More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2842 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  54.87 
 
 		 699 aa  777    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  49.43 
 
 		 696 aa  667    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  55.03 
 
 		 695 aa  776    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  50.42 
 
 		 722 aa  702    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  50.73 
 
 		 697 aa  680    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  55.52 
 
 		 733 aa  794    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  55.48 
 
 		 725 aa  800    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  54.23 
 
 		 697 aa  760    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  49.72 
 
 		 728 aa  697    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  54.66 
 
 		 697 aa  761    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  51.22 
 
 		 730 aa  701    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  49.37 
 
 		 727 aa  709    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  54.03 
 
 		 711 aa  746    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  50.14 
 
 		 714 aa  690    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  56.94 
 
 		 726 aa  803    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  55.79 
 
 		 726 aa  803    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  53.31 
 
 		 723 aa  761    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  51.5 
 
 		 713 aa  718    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  48.59 
 
 		 727 aa  667    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 716 aa  1481    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  55.62 
 
 		 723 aa  787    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  54.51 
 
 		 695 aa  783    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  63.47 
 
 		 734 aa  954    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  48.42 
 
 		 702 aa  663    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  55.97 
 
 		 727 aa  800    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  54.78 
 
 		 701 aa  764    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  48.37 
 
 		 728 aa  669    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  51.95 
 
 		 722 aa  736    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  74.65 
 
 		 718 aa  1149    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  53.43 
 
 		 702 aa  753    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  48.66 
 
 		 732 aa  686    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  54.18 
 
 		 723 aa  763    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  50 
 
 		 724 aa  709    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  51 
 
 		 695 aa  714    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  48.86 
 
 		 724 aa  657    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  49.72 
 
 		 697 aa  685    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  46.92 
 
 		 729 aa  661    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  54 
 
 		 705 aa  754    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  60 
 
 		 717 aa  853    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  53.2 
 
 		 730 aa  743    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  79.89 
 
 		 721 aa  1220    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  55.97 
 
 		 721 aa  782    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  49.5 
 
 		 706 aa  664    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  53.58 
 
 		 695 aa  765    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  50.5 
 
 		 714 aa  704    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  50 
 
 		 714 aa  698    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  50.65 
 
 		 729 aa  701    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  49.93 
 
 		 724 aa  712    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  55.3 
 
 		 725 aa  799    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  46.87 
 
 		 729 aa  665    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  54.91 
 
 		 726 aa  794    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  51.35 
 
 		 703 aa  719    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  51.34 
 
 		 712 aa  711    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  51.57 
 
 		 697 aa  721    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  54.91 
 
 		 723 aa  794    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  54.14 
 
 		 695 aa  776    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  45.74 
 
 		 723 aa  634  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  43.74 
 
 		 676 aa  562  1.0000000000000001e-159  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  42.19 
 
 		 699 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  39.77 
 
 		 688 aa  514  1e-144  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  38.86 
 
 		 716 aa  474  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  39.34 
 
 		 688 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  43.18 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  31.68 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  43.68 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  35.9 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  37.04 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  41.49 
 
 		 448 aa  69.7  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0141  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  30.17 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  28.74 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07731  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  30.17 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0667695 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  32.76 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  28 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  31.98 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  30.06 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1442  L-glutamine synthetase  31.82 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  35 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  37.25 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  39.81 
 
 		 469 aa  67  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1318  glutamine synthetase  29.95 
 
 		 469 aa  67  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1315  glutamine synthetase  29.95 
 
 		 469 aa  67  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  40.23 
 
 		 447 aa  67  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1766  glutamine synthetase catalytic region  33.33 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.98432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  38.24 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  27.37 
 
 		 474 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3154  glutamine synthetase, type I  31.31 
 
 		 471 aa  66.6  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  38.24 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  38.24 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  38.24 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  38.24 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  38.24 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  38.24 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  38.24 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  32.04 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1790  type I glutamine synthetase  26.64 
 
 		 490 aa  65.9  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  38.24 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  30.38 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  38.24 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  35.51 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3715  glutamine synthetase, type I  26.86 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>