More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13790 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  48.3 
 
 		 717 aa  658    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  47.67 
 
 		 702 aa  635    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  51.4 
 
 		 734 aa  723    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  54.55 
 
 		 723 aa  790    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  50.07 
 
 		 730 aa  734    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  46.74 
 
 		 722 aa  645    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  48.36 
 
 		 699 aa  670    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  46.98 
 
 		 727 aa  649    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  46.46 
 
 		 714 aa  636    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  53.14 
 
 		 726 aa  785    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  100 
 
 		 729 aa  1505    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  64.36 
 
 		 723 aa  1001    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  49.14 
 
 		 730 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  45.76 
 
 		 713 aa  645    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  53.66 
 
 		 725 aa  764    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  47.79 
 
 		 695 aa  658    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  51.72 
 
 		 727 aa  772    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  50.22 
 
 		 718 aa  691    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  47.93 
 
 		 695 aa  656    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  46.88 
 
 		 712 aa  650    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  72.93 
 
 		 724 aa  1112    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  45.74 
 
 		 724 aa  637    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  51.93 
 
 		 721 aa  732    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  46.31 
 
 		 714 aa  646    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  50.65 
 
 		 716 aa  701    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  46.25 
 
 		 728 aa  639    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  53.87 
 
 		 723 aa  778    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  50.29 
 
 		 721 aa  696    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  47.28 
 
 		 695 aa  644    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  45.69 
 
 		 714 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  47.34 
 
 		 701 aa  644    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  73.62 
 
 		 724 aa  1134    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  52.97 
 
 		 725 aa  773    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  52.54 
 
 		 726 aa  789    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  53.53 
 
 		 733 aa  791    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  53.3 
 
 		 723 aa  773    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  53.5 
 
 		 726 aa  799    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  63.85 
 
 		 722 aa  973    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  47.03 
 
 		 705 aa  641    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  46.03 
 
 		 729 aa  632  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  46 
 
 		 695 aa  634  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  47.23 
 
 		 697 aa  627  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  44.79 
 
 		 697 aa  625  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  44.46 
 
 		 728 aa  612  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  45.6 
 
 		 703 aa  612  9.999999999999999e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  45.18 
 
 		 697 aa  611  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  43.97 
 
 		 727 aa  605  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  45.24 
 
 		 711 aa  606  9.999999999999999e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  43.21 
 
 		 729 aa  603  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  44.87 
 
 		 695 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  43.99 
 
 		 732 aa  600  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  43.27 
 
 		 702 aa  595  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  43.54 
 
 		 723 aa  595  1e-168  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  46.09 
 
 		 696 aa  587  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  45.28 
 
 		 697 aa  582  1.0000000000000001e-165  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  44.46 
 
 		 697 aa  583  1.0000000000000001e-165  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  43.95 
 
 		 706 aa  557  1e-157  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  39.31 
 
 		 676 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  39.83 
 
 		 699 aa  500  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  36.26 
 
 		 688 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  36.58 
 
 		 688 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  35.67 
 
 		 716 aa  382  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  27.36 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  30.23 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  37.21 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  27.89 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  29.8 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  32.89 
 
 		 447 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  29.05 
 
 		 431 aa  63.5  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  30.77 
 
 		 461 aa  63.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  39.33 
 
 		 450 aa  63.9  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  26.5 
 
 		 447 aa  63.2  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  32.28 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1790  type I glutamine synthetase  27.04 
 
 		 490 aa  62  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  31.58 
 
 		 471 aa  62  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  29.76 
 
 		 446 aa  62  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  31.36 
 
 		 443 aa  62  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  29.76 
 
 		 446 aa  62  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  30.63 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  43.01 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  33.54 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  32.28 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  26 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  29.51 
 
 		 445 aa  60.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  31.29 
 
 		 455 aa  60.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  37.5 
 
 		 444 aa  60.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  29.89 
 
 		 455 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  31.58 
 
 		 454 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  30.92 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  29.02 
 
 		 448 aa  59.7  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  27.74 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  39.29 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  27.21 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  38.37 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  27.91 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  34.78 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  32.17 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  26.44 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  28.38 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  27.6 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>