
 		 716 aa  465  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  34.97 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  30.52 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  39.56 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  30 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  39.53 
 
 		 453 aa  67  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  32.43 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  32.87 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  31.93 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  35.11 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  31.09 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  31.86 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  37.78 
 
 		 444 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  31.09 
 
 		 443 aa  63.9  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  36.36 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  32.43 
 
 		 444 aa  63.9  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  35.04 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  34.26 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  37.78 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  37.78 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  37.78 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  37.78 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  37.78 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  37.78 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  37.78 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  37.78 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  37.78 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  28.4 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  36.67 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  31.4 
 
 		 444 aa  62  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  34.09 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  32.43 
 
 		 443 aa  62  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  29.73 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  32.23 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  34.78 
 
 		 446 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  31.37 
 
 		 448 aa  60.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  36.05 
 
 		 448 aa  60.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  35.87 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  34.78 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>